| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 626429 = | 76 (0.860) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 6.6% | coding (99/816 nt) | mtfA | glucose‑regulated peptidase |
| ? | NC_002947 | 626468 = | 69 (0.810) | coding (60/816 nt) | mtfA | glucose‑regulated peptidase | |||||
CGCTGCTCGTCGTCCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAATCATCGGCACCAGCGACAG > NC_002947/626319‑626616 | cgcTGCTCGTCGTCCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCtgt < 1:703199/150‑1 (MQ=255) gctgctCGTCGTCCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCtgtg > 1:2277668/1‑150 (MQ=255) gctgctCGTCGTCCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCtgtg < 2:2277668/150‑1 (MQ=255) gcctgggccgtacggccaaggctcactgaacaggtaaagaacgaacggcatgtggtcattcagcgcctggcggcgcaagcgtactctggcgcgttacccgatcacgccaCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCtgtg > 1:2371468‑M1/110‑150 (MQ=255) tgctCGTCGTCCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCCTTCTCGG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGc < 1:2371917/150‑1 (MQ=255) tgctCGTCGTCCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGc < 2:387/150‑1 (MQ=255) gctCGTCGTCCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCg > 1:1790007/1‑150 (MQ=255) ctCGTCGTCCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGAGCAGTAGG‑GCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCga > 2:2371917/1‑149 (MQ=255) gtcgtcCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGCAGAGAAAGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGAt < 1:543598/150‑1 (MQ=255) tcgtcCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATc < 1:928988/150‑1 (MQ=255) gtcCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCgg < 2:40089/150‑1 (MQ=255) gtcCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCgg < 2:2309288/150‑1 (MQ=255) aGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTaa > 1:400390/1‑150 (MQ=255) caaggctcactgaacaggtaaagaacgaacggcatgtggtcattcagcgcctggcggcgcaagcgtactctggcgcgttacccgatcacgccacagcattggcagccgctcgcgtacggcctgccattgctgTGGCGTGATCGGGTAAcg > 2:445870‑M2/133‑150 (MQ=255) gACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACgcgc > 1:2051002/1‑150 (MQ=255) ggctcactgaacaggtaaagaacgaacggcatgtggtcattcagcgcctggcggcgcaagcgtactctggcgcgttacccgatcacgccacagcattggcagccgctcgcgtacggcctgccattgctgTGGCGTGATCGGGTAACgcgc < 1:445870‑M2/21‑1 (MQ=255) acCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCag > 1:301138/1‑150 (MQ=255) acCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCag > 2:1606749/1‑150 (MQ=255) 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gAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCagag < 2:934318/119‑1 (MQ=255) aCAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACcaca > 2:617628/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCcgt > 2:1390260/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCcgt > 2:1390140/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCcgt > 1:1319865/1‑150 (MQ=255) 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gCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAAt > 2:936176/1‑83 (MQ=255) g‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCCGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCaa > 1:1231428/1‑150 (MQ=255) g‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCaa < 2:1151292/150‑1 (MQ=255) aggccgtacgcgagcggctgccaatgctgTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAAt > 1:1161497‑M2/30‑81 (MQ=255) aggccgtacgcgagcggctgccaatgctgTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAAt < 2:1161497‑M2/52‑1 (MQ=255) ccGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAg < 1:2198611/150‑1 (MQ=255) gCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGcc < 2:1790007/150‑1 (MQ=255) gCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGcc < 1:617628/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCCATTGCTGTGGCGTGCTAGGGTGCCCAGGCAGATGACTCTTGCG‑CCGCCATTCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCCGCAAGCCGAGAatcatc < 2:1231428/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAatcatc > 1:2197910/1‑150 (MQ=255) cTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAATCATCGGc > 2:2049025/1‑150 (MQ=255) gCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTAc < 2:732017/110‑1 (MQ=255) gCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTAc > 1:732017/1‑110 (MQ=255) gCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAATCATCGGCAc > 2:2222912/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCTTTCGTTCTTTACCTGTTCGGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAATCATCGGCACCAGc > 1:816159/1‑150 (MQ=255) gctgTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAATCATCGGCACCAGCGa < 1:1055312‑M2/146‑1 (MQ=255) ctgTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACgca > 2:2399358‑M2/4‑121 (MQ=255) ctgTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACgca < 1:2399358‑M2/118‑1 (MQ=255) tgTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCTGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCGGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAATCATCGGCACCAGCGACa > 1:1055114‑M2/3‑150 (MQ=255) tgTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAATCATCGGCACCAGCGACa < 2:2051002‑M2/148‑1 (MQ=255) gTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAATCATCGGCACCAGCGACAg < 1:692635‑M2/149‑1 (MQ=255) | CGCTGCTCGTCGTCCAGCTCGACACCGGGCAGGCAGGTGAGGTGCTTGTCGAGCAGGAACAGGATGCAGGCTTCGCGCAGCCAGCGGTCTTCAGCGTCGCTGATGCCGTCCAGCATTGGCAG‑CCGCTCGCGTACGGCCTGCCATTGCTGTGGCGTGATCGGGTAACGCGCCAGAGTACGCTTGCG‑CCGCCAGGCGCTGAATGACCACATGCCGTTCGTTCTTTACCTGTTCAGTGAGCCTTGGCCGTACGGCCCAGGCGCCCACGCAGCAAGCCGAGAATCATCGGCACCAGCGACAG > NC_002947/626319‑626616 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |