| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 717400 | 76 (0.860) | 8 (0.100) | 7/232 | NT | 9.8% | coding (65/1098 nt) | thiO | FAD‑dependent glycine/D‑amino acid oxidase |
| ? | NC_002947 | = 717411 | 75 (0.900) | coding (76/1098 nt) | thiO | FAD‑dependent glycine/D‑amino acid oxidase | |||||
CGCACTGTTGGGGAAGTTGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCGCAGGACTTTTATCCACAGCTGGGC > NC_002947/717262‑717560 | cgcacTGTTGGGGAAGTTGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCg < 1:750782/150‑1 (MQ=255) cTGTTGGGGAAGTTGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGgcca > 1:895445‑M2/1‑146 (MQ=255) tGGGGAAGTTGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAggtg > 1:1961520/1‑150 (MQ=255) gggAAGTTGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAggtggt > 1:1323643/1‑150 (MQ=255) ggAAGTTGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAggtggtg < 2:1571974/150‑1 (MQ=255) aaGTTGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAggtggtg‑gt < 2:1961520/150‑1 (MQ=255) ttGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAggtggtg > 2:2095352/1‑145 (MQ=255) ttGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAggtggtg < 1:2095352/145‑1 (MQ=255) gctCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCa > 2:1222474/3‑150 (MQ=255) ttCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAg > 1:93281/1‑150 (MQ=255) ttCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAg > 2:1885956/1‑150 (MQ=255) tCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGGCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAgg < 1:1123124/150‑1 (MQ=255) cccGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTg > 1:1462979/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGa > 2:2237369/1‑135 (MQ=255) ccGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGa < 1:2237369/135‑1 (MQ=255) cATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCgaga < 1:2312189/150‑1 (MQ=255) tCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAgt > 1:687213/1‑150 (MQ=255) gcgGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAggtggtg‑gt > 2:1990716/1‑119 (MQ=255) gcgGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAggtggtg‑gt < 1:1990716/119‑1 (MQ=255) 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gtagtGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGCTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTgg > 2:1226373/1‑150 (MQ=255) gtggtgGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTgg > 1:1849162/1‑116 (MQ=255) gtggtgGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTgg < 2:1849162/116‑1 (MQ=255) tggtggTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCt > 2:2124713/1‑150 (MQ=255) ggtTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAg < 1:1222474/150‑1 (MQ=255) ggcggGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGTCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCccgcc < 1:148903/150‑1 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gCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCGCAGGACTTTTAt > 2:2403828/1‑150 (MQ=255) gCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCGCAGGACTTTTATCca < 2:687213/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCGCAGGACTTTTATCca > 2:1080073/1‑150 (MQ=255) gCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCGCAGGACTTTTATCca < 1:437756/150‑1 (MQ=255) ccAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCGCAGGACTTTTATCcac > 2:1800473/1‑150 (MQ=255) aaGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCGCAGGACTTTTATCCACAg < 2:1462979/150‑1 (MQ=255) aaGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCGCAGGACTTTTATCCACAg > 1:2168010/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGtt > 2:686415/1‑77 (MQ=255) ggCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGtt < 1:686415/77‑1 (MQ=255) ggCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCTCAGGACTTTTATCCCCAGCTGGGc < 2:93281/150‑1 (MQ=255) | CGCACTGTTGGGGAAGTTGAAGGTTCAATGATGCCCGGTGCATCGCGGTTTTACTTCAGGTGTTGGATCGACAGATGAGCAAGCAAGTAGTGGTGGTTGGCGGCGGGGTGATCGGCCTGCTGACGGCATTCAACCTGGCAGCCAAGGTCGGCCAGGTGGTG‑GTGTGCGATCAGGGCGAGGTTGGCCGAGAGTCGTCCTGGGCTGGCGGAGGCATTGTCTCGCCGTTGTACCCGTGGCGCTACAGCCCCGCCGTGACCGCTCTGGCGCACTGGTCGCAGGACTTTTATCCACAGCTGGGC > NC_002947/717262‑717560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |