New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1225143 | 74 (0.840) | 4 (0.050) | 4/236 | NT | 5.4% | coding (288/747 nt) | gltJ | glutamate/aspartate ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 1225156 | 69 (0.810) | coding (275/747 nt) | gltJ | glutamate/aspartate ABC transporter permease |
CCTGGCCTTTGGGCAGCGCCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGCGC > NC_002947/1225007‑1225304 | ccTGGCCTTTGGGCAGCGCCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTGCTGCAAGCCTTCTGgca > 1:1550262/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGGGCAGCGCCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAgcag < 1:272901‑M2/150‑5 (MQ=255) gcCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATAAGCTCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCGTGCAAGCATTCTGGAAGCAGGTCCGGTACCAgg > 1:1964733/1‑150 (MQ=255) ccTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGa < 2:272901/150‑1 (MQ=255) cTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGaa > 1:2075581/1‑150 (MQ=255) cTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGaa < 2:1120425/150‑1 (MQ=255) tGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAg > 2:849575/1‑150 (MQ=255) ggAGACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGGGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGAAGGTCCGGTACCAGGAAGt < 2:893359/150‑1 (MQ=255) aTACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTAc < 1:1066402/150‑1 (MQ=255) aCCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCa < 2:2075581/150‑1 (MQ=255) ccGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAg < 1:396552/150‑1 (MQ=255) cGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGa > 2:410556/1‑150 (MQ=255) cGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGa > 1:840022/1‑150 (MQ=255) cGGTACACACTTTCTCACACACTCGCGCCGCTTTAAACACGCCCAGTCATATGACCACGCTTATCAGCGCCGAAGTGATCGTGTTGAGGTCCTTCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTTGCAGCAGATCCGGTACCAGGAAGTACCAGa < 2:965749/150‑1 (MQ=255) gTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAg > 2:557728/1‑137 (MQ=255) gTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAg < 1:557728/137‑1 (MQ=255) tACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGa > 1:1838634/1‑150 (MQ=255) cACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAg > 1:381690/1‑150 (MQ=255) cACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGACAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAg > 1:939800/1‑150 (MQ=255) aCTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGt > 1:40495/1‑150 (MQ=255) ttGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGCTGAAGCGTTAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTg > 1:1353754/1‑150 (MQ=255) tGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGc < 1:455337/150‑1 (MQ=255) cTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCAc < 2:381690/150‑1 (MQ=255) tCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCAcc > 1:579475/1‑150 (MQ=255) tCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCAcc > 2:992523/1‑150 (MQ=255) acaGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGTTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTGGCCACAGCAGGTCCGGTACGAGTAAGTACCAGATGAACAGTTGCACcag > 2:674947/1‑150 (MQ=255) acaGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTg > 1:2302450/1‑144 (MQ=255) acaGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTg < 2:2302450/144‑1 (MQ=255) cggTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGc > 1:1557270/1‑150 (MQ=255) aCAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAg < 1:1294394/103‑1 (MQ=255) aCAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAg > 2:1294394/1‑103 (MQ=255) cAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTg < 1:2176824/134‑1 (MQ=255) cAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTg > 2:2176824/1‑134 (MQ=255) ggCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGtt < 2:579475/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCAc > 2:1115184/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCAc < 2:1521595/150‑1 (MQ=255) gCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTa > 1:1986227/1‑150 (MQ=255) gcACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTgg > 2:1657764/2‑150 (MQ=255) ccACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTgg > 2:1135676/1‑150 (MQ=255) cACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGc > 2:2096337/1‑150 (MQ=255) aCGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCa > 1:1560952/1‑82 (MQ=255) aCGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCa < 2:1560952/82‑1 (MQ=255) aCGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGcg > 2:225886/1‑150 (MQ=255) gCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGcgat > 2:2165880/1‑150 (MQ=255) tGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCg > 2:2362510/1‑72 (MQ=255) tGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCg < 1:2362510/72‑1 (MQ=255) ttaggcgcAGCAGTGGTCTGGTTGGCTTCATACTTCAGCCATTCCTACAGGTCGTCTGTCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGcgataccc < 2:263797/146‑1 (MQ=255) aTCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGcgataccc < 2:1964733/150‑1 (MQ=255) aTCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGcgataccc > 1:2144865/1‑150 (MQ=255) gcCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGcgatacccgatacc > 2:1853648/1‑150 (MQ=255) ccGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCa < 1:1115184/150‑1 (MQ=255) cGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAg < 2:2314371/150‑1 (MQ=255) gTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTc < 2:1838634/150‑1 (MQ=255) gTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTc < 2:1986227/150‑1 (MQ=255) tCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTcg > 1:1011659/1‑150 (MQ=255) gggTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTcggt < 1:2165880/150‑1 (MQ=255) tGAGGTCCTGCTTGAACCATCCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCAACAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGCATGTACCCGATACCAGGCGGTTcggtacgg < 1:674947/150‑1 (MQ=255) aGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTcggtacggta > 2:684214/1‑150 (MQ=255) ggTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGaa < 1:522203/97‑1 (MQ=255) ggTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGaa > 2:522203/1‑97 (MQ=255) gCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGa < 1:1135676/150‑1 (MQ=255) aaCCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCa > 1:69946/1‑50 (MQ=255) aaCCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCa < 2:69946/50‑1 (MQ=255) cATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAgcaggaatggttcaagcaggacctcaacccgaccacttcggcgctgatcagcgtggtcatctgcctgg > 1:1737757‑M2/1‑22 (MQ=255) cATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAgcaggaatggttcaagcaggacctcaacccgaccacttcggcgctgatcagcgtggtcatctgcctgg < 2:1737757‑M2/90‑69 (MQ=255) cATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTcg < 1:1591252/127‑1 (MQ=255) cATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTcg > 2:1591252/1‑127 (MQ=255) cATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCgagg > 2:2028176/1‑150 (MQ=255) aTTCCTGCAAGCCTTCTGGCAgcaggaatggttcaagcaggacctcaacccgaccacttcggcgctgatcagcgtggtcatctgcctgggcctgttcacc > 1:1652521‑M2/1‑21 (MQ=255) aTTCCTGCAAGCCTTCTGGCAgcaggaatggttcaagcaggacctcaacccgaccacttcggcgctgatcagcgtggtcatctgcctgggcctgttcacc < 2:1652521‑M2/100‑80 (MQ=255) aTTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCgagga < 2:939800/150‑1 (MQ=255) aTTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCgagga < 1:225886/150‑1 (MQ=255) aTTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTACGGAAGAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGCTACCCGATACCAGGCGCTTCGGTACGGGACGCATGACACCgagga > 1:420045/1‑150 (MQ=255) tGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACGAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGAc > 2:1437371/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACTTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCcagcag > 2:145129/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCcagcag < 1:178291/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGTATGAAACCGAGGAGCGACCCcagcagca < 2:1353754/150‑1 (MQ=255) cagcagGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAgcgc > 2:470790/1‑150 (MQ=255) | CCTGGCCTTTGGGCAGCGCCTGGATACCGGTACGCACTTGCTCACAGACGCGCGCGGCGGTGAACAGGCCCAGGCAGATGACCACGCTGATCAGCGCCGAAGTGGTCGGGTTGAGGTCCTGCTTGAACCATTCCTGCAAGCCTTCTGGCAGCAGGTCCGGTACCAGGAAGTACCAGATGAACAGTTGCACCAGCAGTGGCACGTTGCGGAACAGTTCCACGTAGGCGGTGGCGATACCCGATACCAGGCGGTTCGGTACGGTACGCATGACACCGAGGAGCGACCCCAGCAGCAGCGC > NC_002947/1225007‑1225304 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |