New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1443135 | 37 (0.420) | 10 (0.140) | 9/196 | NT | 22.4% | intergenic (‑66/+110) | ghrB/PP_1262 | 2‑ketoaldonate reductase/hydroxypyruvate/glyoxylate reductase/LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1443153 | 40 (0.570) | intergenic (‑84/+92) | ghrB/PP_1262 | 2‑ketoaldonate reductase/hydroxypyruvate/glyoxylate reductase/LysR family transcriptional regulator |
TCTTGCTGCAGGCGTTCGGCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCAGGTCTGCCTCATGCGCGGCA > NC_002947/1443005‑1443296 | tCTTGCTGCAGGCGTTCGGCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTg < 1:2262909‑M2/150‑2 (MQ=255) tCTTGCTGCAGGCGTTCGGCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTg < 1:270674‑M2/150‑2 (MQ=255) gcagacctgaaaacccatcaggtgctgatcgccaactaaaaagctgctgcaatgcgggggcggacaatggtaggttgctaaccattgatttcgcctgttccggcaCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGt < 2:1344480‑M1/45‑1 (MQ=255) agacctgaaaacccatcaggtgctgatcgccaactaaaaagctgctgcaatgcgggggcggacaatggtaggttgctaaccattgatttcgcctgttccggcaCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAg > 2:144115‑M1/104‑150 (MQ=255) gcAGGCGTTCGGCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagc > 1:2228311‑M2/1‑142 (MQ=255) gaaaacccatcaggtgctgatcgccaactaaaaagctgctgcaatgcgggggcggacaatggtaggttgctaaccattgatttcgcctgttccggcaCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCgg > 2:614298‑M1/98‑150 (MQ=255) gaaaacccatcaggtgctgatcgccaactaaaaagctgctgcaatgcgggggcggacaatggtaggttgctaaccattgatttcgcctgttccggcaCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCgg > 2:2097205‑M1/98‑150 (MQ=255) gaaaacccatcaggtgctgatcgccaactaaaaagctgctgcaatgcgggggcggacaatggtaggttgctaaccattgatttcgcctgttccggcaCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCgg > 1:1344480‑M1/98‑150 (MQ=255) aGGCGTTCGGCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgg > 2:2262909‑M2/1‑140 (MQ=255) ggCGTGCGGCCATGCCCGGGGTGATACGGGTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcggg > 1:1297429‑M2/1‑139 (MQ=255) aaaacccatcaggtgctgatcgccaactaaaaagctgctgcaatgcgggggcggacaatggtaggttgctaaccattgatttcgcctgttccggcaCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCggg > 1:1061832‑M1/97‑150 (MQ=255) gCGTTCGGCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggc < 2:1177024‑M2/150‑13 (MQ=255) gTTCGGCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggctt > 1:1578973‑M2/1‑136 (MQ=255) cGGCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGAGGTGCCTTgtaggagcgtacttgcc > 2:1241203‑M2/1‑133 (MQ=255) atcaggtgctgatcgccaactaaaaagctgctgcaatgcgggggcggacaatggtaggttgctaaccattgatttcgcctgttccggcaCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCggg < 2:1852300‑M1/54‑1 (MQ=255) atcaggtgctgatcgccaactaaaaagctgctgcaatgcgggggcggacaatggtaggttgctaaccattgatttcgcctgttccggcaCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCggg > 1:1852300‑M1/90‑143 (MQ=255) gCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccg < 1:812358‑M2/150‑20 (MQ=255) cATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcggg > 1:711377‑M2/1‑129 (MQ=255) cATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcggg < 2:711377‑M2/140‑12 (MQ=255) aTGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcga < 1:1040036‑M2/150‑23 (MQ=255) aTGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcga < 1:1040121‑M2/150‑23 (MQ=255) ggCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcgaag > 2:1997535‑M2/1‑126 (MQ=255) ggCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAAGGCACCGCGCCCCCCCgtaggagcgggcttgcccgcgaag > 1:1320895‑M2/1‑126 (MQ=255) ggCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcggg > 1:1510268‑M2/1‑112 (MQ=255) ggCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcggg < 2:1510268‑M2/123‑12 (MQ=255) ggCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGc < 1:1177024/150‑1 (MQ=255) tGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGaa < 2:812358/150‑1 (MQ=255) tGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGaa > 1:240417/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGaa > 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ttCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGAAAGCTAGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGcccc > 2:33123/1‑150 (MQ=255) tGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTAc > 2:1735777/1‑132 (MQ=255) tGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTAc < 1:1735777/132‑1 (MQ=255) tGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGACAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTTCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCTCCCCCGCAt > 1:370640/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGACATCAATGGTTATCAACCTACCAGTGTCCGCCCCCGCAtt > 1:1899478/1‑150 (MQ=255) 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ccGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcgaagggaccagcacagccccaccccgccttgcagagaagttgcccgat < 2:1121164‑M2/96‑69 (MQ=255) ccGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcgaagggaccagcacagccccaccccgccttgcagagaagttgcccgat > 1:1121164‑M2/1‑28 (MQ=255) ccGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcgaagggaccagcacagccccaccccgccttgca > 2:423431‑M2/1‑28 (MQ=255) ccGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcgaagggaccagcacagccccaccccgccttgca < 1:423431‑M2/81‑54 (MQ=255) CCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGTAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTc < 1:134958‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGc < 1:91534‑M1/66‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGc > 2:91534‑M1/1‑66 (MQ=255) cGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcgaagggaccagcacagccccaccccgccttgcagagaagttgcccgatgaaaaagaccgtcctggccttcagccgtatcaccccggccatggccgaacgcctg < 1:671299‑M2/150‑124 (MQ=255) CGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTATTCa < 2:1209482‑M1/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcggactagcccgggaagggcaaagcacagccccaccccgccttgcagagaagttgcccgatgaaaaagaccgtcctggccttcagccgtatcaccccggccatggccgaacgcctgc < 2:1892265‑M2/150‑125 (MQ=255) GCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCAg > 2:240417‑M1/1‑150 (MQ=255) GCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCAg > 2:1182997‑M1/1‑150 (MQ=255) TCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATgg > 2:2150041‑M1/1‑140 (MQ=255) TCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATgg < 1:2150041‑M1/140‑1 (MQ=255) TCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCAGGt < 1:2193660‑M1/150‑1 (MQ=255) tACGGGGGGGCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcgaagggaccagcacagccccaccccgccttgcagagaagttgcccgatgaaaaagaccgtcctggccttcagccgtatcaccccggccatggccgaacgcctgcagcaa < 1:192133‑M2/150‑130 (MQ=255) ACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCAGGTCTGc > 1:1694690‑M1/1‑150 (MQ=255) gggggggCGCGGTGCCTTgtaggagcgggcttgcccgcgaagggaccagcacagccccaccccgccttgcagagaagttgcccgatgaaaaagaccgtcctggccttcagccgtatcaccccggccatggccgaacgcctgcagcaagac < 2:1259186‑M2/150‑133 (MQ=255) cgcgGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCAGGTCTGCCTCATgcgc < 2:1107251/150‑1 (MQ=255) gcgGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCa < 1:1139376/73‑1 (MQ=255) gcgGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCa > 2:1139376/1‑73 (MQ=255) gTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCa < 1:1094702/130‑1 (MQ=255) gTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCa > 2:1094702/1‑130 (MQ=255) gTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCAGGTCTGCCTCATGCGCGGCa > 1:2186000/1‑150 (MQ=255) | TCTTGCTGCAGGCGTTCGGCCATGGCCGGGGTGATACGGCTGAAGGCCAGGACGGTCTTTTTCATCGGGCAACTTCTCTGCAAGGCGGGGTGGGGCTGTGCTGGTCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGGGGGGCGCGGTGCCTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGTGCCGGAACAGGCGAAATCAATGGTTAGCAACCTACCATTGTCCGCCCCCGCATTGCAGCAGCTTTTTAGTTGGCGATCAGCACCTGATGGGTTTTCAGGTCTGCCTCATGCGCGGCA > NC_002947/1443005‑1443296 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |