| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 1448707 = | 97 (1.100) | 6 (0.070) | 4/236 | NT | 6.2% | coding (420/861 nt) | PP_1266 | fusaric acid resistance protein |
| ? | NC_002947 | 1448777 = | 88 (1.040) | coding (490/861 nt) | PP_1266 | fusaric acid resistance protein | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TTCCAAGGAAAACCGCGACGACGCCAGCAACATCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGCAGATGATGAGC > NC_002947/1448632‑1448926 | ccagaacgaattctcgtcgaccaccgccgtcaccgcttcaccggtacgcgcatagtcgcccttgtggatattcagGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGaa < 1:2050238‑M1/75‑1 (MQ=255)ccagaacgaattctcgtcgaccaccgccgtcaccgcttcaccggtacgcgcatagtcgcccttgtggatattcagGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGaa < 1:1468789‑M1/75‑1 (MQ=255) gaacgaattctcgtcgtccaccgccgtccacgctgctccattacgtgcatagtctcccttgtggatattcagGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAatat > 2:1468789‑M1/73‑150 (MQ=255) gaacgaattctcgtcgaccaccgccgtcaccgcttcaccggtacgcgcatagtcgcccttgtggatattcagGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAatat > 2:2050238‑M1/73‑150 (MQ=255) aaGGAAAACCGCGACGACGCCAGCAACATCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATc < 1:1123929/150‑1 (MQ=255) aGGAAATCCGCAACGATGCCAGCAAAATCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATcc < 2:783673/150‑1 (MQ=255) aCCGCGACGACGCCAGCAACATCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAgg < 1:10418/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAACATCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCACGCGTACGCACATCGTGGCGACGGGTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATgcg > 1:2090397/1‑150 (MQ=255) cATCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACATGTCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACTGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCgg < 1:987457/150‑1 (MQ=255) cATCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCgg > 1:841080/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGt < 2:85582/150‑1 (MQ=255) tCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTg > 1:2178307/1‑150 (MQ=255) tCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGCGCGACTATCAGCGTACCGGta > 2:137641/1‑149 (MQ=255) aaTTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTCGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCg < 2:66129/150‑1 (MQ=255) aTTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCgg > 1:1619714/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGt < 2:1702624/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGt < 2:1441760/150‑1 (MQ=255) cccAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTg > 1:554506/1‑146 (MQ=255) 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aacaaGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACgaga < 2:111618/150‑1 (MQ=255) acaaGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGaa > 2:741439/1‑150 (MQ=255) gCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGt < 1:1146507/125‑1 (MQ=255) gCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCg > 1:819931/1‑150 (MQ=255) cccTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCcac > 1:1991997/1‑92 (MQ=255) cccTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCcac < 2:1991997/92‑1 (MQ=255) cccTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGt > 1:1619319/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACAGCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGtt < 2:841080/150‑1 (MQ=255) atattcaggttggtcacatagccgtcaaccgtcgccacgatgtgcgtacgcttgaggttcagctcggctgcggccaacCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGACGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTc > 2:2050238‑M2/79‑150 (MQ=255) ttGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCg > 2:2179049/1‑146 (MQ=255) ttGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCg < 1:2179049/146‑1 (MQ=255) 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ggCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGaa > 1:387516/1‑150 (MQ=255) cTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAAtt > 2:15423/1‑150 (MQ=255) aTGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGc < 2:2172487/150‑1 (MQ=255) aTGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGc > 1:447337/1‑150 (MQ=255) aTGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGc < 2:819931/150‑1 (MQ=255) tgtgACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGCa < 1:1307655/150‑1 (MQ=255) tgtgACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGCa < 2:291203/150‑1 (MQ=255) tgtgACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGCa > 2:1067685/1‑150 (MQ=255) gACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAggt > 1:314780/1‑126 (MQ=255) gACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAggt > 1:315142/1‑126 (MQ=255) gACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAggt < 2:315142/126‑1 (MQ=255) aCCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCt > 1:238057/1‑79 (MQ=255) aCCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCt < 2:238057/79‑1 (MQ=255) ccaacCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAggt < 1:2317412‑M2/119‑1 (MQ=255) caacCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGc < 2:396858‑M2/106‑1 (MQ=255) cTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTgg > 2:2403782/1‑75 (MQ=255) cTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGCAGATGATGAgc > 2:1483173/1‑150 (MQ=255) cTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCCgg < 1:2403782/75‑1 (MQ=255) cTGAATACCCACAAGAGCGACTATGCCCGTACCGGTGCAGCGGGGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTGCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGCAGATGATGAgc < 1:137641/150‑1 (MQ=255) | TTCCAAGGAAAACCGCGACGACGCCAGCAACATCGCCAATTCCGCCCAAGCCGATTATCAACAAGCCCTTGCCGAGTTGGCCGCAGCCGAGCTGAACCTCAAGCGTACGCACATCGTGGCGACGGTTGACGGCTATGTGACCAACCTGAATATCCACAAGGGCGACTATGCGCGTACCGGTGAAGCGGTGATGGCGGTGGTCGACGAGAATTCGTTCTGGGTTTACGGGTTCTTCGAGGAGACCAAGCTGCCGCATGTGAAGGTGGGTGACCAGGCCGAATTGCAGATGATGAGC > NC_002947/1448632‑1448926 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |