New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1944558 | 83 (0.940) | 4 (0.050) | 4/234 | NT | 5.0% | intergenic (+16/+246) | actP‑I/PP_1744 | acetate permease/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1944594 | 73 (0.870) | intergenic (+52/+210) | actP‑I/PP_1744 | acetate permease/hypothetical protein |
ACAAGTCCAAGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGATGGCAACCGGG > NC_002947/1944445‑1944743 | aCAAGTCCAAGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTc > 2:1079905/1‑150 (MQ=255) aCAAGTCCAAGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTc < 2:1885356/150‑1 (MQ=255) cAAGTCCAAGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCa > 2:1682436‑M2/1‑149 (MQ=255) cAAGTCCAAGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCa > 2:1934558‑M2/1‑149 (MQ=255) tCCAAGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAACCGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCatgca < 1:11964‑M2/150‑6 (MQ=255) cAAGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCat > 2:587359‑M2/1‑143 (MQ=255) cAAGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCat < 1:587359‑M2/145‑3 (MQ=255) aaGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCa > 2:553842‑M2/1‑142 (MQ=255) aaGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCa < 1:553842‑M2/143‑2 (MQ=255) ggcTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGa < 2:1036385/150‑1 (MQ=255) cTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATg < 1:414940/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCa < 1:478449/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCATccc < 2:603844/150‑2 (MQ=255) gcgcgcgcTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGAc > 2:359623/1‑150 (MQ=255) cgcgcTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACa < 1:11356/148‑1 (MQ=255) cgcgcTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACa > 2:11356/1‑148 (MQ=255) tGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGt > 1:1554162/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTg < 2:1554162/150‑1 (MQ=255) ttcttcCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGAGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGc > 2:152150/1‑150 (MQ=255) tcttcCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGct < 2:807414/150‑1 (MQ=255) cGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGGTTTTTATTTAATGCAGTCGGCGATGGCCTCACGACGGGTTGGTGGTATGcgc > 2:56311/1‑148 (MQ=255) aGTTCGTGCGGTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATg < 1:105616/150‑1 (MQ=255) tCGTGCGTTCTCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTc < 1:103905/150‑1 (MQ=255) gTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTccc > 2:451067/1‑150 (MQ=255) gTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTccc > 2:1951497/1‑150 (MQ=255) tGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTcccc > 1:2388781/1‑150 (MQ=255) gTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCa > 2:1106993/1‑150 (MQ=255) gTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACACGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCa < 1:1874081/150‑1 (MQ=255) ttCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCAt < 2:1990863/150‑1 (MQ=255) aGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATg > 1:1810552/1‑105 (MQ=255) aGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATg < 2:1810552/105‑1 (MQ=255) gACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTg > 2:1709454/1‑150 (MQ=255) aCTTGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTCTACTCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGa < 2:1599419/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGa < 2:1704431/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTc < 2:1287401/104‑1 (MQ=255) gCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTc > 1:1287401/1‑104 (MQ=255) tGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCtt > 2:2196824/1‑150 (MQ=255) acgCCAGGGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTcccc < 2:1575871/127‑1 (MQ=255) acgCCAGGGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTcccc > 1:1575871/3‑129 (MQ=255) tGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATg < 1:1079905/150‑1 (MQ=255) 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ccGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCAcc > 2:232829/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCAcc > 1:320188/1‑150 (MQ=255) cGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCt > 2:541149/1‑150 (MQ=255) ggggCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCACGTCGTGAGCGCCTTCATggag < 2:2109841/93‑1 (MQ=255) ggggCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCACGTCGTGAGCGCCTTCATggag > 1:2109841/1‑93 (MQ=255) ggggCGTTTTTTATTTCATGCAGGCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATc < 2:539853/150‑1 (MQ=255) gggCGTTTTTTATTTCATGCATTCGGCGATGGCCTCCAGACATGTTGGTGCTCTGTCCATGCTCCCCTAATTTCGTGTTCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGTGGGCTGGTCACTGAAGCCTTACTGTTTAATCATCTTCTCTTTcc > 2:910872/1‑150 (MQ=255) gggCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATcc > 2:1445956/1‑150 (MQ=255) gTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGa < 1:1452714/150‑1 (MQ=255) tttttATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGATg < 1:20358/150‑1 (MQ=255) tttttATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGATg < 1:56311/150‑1 (MQ=255) tttATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGGCGTGAGCGCATTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGATGGc < 2:124407/150‑1 (MQ=255) tttCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGATGGCAAcc > 1:1011081/1‑150 (MQ=255) ttCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGATGGCAACCg < 1:359623/150‑1 (MQ=255) ttCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGATGGCAACCg < 1:1039612/150‑1 (MQ=255) tCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTCGCGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCTTCGTCGCTATCCAGGATGGCAACCgg < 2:1480620/150‑1 (MQ=255) cATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTGGGTGCTCTGCCAACGCTCCTCCCATGTGCTGCGTGGTTTCGTAGATGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGATGGCAACCggg < 1:1251380/150‑1 (MQ=255) | ACAAGTCCAAGGCGGCTGAGGATGAGCGCGCGCTGTTCTTCCCGCAGTTCGTGCGTTCGCAGACTGGCCTGGGTGCCAGCGGGGCGGTCTCGCACTAACATCAATCCCCTGCATTGAAAACGCCCCGCTTGTCGGGGCGTTTTTTATTTCATGCAGTCGGCGATGGCCTCCAGACAGGTTGGTGCTCTGCCCATGCTCCCCTCATGTCGTGAGCGCCTTCATGGAGGACGGCACATTTGGGGGCTGGTCAATGAAGCCATACTGTTTAATCACCTTCGCTATCCAGGATGGCAACCGGG > NC_002947/1944445‑1944743 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |