New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2236962 = | 90 (1.020) | 7 (0.090) | 6/214 | NT | 9.0% | intergenic (+14/+114) | uvrB/PP_1975 | uvrABC excinuclease protein B/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
? | NC_002947 | 2237053 = | 63 (0.820) | intergenic (+105/+23) | uvrB/PP_1975 | uvrABC excinuclease protein B/EmrB/QacA family drug resistance transporter |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ACGAGATTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGC > NC_002947/2236908‑2237198 | ggaagggttgaaggctggggaagcccattgaggctattacagatcagatgcgggCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGc > 2:1852739‑M1/55‑150 (MQ=255) gagaTTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCat > 2:544882/1‑150 (MQ=255) gagaTTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATAAGCAGATGAAGCCGGGTGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCat < 2:682247/150‑1 (MQ=255) aTTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACAGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCatctg > 2:465547/1‑150 (MQ=255) ttGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCatcatt < 2:188101/150‑4 (MQ=255) tGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCatctgat < 2:1247219/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGCGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCatctgat < 1:1332342/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCatctgatc < 2:885852/150‑1 (MQ=255) gcAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCatctgatctg > 2:975689/1‑150 (MQ=255) gCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTaa < 1:465547/150‑1 (MQ=255) tGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATa < 1:1225101/150‑1 (MQ=255) cGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAAt < 2:1511298/150‑1 (MQ=255) gTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATgg < 2:689681/150‑1 (MQ=255) gTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATgg > 1:993264/1‑150 (MQ=255) cagcagCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTcc < 1:544882/150‑1 (MQ=255) agcagcTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑GAAAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGATGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTcac > 2:1781440/1‑148 (MQ=255) gcagcTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTcccc > 2:984602/1‑150 (MQ=255) gcagcTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCGGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATGTGTAATAACCTCAATGGGCTTgccc > 1:324504/1‑150 (MQ=255) cagcTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACCGCGTCTTATCTGTAATAGCCTCAATGGGATTCcaca > 2:397298/1‑150 (MQ=25) tGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATgg < 2:1366259/137‑1 (MQ=255) tGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATgg > 1:1366259/1‑137 (MQ=255) tGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCt > 2:1072579/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCtt > 1:140235/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCaa > 1:728891/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCaa < 1:1381192/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAAc < 2:140235/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCAGCTGATCGGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCACAGCATTCTAc > 2:1000457/1‑150 (MQ=25) cgcgGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTc < 1:984602/150‑1 (MQ=255) gcggtccctgtgggagcgggcatgcccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggCCCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTcc > 2:1852739‑M2/97‑150 (MQ=255) cgGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCACCGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCg < 1:1000457/150‑1 (MQ=255) gggCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCgg > 1:1045003/1‑150 (MQ=255) CCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGGAAGGCAT‑AACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAAc < 1:1871880‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACt < 2:812402‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACt < 1:1959063‑M1/150‑1 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACtt < 2:2138094‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCg > 2:1045003‑M1/1‑150 (MQ=255) GAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCggg < 1:1996462‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTcag > 1:2138094‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTcagc > 1:397298‑M1/1‑150 (MQ=255) CGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTcagcag > 1:812402‑M1/1‑150 (MQ=255) catgcccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCTGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTcagcag > 2:1291216‑M2/77‑150 (MQ=255) tGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAAt > 2:1593524/1‑102 (MQ=255) tGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAAt < 1:1593524/102‑1 (MQ=255) atgcccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCg < 1:450631‑M2/55‑1 (MQ=255) atgcccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCg > 2:450631‑M2/76‑130 (MQ=255) cccgcgaacaccggcgcagccggtgccagccaccgcgttgaattcttcgcgggcacgcccgctcccacagggCCCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCAcc < 1:1852739‑M2/78‑1 (MQ=255) ccGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCCCGcgcc < 2:2217832/79‑4 (MQ=255) ccGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCCCGcgcc > 1:2217832/1‑76 (MQ=255) ccGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGc < 2:1219375/112‑1 (MQ=255) ccGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGc > 1:1219375/1‑112 (MQ=255) ccGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCg > 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aTGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTaa > 2:1148915/1‑150 (MQ=255) aTGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTaa < 1:1218247/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAg < 1:430282/150‑1 (MQ=255) gcccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGc > 1:2312731‑M2/17‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGcc < 1:1390255‑M2/135‑1 (MQ=255) cctctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGtt < 1:34629‑M2/128‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGtt > 2:34629‑M2/15‑142 (MQ=255) ccgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCa < 1:1072579‑M2/136‑1 (MQ=255) cgctcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCAt > 1:324178‑M2/14‑150 (MQ=255) tcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGAt > 2:353436‑M2/11‑150 (MQ=255) tcccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGAt < 2:728891‑M2/140‑1 (MQ=255) ccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCa > 2:1252055‑M2/9‑150 (MQ=255) ccacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCa > 1:2386748‑M2/9‑150 (MQ=255) cacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGaa > 2:2060051‑M2/8‑126 (MQ=255) cacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGaa < 1:2060051‑M2/119‑1 (MQ=255) cacagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAg > 2:1355608‑M2/8‑150 (MQ=255) acagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAgc < 2:2312731‑M2/144‑1 (MQ=255) cagggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAgcg > 1:1765887‑M2/6‑150 (MQ=255) agggACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAgcgc < 1:1793979‑M2/146‑1 (MQ=255) | ACGAGATTGCGCAGCTGCGGGAGCGGTTGATCAGCAGCTGAAGCCGGGCGCGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGAATTCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGACCGCATCTGATCTGTAATAGCCTCAATGGGCTTCCCCAGCCTTCAACCCTTCCGGCAACTTGCGGGTCAGCAGCACCGCCACCATGCTCACCGCCAACCCGATCCCGACAAAGTGGAAGGCATCGTTGTAAGCCATGATCAGCGC > NC_002947/2236908‑2237198 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |