New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2442690 = | 65 (0.730) | 4 (0.050) | 4/230 | NT | 6.3% | coding (1785/2610 nt) | topA | DNA topoisomerase I |
? | NC_002947 | 2442731 = | 58 (0.700) | coding (1826/2610 nt) | topA | DNA topoisomerase I |
CCCAGGGCGAGCGTGACTGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAGGGCGAGTCGGAATCGCGC > NC_002947/2442584‑2442876 | ccctgggCGA‑CGTGACTGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCgat < 1:832040/146‑1 (MQ=255) cccAGGGCGAGCGTGACTGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCga > 1:2003631/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGAGCGTGACTGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCgat > 2:975673/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGAGCGTGACTGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCgat > 2:866188/1‑150 (MQ=255) ggCGAGCGTGACTGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCgatgatg < 2:2003631/150‑1 (MQ=255) aGCGTGACTGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAAAATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTc < 1:1259563/150‑1 (MQ=255) gCGTGACTGGAAGAAAGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCg < 2:959468/150‑1 (MQ=255) tGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCAc < 2:2279363/146‑1 (MQ=255) tGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCAc > 1:2279363/1‑146 (MQ=255) aCGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACgg < 2:1293204/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGgt < 2:1007922/150‑1 (MQ=255) tGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGgtg > 2:680477/1‑150 (MQ=255) gCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGgtgt > 2:1620536/1‑150 (MQ=255) gTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTggg > 2:2038498/1‑150 (MQ=255) cGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACgg > 2:2279587/1‑131 (MQ=255) cGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACgg < 1:2279587/131‑1 (MQ=255) ggCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCgat < 2:1882804/107‑1 (MQ=255) ggCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCgat > 1:1882804/1‑107 (MQ=255) ggCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGCTGATGATTAGCACCGCTTCTACAGCGGTGTTCCTGGGTTGctgt > 2:1127814/1‑148 (MQ=255) 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aaaaaGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTg > 1:400166/1‑150 (MQ=255) aaaaaGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTg > 2:1763166/1‑150 (MQ=255) aaaaaGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTg < 1:1883185/150‑1 (MQ=255) ccagagcaacccaggaacacacccgtagaagcggtgcgaatcatcatcgGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCgatg < 2:201330‑M1/46‑1 (MQ=255) ccagagcaacccaggaacacacccgtagaagcggtgcgaatcatcatcgGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCgatg > 1:201330‑M1/50‑95 (MQ=255) cAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGCGTGTGTGCCTGGGTTTCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGaaa < 2:2081467/150‑1 (MQ=255) 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gCGAAGATGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTa > 2:29988/1‑150 (MQ=255) gcaGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCCACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCTCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTAcc < 1:1874442/148‑1 (MQ=255) aCGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCa > 1:2158546/1‑150 (MQ=255) gTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGc < 1:37615/150‑1 (MQ=255) gCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCg > 1:602236/1‑150 (MQ=255) 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ACCATGACCAACATCCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGAtt > 1:866188‑M1/1‑150 (MQ=255) CCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGGGATTg > 1:612948‑M1/1‑150 (MQ=255) ccacattccttgcacggaatgttggtcatggtcggcCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGctct < 2:1522381‑M2/47‑1 (MQ=255) ccacattccttgcacggaatgttggtcatggtcggcCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGctct > 1:1522381‑M2/37‑83 (MQ=255) tGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCg < 1:608993/150‑1 (MQ=255) gaccaCATTCCTTGCACGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGc > 1:478320/5‑149 (MQ=255) 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aaCATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTgac > 1:1674690/1‑150 (MQ=255) aaCATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTgac > 1:273171/1‑150 (MQ=255) ttCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGacgacg > 1:613504/1‑150 (MQ=255) ttCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGacgacg > 1:175278/1‑150 (MQ=255) tCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGAcgacga < 1:680477/150‑1 (MQ=255) ccGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAg < 2:842360/150‑1 (MQ=255) cGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAgg < 1:225793/150‑1 (MQ=255) cGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTAAAGTGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAgg < 1:1233295/150‑1 (MQ=255) gTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAggg > 2:2230207/1‑150 (MQ=255) cAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGctct > 2:2291815/1‑64 (MQ=255) cAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGctct < 1:2291815/64‑1 (MQ=255) 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cggcCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAGGGCGAGTCGGAATcgcgc < 2:602236‑M2/146‑1 (MQ=255) cggcCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAGGGCGAGTCGGAATcgcgc < 2:175278‑M2/146‑1 (MQ=255) ggcCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAGGGCGAGTCg > 2:410213‑M2/4‑140 (MQ=255) ggcCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAGGGCGAGTCg < 1:410213‑M2/137‑1 (MQ=255) cCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTa > 1:1566524‑M2/2‑53 (MQ=255) cCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTa < 2:1566524‑M2/52‑1 (MQ=255) | CCCAGGGCGAGCGTGACTGGAAGAACGTGCTCGACGAGTTCTACGGCGATTTCAGCAAAAAGCTGCAGACTGCCGAGTCCAGCGAAGACGGCATGCGTGCCAACCAGCCGACCATGACCAACATTCCGTGCAAGGAATG‑TGGTCGGCCGATGATGATTCGCACCGCTTCTACGGGTGTGTTCCTGGGTTGCTCTGGCTACAGCCTGCCGCCGAAAGAGCGCTGCAAGGCTACCGTCAACCTGGTGCCGGGCGACGAGATTGCCGCTGACGACGAGGGCGAGTCGGAATCGCGC > NC_002947/2442584‑2442876 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |