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gccgcAAGCCATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCg > 1:1420571/1‑135 (MQ=255) gccgcAAGCCATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCg < 2:1420571/135‑1 (MQ=255) gccgcAAGCCATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCGGGTa > 2:2281351/1‑139 (MQ=255) gccgcAAGCCATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCGGGTa < 1:2281351/139‑1 (MQ=255) gccgcAAGCCATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCGGGTACACAACCCGtt < 2:1810187/150‑1 (MQ=255) cgcAAGCCATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCGGGTaca < 1:1820733/139‑1 (MQ=255) cgcAAGCCATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCGGGTaca > 2:1820733/1‑139 (MQ=255) aaGCCATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCGGGTACACAACCCGTTGGCCa < 1:1840076/150‑1 (MQ=255) ccATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCGGGTACACAACCCGTTGGCCAGCa > 1:1549271/1‑150 (MQ=255) cATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCGGCAGGCGATCACTTTCTGCAAGGTTACTGCGGGCCAGATAAGCAGGATCCGGCGTGCGAGCGCATCTACGGCCGCCAGTACGGGGTACACTACCCGTTGGCGTGCaa > 2:1106715/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTAccgcc < 2:1868580/115‑1 (MQ=255) aTGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTAccgcc > 1:1868580/1‑115 (MQ=255) cTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCGGGTACACAACCCGTTGGCCAGCAAGGATCg < 1:1538227‑M2/149‑1 (MQ=255) | CCGTGGAGGATGTGCTGGAGATGGTACAGGCAGGCATCTACCACCTGACCGTGGTCGAGCAGCCCATTGCCCGGCGTTGGGCCCGGGTTATGCCGCGCCTGCGCCTGGACAGCCGGGTGCGCCTGGGGGCGCCGCAAGCCATGCGCTGGTATGTAGGGGGGGAAGCGCCGCAATTGCTGGCCGCAGTCGATCACTTTCTGCAAGGTTACCGCGCGCCAGATAACCAGGATGCGGCGTTCGAGCGCATCTACCGCCGCCAGTACCGGGTACACAACCCGTTGGCCAGCAAGGATCG > NC_002947/2642379‑2642673 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |