New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 2755142 = | 73 (0.870) | coding (1425/3147 nt) | czcA‑II | cation efflux system protein |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
AGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCGTACGGCACGGCAGCG > NC_002947/2754994‑2755291 | gccttcctcttccttgaccttgccggtgacgaacagggcaatggctgccggaacgaacgtgaccgaaaggatcatcgcgcccaacagggccatgaccacggtaaaggccatagggtggaacatcttgccctgaccggggtcgagggcaag < 1:257330‑M2/1‑1 (MQ=255) gccttcctcttccttgaccttgccggtgacgaacagggcaatggctgccggaacgaacgtgaccgaaaggatcatcgcgcccaacagggccatgaccacggtaaaggccatagggtggaacatcttgccctgaccggggtcgagggcaag > 1:965514‑M2/150‑150 (MQ=255) ttcctcttccttgaccttgccggtgacgaacagggcaatggctgccggaacgaacgtgaccgaaaggatcatcgcgcccaacagggccatgaccacggtaaaggccatagggtggaacatcttgccctgaccggggtcgagggcaaGATg < 2:1691091‑M2/4‑1 (MQ=255) cACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTc < 2:2147820/150‑1 (MQ=255) cACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTc < 1:612885/150‑1 (MQ=255) tCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCAGGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCAccc > 2:1543864/1‑150 (MQ=255) aTGCTGACCCGCGGCGAACGGTCCCCTGTTGTGTTTTCTGTTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGCGTTTTCACCAGTCTTGGCCTT‑TACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATg < 1:1622477/150‑1 (MQ=255) aCCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCttt > 1:2310812/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) ttgccctcgaccccggtcagggcaaGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGt > 2:1107224‑M2/26‑117 (MQ=255) ttgccctcgaccccggtcagggcaaGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGt < 1:1107224‑M2/92‑1 (MQ=255) ttgccctcgaccccggtcagggcaaGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGt > 2:1462111‑M2/26‑117 (MQ=255) ttgccctcgaccccggtcagggcaaGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGt < 1:1462111‑M2/92‑1 (MQ=255) tgccctcgaccccggtcagggcaaGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCt > 1:1688889‑M2/25‑150 (MQ=255) gccctcgaccccggtcagggcaaGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCga < 1:1275586‑M2/50‑1 (MQ=255) gccctcgaccccggtcagggcaaGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCga > 2:1275586‑M2/24‑73 (MQ=255) CCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCttt > 1:1358991‑M1/1‑81 (MQ=255) CCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCttt < 2:1358991‑M1/81‑1 (MQ=255) CCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTgg < 2:1321256‑M1/150‑1 (MQ=255) CCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGt < 1:1345855‑M1/150‑1 (MQ=255) CCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCGATGGCCGTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGt < 1:1319464‑M1/150‑1 (MQ=255) gACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGGAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGAt < 2:1959371/150‑1 (MQ=255) aCCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaag < 2:732055/133‑1 (MQ=255) aCCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaag > 1:732055/1‑133 (MQ=255) gAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCGTacggca < 1:1637579/150‑1 (MQ=255) caaGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCGTAcggcacggca > 1:720643‑M2/4‑150 (MQ=255) aaGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCGTACGGCACGGCAg > 2:1826753‑M2/3‑150 (MQ=255) aGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCGTACGGCACGGCAGc < 2:257330‑M2/149‑1 (MQ=255) gATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGACGAGGAAGGCCTGGTCATGCGTACGGCACGGCAgcg > 2:45298/1‑150 (MQ=255) gATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCGTACGGCACGGCAgcg > 2:1126327/1‑150 (MQ=255) gATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCGTACGGCACGGCAgcg > 2:1137373/1‑150 (MQ=255) | AGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACCGTGGTCATGGCCCTGTTG‑GGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCGTACGGCACGGCAGCG > NC_002947/2754994‑2755291 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |