| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 2755434 | 102 (1.150) | 10 (0.120) | 9/238 | NT | 9.2% | coding (1717/3147 nt) | czcA‑II | cation efflux system protein |
| ? | NC_002947 | = 2755453 | 98 (1.140) | coding (1736/3147 nt) | czcA‑II | cation efflux system protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TGGCCTGGGTGCTGGGCCGGCGCAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATGCCGCCGAACATTTCCGATGCCT > NC_002947/2755306‑2755602 | tGGCCTGGGTGCTGGGCCGGCGCAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCgg > 2:2384202‑M2/1‑148 (MQ=255) cTGGGTGCTGGGCCGGCGCAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCAc < 1:6974/150‑1 (MQ=255) tGGGTGCTGGGCCGGCGCAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCAcc > 1:972577/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCCGGCGCAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCt > 2:2147689/1‑150 (MQ=255) tGGGCCGGCGCAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGAATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCTCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGt < 1:719696/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCGGCACGCGCAGGGCCTGCAgggcgaagtcaccctcgc > 2:1284600‑M2/1‑132 (MQ=255) ggCGCAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGt < 2:1115949/150‑1 (MQ=255) gcAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCgg < 2:254980/150‑1 (MQ=255) cAAACTGTCATGTGTCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCTGGCGTGATGTCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGt < 2:1170399/150‑1 (MQ=255) aaaCTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTg < 2:799494/150‑1 (MQ=255) aaaCTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTg < 2:1515778/150‑1 (MQ=255) aaaCTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTg > 1:8043/1‑150 (MQ=255) cATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCTCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGc < 1:1623986/150‑1 (MQ=255) aTGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCa > 1:756804/1‑150 (MQ=255) gtgCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCAGCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGAGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAAc < 1:2018179/150‑1 (MQ=255) tgCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACa < 1:67712/150‑1 (MQ=255) ccgccgccgccgccCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCggg < 2:559681‑M2/115‑4 (MQ=255) cgccgccgccgccCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGCGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAgcg > 1:1569022/1‑150 (MQ=255) 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1:644808/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATgcc > 2:191248/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTg > 1:53299/1‑93 (MQ=255) aGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATGCCGCCGa > 2:1141448/1‑150 (MQ=255) ggCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATGCCGCCGaa < 2:370641/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATGCCGCCGAAc < 1:1419468/150‑1 (MQ=255) cccTGCGCGTGCCgggcgaagtcaccctcgctgaggctggggatgaactcgctgcccatgcggctggccatcacgcccgacaacagcaccagggcggcggcggcggcacatgccagtttgcgccggcccagcacccaggccagaaccggg > 1:1284600‑M2/1‑13 (MQ=255) gcgcGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATGCCGCCGAACATTTc > 2:1317531/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATGCCGCCGAACATTTCCGATg < 1:1843023/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATGCCGCCGAACATTTCCGATGc > 2:807522/1‑150 (MQ=255) cGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATGCCGCCGAACATTTCCGATGCCt > 1:914954/1‑150 (MQ=255) | TGGCCTGGGTGCTGGGCCGGCGCAAACTGGCATGTGCCGCCGCCGCCGCCCTGGTGCTGTTGTCGGGCGTGATGGCCAGCCGCATGGGCAGCGAGTTCATCCCCAGCCTCAGCGAGGGTGACTTCGCCCTGCAGGCCCTGCGCGTGCCGGGCACCAGCCTGTCGCAGTCGGTGGACATGCAACAGCGCCTGGAGCAGGCGATCATCGCCCAGGTGCCGGAGGTGGAGCGGGTGTTTGCCCGCACCGGCACTGCCGAGATTGCCTCCGACCCGATGCCGCCGAACATTTCCGATGCCT > NC_002947/2755306‑2755602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |