New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 2844227 | 111 (1.250) | 6 (0.070) | 6/230 | NT | 5.3% | coding (457/1005 nt) | PP_2495 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2844238 | 111 (1.340) | coding (446/1005 nt) | PP_2495 | hypothetical protein |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GAGCGATCATCTGCTCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGAACCTTGTTCT > NC_002947/2844089‑2844385 | gagcgaTCATCTGCTCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCaga < 1:590053/150‑1 (MQ=255) gagcgaTCATCTGCTCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCaga < 2:711027/150‑1 (MQ=255) cGATCATCTGCTCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAggc > 1:1601976‑M2/1‑147 (MQ=255) tcatcTGCTCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGTAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAggcgtg < 1:1431899‑M2/150‑7 (MQ=255) atcTGCTCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAggcgtgcc < 2:1082956‑M2/150‑9 (MQ=255) ccgatcttCCCGCGCGATGCGTTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGATCAATCACCTGCATCTACAGATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGcccc < 1:372562/143‑1 (MQ=255) tCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGttt > 2:1077612/1‑150 (MQ=255) tCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGttt > 1:1106212/1‑150 (MQ=255) aTCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTTCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTAt < 2:1185247/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATg > 2:2208492/1‑150 (MQ=255) cccGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCgagatcgg > 2:372562/1‑143 (MQ=255) cGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGt < 2:277228/142‑1 (MQ=255) cGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCACCAGTCCTGCGACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGAACGCGGGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCg < 1:1967421/150‑1 (MQ=255) 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tCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTg > 1:1108569/1‑150 (MQ=255) ccGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGa < 2:1909532/150‑1 (MQ=255) cGGCACGCCCTCTTTCCAGAggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgcc > 2:185501‑M2/1‑20 (MQ=255) cGGCACGCCCTCTTTCCAGAggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgcc < 1:185501‑M2/65‑46 (MQ=255) gCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGt > 2:427006/1‑144 (MQ=255) gCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGt < 1:427006/144‑1 (MQ=255) aCGCCCTCTTTCCAGAggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgccgtcaccggcaagcaggcggcggatgtagcagtactgctgggtggt < 1:644565‑M2/106‑91 (MQ=255) cGCCCTCTTTCCAGAGGCGGGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCTTGGTTCTGCACATCGTCAGCCCCGATCTCCTCTCGGTCTTTATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGAGCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTc < 2:595025/150‑1 (MQ=255) gCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGtt < 2:468779/141‑1 (MQ=255) cccTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGGCGCTATGGATCCGGGTGCTGCAGGACGGCGTTGATGCGTCGa > 1:1055236/1‑150 (MQ=255) ccTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGaa > 1:1029461/1‑150 (MQ=255) ccTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGaa < 1:1536153/150‑1 (MQ=255) ctctTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATc > 1:1411338/1‑60 (MQ=255) ctctTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGctct > 1:499692/1‑112 (MQ=255) ctctTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGAAc > 1:2162798/1‑150 (MQ=255) tctTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGAAcc > 2:1675230/1‑150 (MQ=255) ccAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGNTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGAACCTTGtt < 1:289719/150‑1 (MQ=255) ccAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGAACCTTGtt < 2:881030/150‑1 (MQ=255) agagGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGAACCTTGctct < 1:678425/150‑1 (MQ=255) | GAGCGATCATCTGCTCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGAACCTTGTTCT > NC_002947/2844089‑2844385 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |