New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3497430 | 76 (0.860) | 5 (0.060) | 4/230 | NT | 6.5% | coding (210/765 nt) | PP_5562 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3497437 | 73 (0.880) | coding (203/765 nt) | PP_5562 | hypothetical protein |
CCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGGAGATCGCCCGCGTTTGGCTA > NC_002947/3497290‑3497583 | ccGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTgg > 1:2072585‑M2/1‑148 (MQ=255) ccGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTgg > 1:626780‑M2/1‑148 (MQ=255) cGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTggc < 2:1805626‑M2/150‑4 (MQ=255) cGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGAGGTGCTGAGCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTggc < 1:1377406‑M2/150‑4 (MQ=255) tgtTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTggccctgg > 1:1805754‑M2/1‑142 (MQ=255) cAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTggccctgg < 1:2294584‑M2/145‑9 (MQ=255) cAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTggccctgg > 2:2294584‑M2/1‑137 (MQ=255) cAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTc < 1:2016778/150‑1 (MQ=255) gggTCTTGGCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTcgc < 2:1377406/150‑1 (MQ=255) tCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGCTACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGcc > 2:1824182/1‑150 (MQ=255) tCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGtt < 2:2345119/143‑1 (MQ=255) tCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGtt > 1:2345119/1‑143 (MQ=255) tCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGcc < 1:1926457/150‑1 (MQ=255) ttGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCg > 2:429289/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTgcgc < 2:423676/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCtg > 1:1058741/1‑150 (MQ=255) aGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGc > 2:1714184/1‑150 (MQ=255) gTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCa < 2:399712/150‑1 (MQ=255) 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gtgCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCa > 2:736706/1‑150 (MQ=255) tgCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCaa > 2:1282091/1‑150 (MQ=255) tGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACa > 1:327086/1‑150 (MQ=255) aTCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCt < 1:1768523/129‑1 (MQ=255) aTCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCt > 2:1768523/1‑129 (MQ=255) aTCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCAGAAACGTTCGTAGAGTTTCACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAgg > 1:294833/1‑150 (MQ=255) aTCAGGTTCAGCGGTACTACCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAgg < 1:736706/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTg > 1:1540980/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTg > 1:490480/1‑150 (MQ=255) gCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAg > 2:452183/1‑124 (MQ=255) gCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAg < 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gCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTg > 1:1893428/1‑146 (MQ=255) gCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCaa > 2:322904/1‑150 (MQ=255) gCTGGAACGGCGCGACCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCaa < 1:1579592/150‑1 (MQ=255) cTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑cggacg < 1:1413186/126‑1 (MQ=255) cTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑cggacg > 2:1413186/1‑126 (MQ=255) gAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTc > 2:584946/1‑66 (MQ=255) gAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTc < 1:584946/66‑1 (MQ=255) cGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATc < 1:1714184/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATcc < 2:1516546/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAgg < 2:248747/103‑1 (MQ=255) ggCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAgg > 1:248747/1‑103 (MQ=255) ccgagccgaTACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAg < 2:1126129/85‑1 (MQ=255) ccgagccgaTACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAg > 1:1126129/1‑85 (MQ=255) gagccgaTACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCG‑CAAACATCGCTTGCCGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTgc > 2:676167/1‑150 (MQ=255) aTACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAgg < 2:2179531/93‑1 (MQ=255) aTACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAgg > 1:2179531/1‑93 (MQ=255) tACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCa < 1:1824182/150‑1 (MQ=255) gTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGt < 2:1410991/118‑1 (MQ=255) gTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGt > 1:1410991/1‑118 (MQ=255) gTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAgcg > 1:400449/1‑150 (MQ=255) tCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCa > 1:98885/1‑150 (MQ=255) tCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCa < 1:1940355/150‑1 (MQ=255) gagTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTGCTGCTCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGga < 1:676167/150‑1 (MQ=255) gagTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGga < 2:327086/150‑1 (MQ=255) atcttCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTATCCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGga < 1:63229/147‑1 (MQ=255) ttCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGga < 1:679597/147‑1 (MQ=255) ttCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGga > 2:679597/1‑147 (MQ=255) cGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCAGGCCTGTCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGgagagat > 2:63229/1‑147 (MQ=255) gACCAGGGCCTGGAAGTggccctggtcgaactctacgaacgtatcggctcggccgcgccgttccagctg < 1:1537427‑M2/69‑53 (MQ=255) gACCAGGGCCTGGAAGTggccctggtcgaactctacgaacgtatcggctcggccgcgccgttccagctg > 2:1537427‑M2/1‑17 (MQ=255) gACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGga < 2:1024332/144‑1 (MQ=255) gACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGGAGATCGc > 2:950445/1‑150 (MQ=255) gACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGATGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGga > 1:1024332/1‑144 (MQ=255) ccAGGGCCTGGAAGTggccctggtcgaactctacgaacgtatcggctcggccgcgccgttccagctggtcaccgagctggaagtaccgctgaacctgatcagcaccacccccgaactgttcccgctggaatacgacaagaccctggaaca < 2:582575‑M2/150‑136 (MQ=255) ccAGGGCCTGGAAGTggccctggtcgaactctacgaacgtatcggctc > 2:2491‑M2/1‑15 (MQ=255) ccAGGGCCTGGAAGTggccctggtcgaactctacgaacgtatcggctc < 1:2491‑M2/48‑34 (MQ=255) ccAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGGAGATCGccc > 2:424094/1‑150 (MQ=255) ccTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGGAGATCGCCCGCGttt < 1:576742/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGt < 2:1460543/96‑1 (MQ=255) cTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGt > 1:1460543/1‑96 (MQ=255) aaGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGGAGATCGCCCGCGTTTGGCTa < 2:829645/150‑1 (MQ=255) | CCGCTGTGTTCCAGGGTCTTGTCGTATTCCAGCGGGAACAGTTCGGGGGTGGTGCTGATCAGGTTCAGCGGTACTTCCAGCTCGGTGACC‑AGCTGGAACGGCGCGGCCGAGCCGATACGTTCGTAGAGTTCGACCAGGGCCTGGAAGTGGCCCTGGGTTTCGCGCCCGCTGCTGCGCTGTGCGCCTTGCAGGTATTCGCCAAACAGGGTTTG‑CGGACGGATCAGCGGTGCCACGGTGGCAAGGTAATCCGCCGCCTGCGCCTTCAGCGCATCGGAGATCGCCCGCGTTTGGCTA > NC_002947/3497290‑3497583 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |