| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3649432 | 83 (0.940) | 5 (0.060) | 4/234 | NT | 6.3% | intergenic (+866/+825) | PP_3214/PP_3216 | hypothetical protein/cysteine dioxygenase |
| ? | NC_002947 | = 3649458 | 71 (0.840) | intergenic (+892/+799) | PP_3214/PP_3216 | hypothetical protein/cysteine dioxygenase | |||||
AGCCCATCTGTGCCAGCCACGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTTGCTGCCCCGCCAGGGTCCAGCCGATGGTG > NC_002947/3649310‑3649604 | aGCCCATCTGTGCCAGCCACGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTTGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGAc < 1:254697‑M2/150‑2 (MQ=255) gCCCATCTGTGCCAGCCACGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGAcc > 1:1900761‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCCATCTGTGCCAGCCACGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGAcc < 1:1472964‑M2/150‑3 (MQ=255) cATCTGTGCCAGCCACGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGAccggc < 2:1193986‑M2/150‑6 (MQ=255) cTGTGCCAGCCACGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCt < 2:1101509/150‑1 (MQ=255) cagccaTGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTc < 2:1092623/150‑1 (MQ=255) cagccaCGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTc > 1:2076985/1‑150 (MQ=255) gccaCGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCt > 2:1272388/1‑150 (MQ=255) gccaCGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCt < 1:1328815/150‑1 (MQ=255) ccaCGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTc < 1:924495/150‑1 (MQ=255) aCGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCgg > 1:2319217/1‑150 (MQ=255) aCGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCgg > 1:1883907/1‑150 (MQ=255) aCGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCgg < 2:699918/150‑1 (MQ=255) ggCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGt > 1:2067612/1‑150 (MQ=255) gcTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTAcg > 1:2104485/1‑150 (MQ=255) gcTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTAcg > 1:2017957/1‑150 (MQ=255) tCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCt > 2:812971/1‑138 (MQ=255) tCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCt < 1:812971/138‑1 (MQ=255) ttGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCGGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTAcgcg < 2:815985/145‑1 (MQ=255) ttGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTAcgcg > 1:815985/1‑145 (MQ=255) tGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGCCCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGc < 1:1991126/150‑1 (MQ=255) gcgcACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTAcc > 2:1665011/1‑150 (MQ=255) cACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGcc < 1:1474314/150‑1 (MQ=255) 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gCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGt < 1:176096/114‑1 (MQ=255) ccgccgGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGAccggcgggcaactggttcaagagaccgaccacgtcgccagtgtgcgcggggcgcgcatcgcgctggtggacgacgatggcgtgcgcgccaacatgagcgcctcgtggctggcacaga < 2:2054243‑M2/150‑118 (MQ=255) ccgccgGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGAccggcgggcaactggttcaagagaccgaccacgtcgccagtgtgcgcggggcgcgcatcgcgctggtggacgacgatggcgtgcgcgccaacatgagcgcctcgtggctggcacaga < 1:351931‑M2/150‑118 (MQ=255) ccgccgGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGtt < 1:807358/150‑1 (MQ=255) ccgGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGAccggcgggcaactggttcaagagaccgaccacgtcgccagtgtgcgcggggcgcgcatcgcgctggtggacgncgatggngtgcgcgccaacntgagcgcctcgtggctggcacagatgg > 1:2054243‑M2/1‑30 (MQ=255) gggCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTtgctgc < 1:1590432/150‑1 (MQ=255) gggCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTtgctgc < 2:2035301/150‑1 (MQ=255) cACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTTGCTGcccc < 2:541483/150‑1 (MQ=255) ggcggcTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTTGCTGCCCCGCCAg > 2:117102/1‑150 (MQ=255) cccGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTTGCTGCCCCGCCAGGGTCCCGc < 2:1462751/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTTGCTGCCCCGCCAGGGTCCAGcc > 1:832372/1‑150 (MQ=255) gATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTTGCTGCCCCGCCAGGGTCCAGCCGATGGt > 1:669269/1‑150 (MQ=255) aTGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTTGCTGCCCCGCCAGGGTCCAGCCGATGGTg < 1:117102/150‑1 (MQ=255) aTGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTTGCTGCCCCGCCAGGGTCCAGCCGATGGTg > 1:1235443/1‑150 (MQ=255) | AGCCCATCTGTGCCAGCCACGAGGCGCTCATGTTGGCGCGCACGCCATCGTCGTCCACCAGCGCGATGCGCGCCCCGCGCACACTGGCGACGTGGTCGGTCTCTTGAACCAGTTGCCCGCCGGGCACCGGGCGGCTGCCCGGCAGATGACCGGCGCTGTATTCCTCGGTCGTACGCGGTCTGCTACCGCCCGGGCCTGGCCGGCGGCGTTGGCGCGGGTAACCGCGGTGACCTCGGCAAAGCGGCGGTCCTGACCATGAGCCAGTTGCTGCCCCGCCAGGGTCCAGCCGATGGTG > NC_002947/3649310‑3649604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |