| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3723725 | 88 (0.990) | 9 (0.110) | 8/228 | NT | 9.8% | intergenic (+12/+18) | PP_3288/PP_3289 | universal stress protein family protein/acetyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 3723729 | 84 (1.020) | intergenic (+16/+14) | PP_3288/PP_3289 | universal stress protein family protein/acetyltransferase | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACTGAA > NC_002947/3723591‑3723876 | cTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCt < 2:1524645/150‑1 (MQ=255) tGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCtt > 1:1109788/1‑150 (MQ=255) ggTCATGTGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTTGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTGCTCCAGAGCGCTCCCACGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCttt < 1:1062521/150‑1 (MQ=255) gTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGGGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCTTGCgggccttgtgcttc > 2:1265325‑M2/1‑136 (MQ=255) gTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCtttt > 2:1142745/1‑150 (MQ=255) gTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCtttt < 1:2235624/150‑1 (MQ=255) aTGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCtttt < 1:418104/147‑1 (MQ=255) aTGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCtttt > 2:418104/1‑147 (MQ=255) aTGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCaa < 2:2037457/150‑1 (MQ=255) tGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAg < 1:1206465/150‑1 (MQ=255) gtgtaGTTATCACCAGCTTGTCATCGGCTGGTTGATCGGCAGTACTGCCGAGCGCTTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTTATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAgg < 2:169076/146‑1 (MQ=255) gCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGcc > 1:379566/1‑150 (MQ=255) ttATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGGTTGAACGGCCGCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACCAGGCCCGCAATGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAg > 1:2223413/1‑150 (MQ=255) ttATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAg > 2:2305995/1‑150 (MQ=255) ttATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAg < 1:1785249/150‑1 (MQ=255) tCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTc > 2:2106473/1‑150 (MQ=255) tCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTc < 1:1038326/150‑1 (MQ=255) ccaccGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAg > 1:1653467/1‑150 (MQ=255) 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aaGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGga < 2:1653467/150‑1 (MQ=255) cacaAGGCCCGCAAgggccttgtgcttcagccttgggagcgctctggagaaatcaccagcacactgctcgtcaagcgatgagttacgggctcgggagtactgccgatgaaccagccgatgccacggtggtgataactcgccatgaccagt < 1:172134‑M2/150‑137 (MQ=255) acaAGGCCCGCAAgggccttgtgcttcagccttgggagcgctctggagaaatcaccagcacactgctggacaaccgatgcataacgcgctcggcagtactgccgatgaaccagccgatgccacggtggtgataactgcccatgaccagta < 1:1678662‑M2/150‑138 (MQ=255) acaAGGCCCGCAAgggccttgtgcttcagccttgggagcgctctggagaaatcaccagcacactgctggacaaccgatgcataacgcgctcggcagtactgccgatgaaccagccgatgccacggtggt > 1:1765057‑M2/1‑13 (MQ=255) acaAGGCCCGCAAgggccttgtgcttcagccttgggagcgctctggagaaatcaccagcacactgctggacaaccgatgcataacgcgctcggcagtactgccgatgaaccagccgatgccacggtggt < 2:1765057‑M2/129‑117 (MQ=255) acaAGGCCCGCAAgggccttgtgcttcagccttgggagcgctctggagaaatcaccagcacactgctggacaaccgatgcataacgcgctcggcagtactgccgatgaacacgccgatgccacggtggtgataactgcccatgaccagta < 1:508120‑M2/150‑138 (MQ=255) acaAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGAcc > 2:547129/1‑150 (MQ=255) caAGGCCCGCAAgggccttgtgcttcagccttgggagcgctctggagaaat > 2:524269‑M2/1‑12 (MQ=255) ggCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGc < 2:833116/57‑1 (MQ=255) ggCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGc > 1:833116/1‑57 (MQ=255) gCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCa > 2:1014305/1‑146 (MQ=255) gCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCa < 1:1014305/146‑1 (MQ=255) ccGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACt > 2:2024957/1‑150 (MQ=255) gCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACTGa > 2:859723/1‑150 (MQ=255) cAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACTGaa > 1:2273712/1‑150 (MQ=255) | CTGGTCATGGGCAGTTATCACCACCGTGGCATCGGCTGGTTCATCGGCAGTACTGCCGAGCGCGTTATGCATCGGTTGTCCAGCAGTGTGCTGGTGATTTCTCCAGAGCGCTCCCAAGGCTGAAGCACAAGGCCCGCAAGGGCCTTGTCTTTTCAAGGCCGCAGGTCAAGTTCGTGCAGAATCTCGCTCACATCGCCGCCGGGGTAGCGGGAGGTGAAGCCCAGTGCCTTGACCAGCCGGTGCATCGCGTAGTTGCTGGCCAGGTCCCTGGAGACCATGCACTGAA > NC_002947/3723591‑3723876 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |