New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3758150 = | 113 (1.280) | 8 (0.100) | 6/230 | NT | 7.2% | coding (420/1002 nt) | hemBB | porphobilinogen synthase |
? | NC_002947 | 3758188 = | 100 (1.210) | coding (458/1002 nt) | hemBB | porphobilinogen synthase |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CACGCCCTCGACGCGGACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGCGATGTGCGTCTGA > NC_002947/3758040‑3758337 | cctgagcgcgccgatgcgcccgtccatcatgtccgaaggtgccaaggtgtcgatgccggcctgggcctggaccacagcctgggccgccagtacctgcaaggtctcgtcatTGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAAt > 2:1935654‑M1/111‑150 (MQ=255) tgagcgcgccgatgcgcccgtccatcatgtccgaaggtgccaaggtgtcgatgccggcctgggcctggaccacagcctgggccgccagtacctgcaaggtctcgtcat‑GGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGAc > 1:1920085‑M1/109‑150 (MQ=255) ccTCGACGCGGACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACga > 2:1780070/1‑150 (MQ=255) cTCGACGCGGACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACgag > 1:435155/1‑150 (MQ=255) tCGACGCGGACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAAt < 2:1208719/143‑1 (MQ=255) tCGACGCGGACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAAt > 1:1208719/1‑143 (MQ=255) tCGACGCGGACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACgaga > 2:1594400/1‑150 (MQ=255) ggACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGATCTTGCa < 1:2195124/150‑1 (MQ=255) ggACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCa > 2:1696299/1‑150 (MQ=255) ggACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCa < 2:2385390/150‑1 (MQ=255) ggACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCa < 2:547515/150‑1 (MQ=255) gACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAg < 2:572314/150‑1 (MQ=255) ccTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGCCAG‑CGTGCTGCGCAAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACt > 2:255897/1‑150 (MQ=255) cTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAggccgag < 2:146392/150‑6 (MQ=255) cTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTg < 1:218088/150‑1 (MQ=255) gtCTGCCGCGCCGCCAGGGTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGAAGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGCCCCCGACGG‑CGTGCTGTGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTggcg < 2:131026/149‑1 (MQ=255) tGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGcc < 2:869377/150‑1 (MQ=255) gccgcgccgcCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGccc < 2:435155/150‑1 (MQ=255) 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cgccAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGc < 1:2264882/147‑1 (MQ=255) cgccAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGc > 2:2264882/1‑147 (MQ=255) gccAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCtgtg < 1:1045734/150‑1 (MQ=255) gccAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCtgtg < 1:131322/150‑1 (MQ=255) aGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTc > 1:555922/1‑150 (MQ=255) ttGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGCCAACGGCC‑CGAGGGTGGTGCTGCGGGATTTCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTccag < 1:295157/150‑1 (MQ=255) tGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTccagg < 2:71353/150‑1 (MQ=255) tCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGGCGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTccaggcc‑c > 1:513052/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGGGGCCCAGGCTGTGGTccaggcc‑c > 1:1706923/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTccaggcc‑c > 2:2389828/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTccaggcc‑c > 1:1703346/1‑150 (MQ=255) aaGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTccaggcc‑cag < 2:2035126/150‑1 (MQ=255) aaGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCAAGGCTGTGGTccaggcc‑cag > 1:556467/1‑150 (MQ=255) aGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTccaggcc‑cagg < 1:701219/150‑1 (MQ=255) ccACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCg < 1:1113597/150‑1 (MQ=255) 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TGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAg > 2:1406974‑M1/1‑147 (MQ=255) GCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCc‑g > 1:75361‑M1/1‑150 (MQ=255) CCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCc‑gc < 2:1435021‑M1/150‑1 (MQ=255) ccacgcggccttggcgcagcacgccgtcgtggccaATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCAt > 2:2157348‑M2/36‑132 (MQ=255) ccacgcggccttggcgcagcacgccgtcgtggccaATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCAt < 1:2157348‑M2/97‑1 (MQ=255) acgcggccttggcgcagcacgccgtcgtggccaATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGAACAGGCTATGGTCCAGGCC‑CAAGCCGTCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACTTGCGCATCTGCGCGCTCATGTcc‑gcgg > 2:2308217‑M2/34‑149 (MQ=255) gg‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGgc > 1:1008511/1‑129 (MQ=255) tgctgcGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTGGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTTGTCCAAGTG‑CATGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCCAGCGC‑GGACCTga < 1:1852607/150‑2 (MQ=255) ctgcGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGcc < 1:2052560/150‑1 (MQ=255) ctgcGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGcc > 2:776808/1‑150 (MQ=255) gcgcCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAgg > 1:251369/1‑53 (MQ=255) cgcCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCggg < 2:258919/150‑1 (MQ=255) ggCCGCGTGGCACCTGACGAGACCTTGCACGTACTGGCGGCACAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACCCCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGc < 1:1696299/150‑1 (MQ=255) gCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGCg > 2:1546365/1‑150 (MQ=255) cgcgTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGCGAt > 2:1060574/1‑150 (MQ=255) gccaATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGCGATGTGCGt < 2:2130636‑M2/146‑1 (MQ=255) ccaATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCt < 2:1242378‑M2/124‑1 (MQ=255) ccaATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCt > 1:1242378‑M2/4‑127 (MQ=255) ccaATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGCGATGTGCGTc < 1:776808‑M2/147‑1 (MQ=255) caATGACGAGACCTTGCCGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTACCGGCCGCACAGTAG‑ATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGCGATGTGCGGCt > 2:593726‑M2/3‑150 (MQ=255) aATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCACAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGCGATGTGCGTCTg > 1:659628‑M2/2‑150 (MQ=255) aTGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGCGATGTGCGTCTGa > 1:69905/1‑150 (MQ=255) | CACGCCCTCGACGCGGACAACCTGATCTGCCGCGCCGCCAGGTTGCTCAAGGCCACGTTCCCCAACCTTGGCTTGATCGGCGACGTCGCACTGGACCCCTACACCGACCATGGCCACGACGG‑CGTGCTGCGCCAAGGCCGCGTGGCCAATGACGAGACCTTGCAGGTACTGGCGGCCCAGGCTGTGGTCCAGGCC‑CAGGCCGGCATCGACACCTTGGCACCTTCGGACATGATGGACGGGCGCATCGGCGCGCTCAGGTCC‑GCGCTGGACCTGGCCGGGTTCAGCGATGTGCGTCTGA > NC_002947/3758040‑3758337 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |