New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3991884 = | 87 (0.980) | 6 (0.070) | 6/230 | NT | 6.8% | coding (1229/1446 nt) | PP_3518 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3991921 = | 84 (1.020) | coding (1192/1446 nt) | PP_3518 | hypothetical protein |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
ACGGCCGCGGTTGGCCTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTCGCGGGCCTGACGGTTACTG > NC_002947/3991772‑3992066 | aCGGCCGCGGTTGGCCTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGtt > 1:179125/1‑150 (MQ=255) ggCCGCGGTTGGCCTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGc > 2:346535/1‑150 (MQ=255) gCCGCGGTTGGCCTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTTGCCAGGTTGcc < 2:1698734/150‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTctgc < 1:346535/150‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTctgc < 2:875177/150‑1 (MQ=255) gCCTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTgg > 2:833126/1‑150 (MQ=255) gCCTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTgg > 2:857284/1‑150 (MQ=255) gCCTGCACGCTGGTGCGAGCAGGCAAGAGCAAACCGTCGAAGGCATTGTTGCTGGCACGGCGTGCGGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTgg > 2:883912/1‑150 (MQ=255) ccTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTggc > 1:966215/1‑150 (MQ=255) ccTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTggc < 2:188547/150‑1 (MQ=255) ccTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTggc > 1:188547/1‑150 (MQ=255) ccTGCACGCTAGTGCGCGCCGGCAAGAAATCGCCGTCGAGGAGCTTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTggc < 2:1330264/150‑1 (MQ=255) cTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTggcg > 2:796883/1‑150 (MQ=255) tGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTctgct < 2:775856/145‑1 (MQ=255) tGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTctgct > 1:775856/1‑145 (MQ=255) tGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTggcgg > 1:1792478/1‑150 (MQ=255) tGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTggcgg > 1:1336768/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGcc > 2:618509/1‑150 (MQ=255) 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gACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCCCTGCGCCGACTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTCGGTCATTGCgg > 2:1454779/1‑150 (MQ=255) cGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATc < 1:1903330/150‑1 (MQ=255) gAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATcc > 2:1575914/1‑150 (MQ=255) gAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATcc > 1:379177/1‑150 (MQ=255) cgcACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTgg < 2:1428644/150‑2 (MQ=255) 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CTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGActgc > 1:896597‑M1/1‑137 (MQ=255) CTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGActgc < 2:896597‑M1/137‑1 (MQ=255) ggccaatcaacgccggcagggcgacggccaggTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTAt > 1:2107809‑M2/33‑68 (MQ=255) ggccaatcaacgccggcagggcgacggccaggTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTAt < 2:2107809‑M2/36‑1 (MQ=255) tCGCTCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCAtt > 1:1346440/1‑150 (MQ=255) tCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCAtt < 1:904331/150‑1 (MQ=255) tCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCAtt < 1:291313/150‑1 (MQ=255) tCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCAtt > 2:904331/1‑150 (MQ=255) cccTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGc < 2:179125/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCt > 2:2045416/1‑150 (MQ=255) ctaccGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCta > 1:2404514/4‑149 (MQ=255) cTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTc > 1:2044266/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTc > 2:2362361/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTc > 2:2379636/1‑116 (MQ=255) tGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTc < 1:2379636/116‑1 (MQ=255) ccGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTcgcg > 2:2325256/1‑150 (MQ=255) gTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCgcgcgc > 2:1859059/1‑78 (MQ=255) gTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCgcgcgc < 1:1859059/78‑1 (MQ=255) tGATTGGCCAGGTTGGCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGGCGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTCGCGGGCCTGa < 2:1171398/150‑1 (MQ=255) gttcggccaggtTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTCGCGGGCCTGAc > 2:1766734‑M2/13‑150 (MQ=255) gATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTCGCGGGCCTGAc > 1:821371/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTCGCGGGCCTGACgg > 2:223683/1‑150 (MQ=255) gccaggtTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTCGCGGGCCTGACGGTTa > 2:861860‑M2/8‑150 (MQ=255) gccaggtTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCGACCTTCTCCTCGCGCAGTTGCTCGCTGGCCTCACGGTTa > 2:1040176‑M2/8‑150 (MQ=255) aggtTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCTGCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTCGCGGGCCTGACGGTTACTg < 1:762808‑M2/146‑1 (MQ=255) | ACGGCCGCGGTTGGCCTGCACGCTGGTGCGCGACGGCGAGCGCACACCGTCGAAGGCATTGTTGCGGGCACGGCCTGCCGTATTGGCAGGACGGCTCTGCGCCGGCTGCCGCACCTGGCCGTCGCCCTGCCGGCGTTGATTGGCCAGGTTGCCGTTCTGCTGGCGGCCTTGGTCATTGCGGGTATCCTGCCGACGGTCAGTAGCCCGCGCGCCATCATCCCGGGACAGCATGCGGTTGCCGTCGGGACTGCCTGCCTTGGCCTCGCGCATTTGCTCGCGGGCCTGACGGTTACTG > NC_002947/3991772‑3992066 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |