New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3996848 = | 92 (1.040) | 6 (0.070) | 4/234 | NT | 6.1% | coding (359/480 nt) | PP_3525 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3996892 = | 96 (1.140) | coding (315/480 nt) | PP_3525 | hypothetical protein |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TTCTCCAGTGCAGCCTTCAACGCCGCTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTGGCACCGTCCAT > NC_002947/3996743‑3997041 | tcCAGTGCAGCCTTCAACGCCGCTGCATCGTTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTg > 1:1863014/1‑150 (MQ=255) tcCAGTGCAGCCTTCAACGCCGCTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTg > 2:975060/1‑150 (MQ=255) tGCAGCCTTCAACGCCGCTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATc > 2:1774503/1‑150 (MQ=255) tggaagcacgcgccgctgtattcgtggccgacattcagcgcatgcctgcgctgatcagcaaactgttcgcggtcccggccatgcgcgattacagcTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATcgc > 1:1761218‑M1/96‑150 (MQ=255) aGCCTTCAACGCCGCTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATcgcg > 1:685247/1‑150 (MQ=255) ccTTCAACGCCGCTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCCACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCa > 2:1965259/1‑150 (MQ=255) ccTTCAACGCCGCTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCa > 2:93591/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGCTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACAAGCACGCAATCCTGTAGTCGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCTATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGcc > 1:2223639/1‑150 (MQ=255) gccgcTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCggg > 2:716674/1‑150 (MQ=255) gccgcTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCggg > 2:846691/1‑150 (MQ=255) ccgcTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGa < 2:685247/150‑1 (MQ=255) gcTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGAcc > 2:229401/1‑150 (MQ=255) gcTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGAcc > 1:2142358/1‑150 (MQ=255) cATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGa < 1:1677930/150‑1 (MQ=255) aTCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGaa < 1:93591/150‑1 (MQ=255) aTCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGaa < 1:229401/150‑1 (MQ=255) gTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCCCCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGACCAGt > 1:528796/1‑150 (MQ=255) gAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGACGGGACCGCGAACAGttt < 1:2373674/150‑1 (MQ=255) 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ccATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTgcc > 2:1661012/1‑150 (MQ=255) cATCACGGCAGAGCAGCACCTGGTAGCTCTAATCGCGCATGGCCGGCACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTgccc > 2:26841/1‑149 (MQ=255) tCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTgccgcc > 1:1816601/1‑150 (MQ=255) ggTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGa < 2:1816601/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGAc < 2:2223639/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGAc < 2:706977/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGAcc > 2:322745/1‑150 (MQ=255) agcaCCCGGTAGCTGTAATCACGCATGCCAGGGACCGCGAACAGTTTGCGGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTg < 2:1000329/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTGGCa > 2:109323/1‑150 (MQ=255) aCCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTGGCa < 2:2254271/150‑1 (MQ=255) ccggtaGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGAc < 2:2130011‑M2/132‑1 (MQ=255) ccggtaGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGAc > 1:2130011‑M2/7‑138 (MQ=255) cggtaGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCt < 1:933936‑M2/137‑1 (MQ=255) cggtaGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCt > 2:933936‑M2/6‑142 (MQ=255) ggtaGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTGGCACCGt < 2:500062‑M2/146‑1 (MQ=255) gtaGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTg > 2:549908‑M2/4‑142 (MQ=255) gtaGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTg < 1:549908‑M2/139‑1 (MQ=255) gtaGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTGGCACCGTc < 1:1319071‑M2/147‑1 (MQ=255) gCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTGGCACCGTCCat > 1:2183999/1‑150 (MQ=255) | TTCTCCAGTGCAGCCTTCAACGCCGCTGCATCGGTGAACGCCCGCTGGCTGACCAGCACGCCCTGCTGCAGTTGCAACCACTGCACCTGGCCCTCCTGCCCGGGGTACCGGCTGGCCACTCGCCCATCACGGTCGAGCAGCACCCGGTAGCTGTAATCGCGCATGGCCGGGACCGCGAACAGTTTGCTGATCAGCGCAGGCATGCGCTGAATGTCGGCCACGAATACAGCGGCGCGTGCTTCCAGGTAGCCCTTGGGCTGCTCGGCCAGTGCCGCCTTGACCAGCTTGGCACCGTCCAT > NC_002947/3996743‑3997041 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |