| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
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cccAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGtg < 1:2403117/55‑1 (MQ=255) ccAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGc > 2:2042187/1‑150 (MQ=255) ccAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATACCTCCCGTATGTAGCGCAGACGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGc > 2:760315/1‑150 (MQ=255) cAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGTGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAgg < 2:1998325/144‑1 (MQ=255) cAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAgg > 1:1998325/1‑144 (MQ=255) agagGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCTg > 1:1605189/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) cgccTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCt < 2:603683/137‑1 (MQ=255) cgccTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCt > 1:603683/1‑137 (MQ=255) gccTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCTGCCACGCCCATCTg > 2:78451/1‑150 (MQ=255) tGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCTGCCACGCCCATCTGCGt < 2:1302275/150‑1 (MQ=255) tGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCTGCCACGCCCATCTGCGt > 1:2329228/1‑150 (MQ=255) ccGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAgcgc < 2:2341912/91‑1 (MQ=255) ccGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAgcgc > 1:2341912/1‑91 (MQ=255) ggtcaTCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTg < 2:279812‑M2/70‑1 (MQ=255) ggtcaTCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTg > 1:279812‑M2/6‑75 (MQ=255) ggtcaTCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCTGCCACGCCCATCTGCGTCACGCTACa < 1:78451‑M2/145‑1 (MQ=255) aTCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCTGCCACGCCCATCTGCGTCACGCTACAGGcc > 2:841081‑M2/2‑150 (MQ=255) | CACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCTGCCACGCCCATCTGCGTCACGCTACAGGCC > NC_002947/4742554‑4742849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |