| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4755172 = | 103 (1.160) | 6 (0.070) | 4/228 | NT | 6.2% | coding (368/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| ? | NC_002947 | 4755215 = | 86 (1.050) | coding (411/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCATAGCGGCGCCGAGGTGATGGC > NC_002947/4755069‑4755364 | gCCGTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CATCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGc < 2:1566055/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGc > 2:1709049/1‑150 (MQ=255) cGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCAc < 1:300432/150‑1 (MQ=255) ttCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGcc > 1:1540077/1‑150 (MQ=255) tgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCaa > 1:368616‑M1/93‑150 (MQ=255) tCCAGGGCTCCCACCCGATTCCCGCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTc < 2:1641537/150‑1 (MQ=255) aGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGc > 1:397727/1‑150 (MQ=255) aGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGc > 1:1807913/1‑150 (MQ=255) tACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCAAGCACTCTCCGGCGGCACACAACAGCCAGCCCACTGCC‑‑GCCC‑CACCACCACCCCCCCCGGCCGCCGGGTCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCaa < 2:1479002/150‑1 (MQ=255) caccTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTa > 1:1380791/1‑150 (MQ=255) accTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGACCGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTAt > 1:770311/1‑150 (MQ=255) ccTCATCCCCTGCGGCCCAGCCCCGGAAAACGTCGAGATCCCAGCCATCTCCGCCGGTACAG‑‑CCGCA‑CCCGAACGACAGACCCCCCCCCCCGCCCGGCTTGGCGCCCTTGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATc > 2:880130/1‑150 (MQ=255) cTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATcc > 1:189160/1‑150 (MQ=255) cTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGATAAGCTGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATcc < 1:1641667/150‑1 (MQ=255) gATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCgg > 2:818593/1‑150 (MQ=255) ctCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTCCGCCGGGACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGGCAGCCGCACCGCCAACCGTCCACATCAATTATCCGGt < 1:1954049/149‑1 (MQ=255) aTCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGt > 2:1401981/1‑150 (MQ=255) aTCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGt > 2:2113182/1‑150 (MQ=255) tCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAATTGTAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTg < 1:2222346/150‑1 (MQ=255) tCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTg < 1:196706/150‑1 (MQ=255) cccTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGc > 1:1162282/1‑150 (MQ=255) cccTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGCCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCACTTATCCGGTGGc > 1:235654/1‑150 (MQ=255) ccTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGcc > 1:1274824/1‑150 (MQ=255) cTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAgcagca > 1:830736/1‑150 (MQ=255) cAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAAc < 1:1709049/150‑1 (MQ=255) aGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACg < 1:1122102/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGAAAACGTACAGACGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACgg < 2:1757938/150‑1 (MQ=255) cAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCGGCCACGGTtc > 2:172842/1‑150 (MQ=255) aGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGtct > 2:845488/1‑150 (MQ=255) ggAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGtctc < 2:666034/150‑1 (MQ=255) aaaaCGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGa < 2:189160/150‑1 (MQ=255) aaaCGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGt < 1:1883861/144‑1 (MQ=255) aaaCGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGt > 2:1883861/1‑144 (MQ=255) aaaCGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACAGCACGGCTCTGCAAGCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGAt > 2:803616/1‑150 (MQ=255) tCGATATGCTAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGccc < 2:1714101/150‑1 (MQ=255) cGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCg < 2:1328073/150‑1 (MQ=255) gaTGCCAGCCATCTACGCCGGTCCCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGc < 1:17775/150‑1 (MQ=255) agccaTCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgat > 2:430724/1‑150 (MQ=255) 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caggcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcCAGCCGCCCCTCGAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCAtcctggcagatcggacg > 1:61272‑M2/42‑143 (MQ=255) caggcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtg < 2:2165703‑M2/73‑1 (MQ=255) caggcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtg > 1:2165703‑M2/42‑114 (MQ=255) caggcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGc < 1:82784‑M2/85‑1 (MQ=255) caggcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGc > 2:82784‑M2/42‑126 (MQ=255) AGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAAc > 1:613323‑M1/1‑56 (MQ=255) AGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAAc < 2:613323‑M1/56‑1 (MQ=255) AGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGAAGCCACGGGCCTCGATTCCCCGGGCCTTTATGAACGGTGGCCACAGCATCCTGGCCGACGaaccaa < 2:529190‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGaaccaacc < 1:1706982‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCg > 2:1162282‑M1/1‑150 (MQ=255) CCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGACCCGGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGTTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCgg < 1:2244910‑M1/150‑1 (MQ=255) cccTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACa > 2:2064883/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGc > 1:78059/1‑150 (MQ=255) tGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGaaccaac < 2:1491711/133‑1 (MQ=255) tGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGcc > 2:172664/1‑150 (MQ=255) tGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGcc > 2:1265707/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACgg < 2:1208501/73‑1 (MQ=255) gCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACgg > 1:1208501/1‑73 (MQ=255) gCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCa < 2:548526/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCg > 1:886529/1‑83 (MQ=255) ggCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCg < 2:886529/83‑1 (MQ=255) ggCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCATAgc < 2:1845387/150‑1 (MQ=255) cctgggcctggCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCATAGCGgcgc > 1:160479/1‑150 (MQ=255) ctgggcctggCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCATAGCGGCGcc > 2:1990671/1‑150 (MQ=255) ggcctggcCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCATAGCGGCGCCGAg < 2:1393462‑M2/142‑1 (MQ=255) ggcCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCATAGCGGCGCCGAGGTGAt < 1:818593‑M2/147‑1 (MQ=255) ggcCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCATAGCGGCGCCGAGGTGAt < 1:494546‑M2/147‑1 (MQ=255) cAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGGACGTTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCATAGCGGCGCCGAGGTGATGgc > 1:162187/1‑150 (MQ=255) | GCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCC‑‑CAGCC‑GCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACCGGCGCCCTCGACAGCCATAGCGGCGCCGAGGTGATGGC > NC_002947/4755069‑4755364 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |