| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6032808 = | 31 (0.980) | 8 (0.340) | 10/200 | 1.3 | 28.4% | intergenic (+16/+120) | dppA‑IV/PP_5284 | dipeptide transport protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 6032890 = | 17 (0.720) | intergenic (+98/+38) | dppA‑IV/PP_5284 | dipeptide transport protein/hypothetical protein | |||||
GATCCAGCAGCAGGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCA > NC_002947/6032660‑6032956 | tgtcgttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggcccttt < 1:250997‑M1/2‑1 (MQ=255) ttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg > 2:313081‑M1/144‑150 (MQ=255) ttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg > 1:551465‑M1/144‑150 (MQ=255) ttgaagcggggccaggagttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg < 2:794427‑M1/7‑1 (MQ=255) gggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtactggccctTTCGCGGGTAAAcc > 1:24888‑M1/137‑150 (MQ=255) tgtgGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:737272/150‑1 (MQ=255) tggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:467782‑M1/20‑1 (MQ=255) cACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATAGCAGTTAGGTGACGGGGACCAAGTAAGCCTGAACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggg > 1:418481/1‑150 (MQ=39) attgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg < 2:768783‑M1/7‑1 (MQ=255) attgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg > 1:768783‑M1/123‑129 (MQ=255) aCTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGt > 2:273867/1‑150 (MQ=255) tGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAg > 2:559715/1‑150 (MQ=255) ggCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAgc < 1:559715/150‑1 (MQ=255) aCCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCgg < 1:415751/120‑1 (MQ=255) aCCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCgg > 2:415751/1‑120 (MQ=255) cccGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGc < 1:566291/150‑1 (MQ=255) ggcgACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGt‑t < 1:672693/150‑1 (MQ=255) tcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCGGTCGCGCccgcctgggaggtg < 2:185848‑M1/48‑7 (MQ=255) atcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGc > 1:185848‑M1/99‑150 (MQ=255) cTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCt > 1:619550/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTa < 2:396405/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTa < 1:775897/150‑1 (MQ=255) gctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTcgcg < 1:195095/100‑1 (MQ=255) gctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTcgcg > 2:195095/1‑100 (MQ=255) gcCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTCAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGt < 2:555248/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTACCCCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCgg < 2:473076/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGGCCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTaaa < 2:25391/82‑1 (MQ=255) ccAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGGCCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTaaa > 1:25391/1‑82 (MQ=255) ggTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGaaa > 1:130893/1‑150 (MQ=255) ggTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa < 1:715730/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAAAggg < 2:130893/150‑1 (MQ=255) gattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCt > 2:467421‑M1/52‑110 (MQ=255) gattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCt < 1:467421‑M1/59‑1 (MQ=255) ggcTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa < 2:523137/133‑1 (MQ=255) ggcTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa > 1:523137/1‑133 (MQ=255) attgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAAc > 1:691753‑M1/51‑63 (MQ=255) attgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAAc < 2:691753‑M1/13‑1 (MQ=255) tGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCtata < 2:619550/150‑1 (MQ=255) aaGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGt > 1:667732/1‑150 (MQ=255) gacggtgacCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGATAGCGCCAGACTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGAGGTTACCTGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGACCCTCatttaccc > 1:794427/1‑143 (MQ=37) tgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTAc > 2:592775‑M1/31‑85 (MQ=255) tgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTAc < 1:592775‑M1/55‑1 (MQ=255) cAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGaacc > 1:518345/1‑147 (MQ=255) gTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACaa > 2:150300/1‑150 (MQ=255) 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GATCCAGCAGCAGGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCA > NC_002947/6032660‑6032956 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |