| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4876493 | 140 (1.920) | 14 (0.210) | 9/222 | NT | 10.4% | intergenic (+286/+151) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
| ? | NC_002947 | = 4876523 | 116 (1.780) | intergenic (+316/+121) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase | |||||
TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4876334‑4876493‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacccgctcctacGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTATC < NC_002947/4876523‑4876377 TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAC > 2:1456022/1‑150TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAC < 2:1778782/150‑1 GCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCT < 1:1560065/150‑1 CGGGTAAACCCCCTCCTACAAGGGCTGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTC < 2:656534/150‑1 ttacccCCCGCCGTACTCTCGCGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCACCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAG < 2:744251/144‑1 ACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGA < 1:470739/150‑1 GCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGT > 2:1829884/1‑149 GCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGT < 1:1829884/149‑1 GGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAC > 2:1593305/1‑85 GGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAC < 1:1593305/85‑1 GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATG < 1:987317/134‑1 GGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATG > 2:987317/1‑134 GCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTAC > 1:1600645/1‑124 GCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTAC < 2:1600645/124‑1 CAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTA < 1:1227984/96‑1 CAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTA > 2:1227984/1‑96 CAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTG > 2:1005722/1‑93 CAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTG < 1:1005722/93‑1 CAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGC > 1:793916/1‑57 CAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGC < 2:793916/57‑1 AATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < 1:473317/115‑1 AATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > 2:473317/1‑115 AACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACTGCAGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGC < 1:1691688/150‑1 AACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGC < 1:891114/150‑1 ACCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCG > 2:932839/1‑150 CCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGG < 2:1330506/130‑1 CCCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGG > 1:1330506/1‑130 CCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGG < 1:447666/150‑1 CCGCTCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGG > 2:198558/1‑150 TCCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGT < 2:1006825/150‑1 CCTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTA < 2:1108889/150‑1 CTACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTAT > 1:1144279/1‑150 TACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTATC > 2:577069/1‑150 TACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTATC < 1:1781116/150‑1 TACGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTATC < 1:932839/150‑1 TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4876334‑4876493‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacccgctcctacGACGGGCTGTGTCCAACTGTCCACCCCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTAGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGTATC < NC_002947/4876523‑4876377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |