New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4876493 | 140 (1.920) | 14 (0.210) | 9/222 | NT | 10.4% | intergenic (+286/+151) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
? | NC_002947 | = 4876523 | 116 (1.780) | intergenic (+316/+121) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
ACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTAGCGACCA > NC_002947/4876347‑4876642 | aCCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAc < 2:1440739/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACg > 1:577069/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACgg > 2:1133623/1‑150 (MQ=255) cTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCACCAATAGTCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGt < 2:59209/150‑1 (MQ=255) tCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTg < 1:1464182/150‑1 (MQ=255) tCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTg < 1:1697455/150‑1 (MQ=255) tACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGAc > 1:926755/1‑150 (MQ=255) aCAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACa > 1:772973/1‑150 (MQ=255) cAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAg < 1:1687970/150‑1 (MQ=255) aaCGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCACCCGGCCAATCGCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCCTTCGCGCGTACCCCCGCTCCTACCACGGGGTGCACAGt > 2:205381/1‑150 (MQ=18) aCGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGtt < 2:1062289/150‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTCCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGtt < 2:47940/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGAGAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACGCGCGAGGGGGCGGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTg < 1:525844/150‑1 (MQ=17) tggACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTg > 2:706543/1‑136 (MQ=255) tggACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTg < 1:706543/136‑1 (MQ=255) gATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgta < 1:1781116‑M2/150‑4 (MQ=255) gATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgta < 1:932839‑M2/150‑4 (MQ=255) gATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGCTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTCCCGCCACCACCGCATTCGCCCGTAAACCCCCCCCTCCCCCCGGCTGGACCCTTGGCCACAGccccccccc > 2:1168701/1‑144 (MQ=17) 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cccGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcgg < 1:447666‑M2/150‑11 (MQ=255) cgccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcgggt > 2:932839‑M2/1‑138 (MQ=255) gccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCTGCAGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcgggtt < 1:1691688‑M2/150‑14 (MQ=255) gccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggt < 1:1829884‑M1/149‑43 (MQ=255) ccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGa < 2:1154116/125‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCcgc > 2:405172/1‑150 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGc > 2:357668/1‑121 (MQ=255) ggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTg > 2:1416382/1‑104 (MQ=255) ggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 2:772973/150‑1 (MQ=255) ttCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAgg < 1:405172/150‑1 (MQ=255) ccACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGc < 2:606921/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCg < 1:1302245/150‑1 (MQ=255) cccGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcggg > 1:1330506‑M2/1‑119 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGc > 2:855068/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGc > 1:1845499/1‑150 (MQ=255) cgcgAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGca > 1:339896/1‑150 (MQ=255) 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aCCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacggc > 2:1829884‑M2/1‑42 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGAttct > 1:893283/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcggg < 2:1330506‑M1/130‑120 (MQ=255) ccGCTCCTACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacggcggg > 2:198558‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGAttcttc > 1:432920/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGAttcttc > 1:1128849/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATtcttct < 2:1177781/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTa > 1:21730/1‑150 (MQ=255) tCCTACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacggcgggctgt < 2:1006825‑M1/150‑145 (MQ=255) tCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTAGc < 2:535808/150‑1 (MQ=255) tCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTAGc < 1:1250974/150‑1 (MQ=255) tACgacgggctgtgtccaactgtccaccccgtggtaggagcgggtttacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattggccagcagggccggcctcttcgcgggtgaacccgctcctacggcgggctgtatc > 2:577069‑M1/1‑3 (MQ=255) tACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaatgcggtggtggcggcaacggtgaacggcgggtagggattg < 1:1227984‑M2/96‑64 (MQ=255) tACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTAGCGAc < 1:855068/150‑1 (MQ=255) | ACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGCAAAAAACAGCAGACG‑AAAAAAAGCCCGCCAGTGTGAGAGCGGGCCAAAGGACCTACGAAGATTCTTCTAGCGACCA > NC_002947/4876347‑4876642 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |