New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5681397 = | 63 (0.860) | 3 (0.050) | 3/202 | NT | 5.6% | intergenic (‑63/+145) | PP_4986/PP_4987 | hemolysin III family channel protein/putative Chemotaxis protein |
? | NC_002947 | 5681512 = | 50 (0.840) | intergenic (‑178/+30) | PP_4986/PP_4987 | hemolysin III family channel protein/putative Chemotaxis protein |
GCGGATCTGCAACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5681568‑5681397 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCA > NC_002947/5681512‑5681657 GCGGATCTGCAACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTT > 1:1187497/1‑150 CGGATCTGCAACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTC < 1:1742608/150‑1 GGATCTGCAACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCG > 2:1336632/1‑150 GATCTGCAACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGC < 2:549499/150‑1 GATCTGCAACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGGGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTCCGCAGCAGCCCCGGCGGGTCATGCAGTGGCAATGAAAACCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCac > 1:680888/1‑148 GATCTGCAACCTGACATTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGC > 2:512345/1‑150 TCTGCAACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGA < 2:1187497/150‑1 TGCAACCTGACCTTGGTAAGGCTGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCGGGGGTGGGAGCGGCCTTGTGGCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCAGGCCGTGGCAATGAAAGCCTGTGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACA > 2:908771/1‑150 AACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAA < 2:1743059/150‑1 ACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAG > 1:1568213/1‑150 CTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGC < 1:908771/150‑1 ACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGC < 1:653710/150‑1 CCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCT > 2:361918/1‑150 gggGGTGAGGAGGTGGGGCGCAGGGCCTGGGGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTC < 2:10177/147‑1 CTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTTTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATAAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTC > 2:638513/1‑150 CTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTC > 2:227890/1‑150 TTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTTGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCC > 1:666315/1‑150 TTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCC < 1:987689/150‑1 GGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCA < 1:1620884/150‑1 GTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCAC > 2:260246/1‑150 TTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCC < 1:1743848/147‑1 TTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCC > 2:1743848/1‑147 GGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGC > 2:1301997/1‑117 GGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGC < 1:1301997/117‑1 GGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGC > 1:230739/1‑94 GGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGC < 2:230739/94‑1 GCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATC > 1:1563353/1‑150 CGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCC > 1:1024809/1‑150 GCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGC < 2:1563353/150‑1 GCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGC > 2:995442/1‑150 GCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTAC < 1:96752/117‑1 GCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTAC > 2:96752/1‑117 AAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCC > 1:1074910/1‑150 AGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCA > 1:1836355/1‑150 AGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCC < 1:592809/104‑1 AGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCC > 2:592809/1‑104 GGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCGCATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAA > 1:1572182/1‑150 GGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAA > 2:1735605/1‑150 CCGCTACCACTCCCGACCACCAGGCCCTGCGCCGCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGGCCGGGACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTCCCAGCTCCACCC > 2:384057/1‑150 CTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGC < 2:1024809/150‑1 TCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCC < 1:666094/150‑1 CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCC > 2:1094716/1‑150 CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCC < 1:405910/150‑1 CCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCA < 2:653710/150‑1 CCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGC < 2:1134006/147‑1 CCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGC > 1:1134006/1‑147 CCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCAC < 2:1534635/109‑1 CCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCAC > 1:1534635/1‑109 GCGGATCTGCAACCTGACCTTGGTTAGGATGTGAGGCGCAGGGCCTGGTGGTCTGGAGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATAGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCGGTTCATGCAGTGGCAATGAAAGCCTGGGGCCGCTTCGCGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5681568‑5681397 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCA > NC_002947/5681512‑5681657 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |