New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 97914 | 83 (1.200) | coding (107/414 nt) | PP_0091 | putative lipoprotein |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TCAGGTAGCAGGTTCGGTCCCTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGCCCCCAGTGTACTGAGGGCGATCAGCATCATGGGCTGGCGCATGGCAAAACTCCCACTTGCGATTTACAA > NC_002947/97750‑98047 | gTAGCAGGTTCGGTCCCTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCAc > 1:987086/1‑150 (MQ=255) gTAGCAGGTTCGGTCCCTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGACCATGAcccc > 2:1895725‑M1/1‑146 (MQ=255) aGCACGTTCGGTCCCGTGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTAGTGATCGCA‑CTCTGCTCCTGTATCATGTTTTTCCTTTTTCACCTGAAAATACCGGCCATCGTCCAGTCGCTTGCCTTCGAGGCGGTCGGCCATGATCAccc < 1:443048/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCGGTCCCTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGa > 2:1214139/1‑150 (MQ=255) aGGTTCGGTCCCTGGGTTGTGACATGAGGCAGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGAc > 2:402766/1‑150 (MQ=255) ggTTCGGTCCCTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGAcc > 2:360717/1‑150 (MQ=255) gTTCGGTCCCTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCg > 1:1598055/1‑150 (MQ=255) gTTCGGTCCCTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCg > 1:636417/1‑150 (MQ=255) tCGGTCACTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGATTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCggg < 2:263843/150‑1 (MQ=255) tCCCTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGtc > 1:344299‑M2/1‑148 (MQ=255) cTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCGCCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGtcatg > 2:914435‑M2/1‑145 (MQ=255) cTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGtcatg < 1:1525119‑M2/150‑6 (MQ=255) tGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTCCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGtcatgg > 2:1404886‑M2/1‑144 (MQ=255) 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> 2:1764986‑M1/1‑120 (MQ=255) aCATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTAGTCCAGGTAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGAt > 1:1021298/1‑150 (MQ=255) gccgccCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCa > 2:928566/1‑150 (MQ=255) gTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACGGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCtt > 1:16627/1‑150 (MQ=255) tAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGtcat > 1:812288‑M2/1‑118 (MQ=255) tAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGtcat < 2:812288‑M2/122‑5 (MQ=255) 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cATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGA‑CCCCCGGTCGGGTGatcatggccgaccgcctcgacg > 1:464901‑M2/1‑110 (MQ=255) aTCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACggg < 1:928566/150‑1 (MQ=255) tCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGggc > 1:1695720/1‑150 (MQ=255) gaggcgcACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGggcgg > 1:375721/4‑150 (MQ=255) gcgcACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGtcatgg < 1:660786‑M2/107‑7 (MQ=255) gcgcACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGtcatgg > 2:660786‑M2/1‑101 (MQ=255) gcACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAgg > 1:552352/1‑150 (MQ=255) caccacCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAggg < 2:231612/150‑1 (MQ=255) ccaccaGT‑TCACGACTGCCCGGTGGCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGc < 1:401409/150‑1 (MQ=255) caccaGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTgggg > 1:469792/1‑130 (MQ=255) caccaGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCt > 1:405150/1‑150 (MQ=255) 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< 1:396429/150‑1 (MQ=255) aGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGgcg > 2:266381/1‑150 (MQ=255) t‑tCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCa > 2:1342563/1‑150 (MQ=255) aTGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTAACGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCaa < 1:1388737/148‑1 (MQ=255) gCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGccc > 2:921685/1‑150 (MQ=255) cTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGcccc < 1:266381/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ggCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGCCCCCAGTGTACTGAGGGCGATCAGCATCATGGGCTGGCGCATGGCAAAACTCCCACTTGCGAt < 1:1342563/150‑1 (MQ=255) gCCATGATCACCCGACCGGGGGtcatggtcgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacaccgggcaagcatgaactggtggtgcgcttcgattatgaaatctactcgggcggcctcatgtcacaaccc < 1:1895725‑M2/150‑129 (MQ=255) gCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTgg > 2:768733/1‑55 (MQ=255) gCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTgg < 1:768733/55‑1 (MQ=255) ccATGAcccccggtcgggtgatcatggccgaccgcctcgacgggaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacaccgggcaagcatgaactggtggtgcgcttcgattatgaaatctactcgggcggcctcatgtcacaaccca > 2:1404886‑M1/1‑6 (MQ=255) ccATGAcccccggtcgggtgatcatggccgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacaccgggcaagcatgaactggtggtgcgc > 2:660786‑M1/1‑6 (MQ=255) cATGAcccccggtcgggtgatcatggccgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacaccgggcaagcatgaactggtggtgcgcttcgattatgaaatctactcgggcggcctcatgtcacaacccag < 1:1525119‑M1/150‑146 (MQ=255) cATGATCACCCGACCGGGGGtcatggccgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacactgggcaagcatgaactggtggtgcgcttcgattatgaaatctactcgggcggcctcatgt < 1:1764986‑M2/140‑121 (MQ=255) cATGATCACCCGACCGGGGGtcatggccgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacactgggcaagcatgaactggtggtgcgcttcgattatgaaatctactcgggcggcctcatgt > 2:1764986‑M2/1‑20 (MQ=255) cATGATCACCCGACCGGGGGtcatggccgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtg > 1:132025‑M2/1‑20 (MQ=255) cATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGCCCCCAGTGTACTGAGGGCGATCAGCATCATGGGCTGGCGCATGGCAAAACTCCCACTTGCGATTTa > 2:376854/1‑150 (MQ=255) aTGAcccccggtcgggtgatcatggccgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacaccgggcaagcatgaactggtggtgcgcttcgattatgaaatcta < 2:812288‑M1/122‑119 (MQ=255) aTGAcccccggtcgggtgatcatggccgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacaccgggcaagcatgaactggtggtgcgcttcgattatgaaatcta > 1:812288‑M1/1‑4 (MQ=255) aTGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGCCCCCAGTGTACTGAGGGCGATCAGCATCATGGGCTGGCGCATgg < 2:509529/127‑1 (MQ=255) aTGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGCCCCCAGTGTACTGAGGGCGATCAGCATCATGGGCTGGCGCATgg > 1:509529/1‑127 (MQ=255) aTGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGCCCCCAGTGTACTGAGGGCGATCAGCATCATGGGCTGGCGCATGGCAAAACTCCCACTTGCGATTTAc < 1:1362186/150‑1 (MQ=255) gAcccccggtcgggtgatcatggccgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacaccgggcaagcatgaactggtggtgcgcttcgattatgaaatctactcgggcggcctcatgtcacaacccaggga > 2:226271‑M1/1‑2 (MQ=255) gAcccccggtcgggtgatcatggccgaccgcctcgacggcaagcgcctggacgatggccggtactttcaggtgacaccgggcaagcatgaactggtggtgcgcttcgattatgaaatctactcgggcggcctcatgtcacaacccaggga > 1:344299‑M1/1‑2 (MQ=255) gATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGCCCCCAGTGTACTGAGGGCGATCAGCATCATGGGCTGGCGCATGGCAAAACTCCCACTTGCGATTTACaa < 2:1598055/150‑1 (MQ=255) | TCAGGTAGCAGGTTCGGTCCCTGGGTTGTGACATGAGGCCGCCCGAGTAGATTTCATAATCGAAGCGCACCACCAGT‑TCATGCTTGCCCGGTGTCACCTGAAAGTACCGGCCATCGTCCAGGCGCTTGCCGTCGAGGCGGTCGGCCATGATCACCCGACCGGGGGTCATGGTGTACAGATCGACCCAGGCCTGCTTGGGGTCGACGGGCGGCAAGGGGCTGGCGCAAGCCCCCAGTGTACTGAGGGCGATCAGCATCATGGGCTGGCGCATGGCAAAACTCCCACTTGCGATTTACAA > NC_002947/97750‑98047 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |