| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 158816 | 94 (1.370) | coding (1573/1956 nt) | PP_0149 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TAGCCTTTGGAATCGAGCAACTCTGCCGGGCGGCTGAGAAAACCGCTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCT > NC_002947/158650‑158948 | tAGCCTTTGGAATCGAGCAACTCTGCCGGGCGGCTGAGAAAACCGCTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGC < 2:1151398‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGAATCGAGCAACTCTGCCGGGCGGCTGAGAAAACCGTTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCt < 1:18028/150‑1 (MQ=255) aaTCGAGCAACTCTGCCGGGCGGCTGAGAAAACCGCTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCGTGAACTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGcc < 2:247871/150‑1 (MQ=255) 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ccTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGa > 1:309180/1‑150 (MQ=255) ccTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGa > 1:1251050/1‑150 (MQ=255) cTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCCGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGAt > 2:850762/1‑150 (MQ=255) tCGTCCTGGGCCAGCctgcgccggcagcttctgctggcccaggacgaggtcaagcagcgttacctgaatgccgcagccttgaaggatggcagcatcaacaaagccgatgccacgctcaagcaaatgctt < 2:607019‑M1/129‑115 (MQ=255) tCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGAtt < 2:259979/150‑1 (MQ=255) tCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCCGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGAtt < 1:850762/150‑1 (MQ=255) tCGTCCTAGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGAtt < 1:89058/150‑1 (MQ=255) gTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTgg < 1:825251/150‑1 (MQ=255) tCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGt < 1:600400/150‑1 (MQ=255) tGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAAc < 2:1431477/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACt < 1:761220/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACt < 2:969512/150‑1 (MQ=255) gCCAGCctgcgccggcagcttctgctggcccaggacgaggtcaagcagcgttacctgaatgccgcagccttgaaggatggcagcatcaacaaagccgatgccacgctcaagcaaatgcttgccaacagcggttttctcagccgcccggca < 1:1104045‑M1/150‑145 (MQ=255) ccAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGATGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCt < 2:1717890/150‑1 (MQ=255) cagcagAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAAc < 1:310690/123‑1 (MQ=255) cAGCctgcgccggcagcttctgctggcctaggacgaggtcaagcagcgttacctgaatgccgcagccttgaaggatggcagcatcaacaaagccgatgccacgctcaagcaaatgcttgccaacagcggttttctcagccgcccggcaga < 2:89058‑M1/150‑147 (MQ=255) gcagAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTtc > 1:1599650/1‑150 (MQ=255) cagAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGATGTCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTtct > 1:117802/1‑150 (MQ=255) | TAGCCTTTGGAATCGAGCAACTCTGCCGGGCGGCTGAGAAAACCGCTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCT > NC_002947/158650‑158948 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |