New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 242878 | 63 (0.860) | 5 (0.070) | 5/234 | NT | 7.2% | intergenic (+81/‑151) | PP_0190/algQ | disulfide bond formation protein B/transcriptional regulator AlgQ |
? | NC_002947 | = 242890 | 70 (1.020) | intergenic (+93/‑139) | PP_0190/algQ | disulfide bond formation protein B/transcriptional regulator AlgQ |
CTGCTGCTGGCGGTGCTGCCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAGGTGCAGCGGCATCTACCCAGAAGGGAAGAGATC > NC_002947/242729‑243025 | ctgctgctgGCGGTGCTGCCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGC < 2:1445428‑M1/150‑1 (MQ=255) tgctgGCGGTGCTGCCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTAc < 2:1344697/150‑1 (MQ=255) gctgGCGGTGCTGCCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTAcc < 2:549660/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTGCCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGaa < 2:1254614/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTGCCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGaa < 2:1852619/150‑1 (MQ=255) gctgcCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGgc > 1:584849‑M2/1‑148 (MQ=255) tgcCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGgcag > 2:1319688‑M2/1‑146 (MQ=255) tgcCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATCTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGgcag > 2:1252868‑M2/1‑146 (MQ=255) cTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCAcg < 2:1128704/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAGGGGTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCggg > 1:1208854/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCccttcaaggtacgcagcacacaaagttc > 2:464740‑M1/1‑122 (MQ=255) gCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGC‑‑‑CCTTCAAGGtacgcagcacacaaagttcatacaagt > 1:1605048‑M2/1‑123 (MQ=255) tCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGC‑‑‑CCTTCAAGGtacgcagcacacaaagttcatacaagtgttta > 1:464740‑M2/1‑118 (MQ=255) cGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAACACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCAc < 1:16066/150‑1 (MQ=255) gTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAg < 2:643827/118‑1 (MQ=255) gTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAg > 1:643827/1‑118 (MQ=255) tttCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGAGATTAGCGGCACCAATGCGGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGc > 1:784624/1‑150 (MQ=255) ttCCCCACCTTTGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGTGTATTAAACACTTGTATGAACTTTATATGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCa < 2:1491385/150‑1 (MQ=255) cGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATAc > 2:1171878/1‑150 (MQ=255) gCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATAcc > 2:915635/1‑150 (MQ=255) ggCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑aaaaa < 2:784624/150‑1 (MQ=255) aaGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAaacaa < 2:1905811/150‑1 (MQ=255) gAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCccttcaaggtacgcagcacacaaa > 1:755002‑M1/1‑89 (MQ=255) gAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCccttcaaggtacgcagcacacaaa < 2:755002‑M1/113‑25 (MQ=255) gAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACt > 1:175043/1‑150 (MQ=255) cATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGaat < 2:1457268/115‑1 (MQ=255) cATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGaat > 1:1457268/1‑115 (MQ=255) aTGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTc > 2:1933834/1‑150 (MQ=255) aTGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTc < 1:1066993/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCCCGACCAATGGTGAGTTAACAGGGTATTAAAACGTTGTATGTACTCTGCATCGACCACAGCCGGATAACGATGACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCCTGCCAG‑TTAAACAACTGCTc > 1:443589/1‑150 (MQ=255) tGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTCCCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCg > 1:71373/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGc > 1:812043/1‑150 (MQ=255) aGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCctgc < 2:812043/150‑1 (MQ=255) ccATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCa > 2:467180/1‑150 (MQ=255) cATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATg < 2:666591/132‑1 (MQ=255) cATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATg > 1:666591/1‑132 (MQ=255) cATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCAc > 2:1567002/1‑150 (MQ=255) aGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCttt < 1:307837/150‑1 (MQ=255) gcgcGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGgc > 1:910345‑M2/1‑70 (MQ=255) gcgcGACCAATGGTGATGTAACAGGGGATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGgc < 2:910345‑M2/72‑3 (MQ=255) cgACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTTTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCgg < 1:931636/80‑1 (MQ=255) cgACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCgg > 2:931636/1‑80 (MQ=255) aCCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAAtctc > 2:1077367/1‑88 (MQ=255) aCCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAAtctc < 1:1077367/88‑1 (MQ=255) aCCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCg < 1:566934/125‑1 (MQ=255) aCCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCg > 2:566934/1‑125 (MQ=255) aaTGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTgcgc > 2:1844344/1‑150 (MQ=255) ggTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGaata < 1:859422/77‑1 (MQ=255) ggTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGaata > 2:859422/1‑77 (MQ=255) ggTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGGCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGt < 2:71373/150‑1 (MQ=255) gTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTc > 2:1894322/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGc < 2:1208854/150‑1 (MQ=255) aaCAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGc > 1:1700108/1‑150 (MQ=255) aCAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCgtg > 1:66084/1‑145 (MQ=255) aCAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCg > 1:892642/1‑150 (MQ=255) aCAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCGCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCgtg < 2:66084/145‑1 (MQ=255) cAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGa > 2:828824/1‑150 (MQ=255) aGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAg < 1:1894322/150‑1 (MQ=255) aGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTAAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAg < 1:1171878/150‑1 (MQ=255) ggTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGGAAAAAACAATTTC‑CTGTTCTTTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAGGt > 2:1021040/1‑150 (MQ=255) tAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCgtaccttgaagggcagcacacaaagttcatacaagtgtttaataccctgttacatcaccattggtcgcgctaatggcacaaccttgcgccaggtcatgttcttgccaaggtgcggaaacga > 1:464740‑M1/1‑29 (MQ=255) acTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCgtaccttgaagggcagcacacaaagttcatacaagtgtttaataccctgttacatcaccattggtcgcgctaatggcacaaccttgcgccaggtcatgttcttgccaaggtgcggaaacgatacgc > 1:1605048‑M1/1‑24 (MQ=255) acTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAGGTGCAGc < 2:807312/145‑1 (MQ=255) acTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAGGTGCAGc > 1:807312/1‑145 (MQ=255) ttGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCTG‑GACCACACCCCCGCCCAGCCGGCTGGCTTATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGCGGTGCGGTGGCATCt > 1:629308/1‑150 (MQ=255) ttGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAGGTGCAGc < 1:1298654/143‑1 (MQ=255) ttGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAGGTGCAGc > 2:1298654/1‑143 (MQ=255) gTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAGGTGCAGCGGCATCTAc > 1:1197353/1‑150 (MQ=255) tGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGAGGTTCAGCTGCGAGGTGCAGCGGCATCTACCCa < 1:1021040/150‑1 (MQ=255) gAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGgcagcacacaaagttcatacaagtgtttaataccctgttacatcaccattggtcgcgctaatggcacaaccttgcgccaggtcatgttcttgccaaggtgcggaaacgatacgccagcaggc > 2:464740‑M2/1‑28 (MQ=255) gAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAGGTGCAGCGGCATCTACCCAg < 2:175043/150‑1 (MQ=255) cTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCgtggtg < 2:518026/123‑1 (MQ=255) cTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCgtggtg > 1:518026/1‑123 (MQ=255) tttGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGgcagcacacaaagttcatacaagtgtttaataccctgttacatcaccattggtcgcgctaatggcacaaccttgcgccaggtcatgttc < 2:755002‑M2/113‑90 (MQ=255) tttGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGgcagcacacaaagttcatacaagtgtttaataccctgttacatcaccattggtcgcgctaatggcacaaccttgcgccaggtcatgttc > 1:755002‑M2/1‑24 (MQ=255) gtgCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCctgc > 2:543863/1‑85 (MQ=255) gtgCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCctgc < 1:543863/85‑1 (MQ=255) 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2:1319688‑M1/1‑4 (MQ=255) gcccttcaaggtacgcagcacacaaagttcatacaagtgtttaatcccctgttacatcaccattggtcgcgc < 2:910345‑M1/72‑71 (MQ=255) gcccttcaaggtacgcagcacacaaagttcatacaagtgtttaataccctgttacatcaccattggtcgcgctaatggcacaaccttgcgccaggtcatgttcttgccaaggtgcggaaacgatacgccagcaggcaactcaagggcagc > 1:584849‑M1/1‑2 (MQ=255) gcccttcaaggtacgcagcacacaaagttcatacaagtgtttaataccctgttacatcaccattggtcgcgc > 1:910345‑M1/1‑2 (MQ=255) | CTGCTGCTGGCGGTGCTGCCCTTGAGTTGCCTGCTGGCGTATCGTTTCCGCACCTTGGCAAGAACATGACCTGGCGCAAGGTTGTGCCATTAGCGCGACCAATGGTGATGTAACAGGGTATTAAACACTTGTATGAACTTTGTGTGCTGCGTACCTTGAAGGGCAGCACGCGCGGGAATAATCTCCCAGCACGCATACCGG‑AAAAACAACTGCTCGATGCCGTCCTGCTGATGTCACCTTTGTGCTGCGCGGTCGTGGTGCGAGGTGCAGCGGCATCTACCCAGAAGGGAAGAGATC > NC_002947/242729‑243025 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |