| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 250495 = | 70 (0.960) | 3 (0.040) | 3/236 | NT | 5.1% | coding (708/1347 nt) | nfeD | membrane bound peptidase NefD |
| ? | NC_002947 | 250540 = | 46 (0.660) | coding (663/1347 nt) | nfeD | membrane bound peptidase NefD | |||||
GCCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAGGCGCAAGGCCTCGCTG > NC_002947/250346‑250642 | ccgactgggcggagaaggccgtgcgcgaggcggtcagcctgtccgccagcgaggccttgcgcctgcacctcctttcacaggtggccgttcacgtgtttgacctgctgcgcaagctcgacggcaaaacgcttcaggtggccggccaaccac > 1:1205134‑M1/150‑150 (MQ=255) ccAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCg > 1:302610/1‑150 (MQ=255) cagcagcagGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCgg < 1:1178865/150‑1 (MQ=255) gcaggcagATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGAt > 1:566674/1‑150 (MQ=255) ggcagATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCt < 2:1560993/150‑1 (MQ=255) agATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGa < 2:316317/150‑1 (MQ=255) aTACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGAcc > 2:1925684/1‑150 (MQ=255) tACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGa > 2:982914/1‑147 (MQ=255) tACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGa < 1:982914/147‑1 (MQ=255) caccGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCCGATGCTCGACCACGc > 2:1348245/1‑150 (MQ=255) accGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCt > 1:1742360/1‑150 (MQ=255) ccGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTg < 1:1777492/150‑1 (MQ=255) cGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTgg < 2:1742360/150‑1 (MQ=255) aCCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGgcg > 2:1445535/1‑150 (MQ=255) aCCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGgcg > 1:266349/1‑150 (MQ=255) cacaCCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCt > 2:604005/1‑144 (MQ=255) cacaCCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCt < 1:604005/144‑1 (MQ=255) acacCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGAGCTACACTGGAGTTGCTAATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCTGCACATGCTCGACCACGCTGGCGCCt > 2:277903/1‑150 (MQ=255) acCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGc > 2:1347146/1‑150 (MQ=255) gCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGt > 2:270021/1‑150 (MQ=255) cccACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATTATCCCCAGAAACCTTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTc < 1:237527/150‑1 (MQ=255) ccACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGATCAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCt > 1:979072/1‑150 (MQ=255) gccgAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAAc > 1:1934527/4‑150 (MQ=255) aaCCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGcc < 1:1383413/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGcc < 1:1445535/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGcc > 1:1339701/1‑150 (MQ=255) cagcgaggccttgcgcctgaacgtgatcgatcaggtggccgatgacctgcctgacctgctgcgcaagctcgacggcaaaacgcttcaggtggccggccaaccaCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTg > 1:1804172‑M1/104‑150 (MQ=255) cATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTggcc < 1:1925684/150‑1 (MQ=255) cATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTggcc < 1:270021/150‑1 (MQ=255) ttCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCg < 1:1357836/121‑1 (MQ=255) ttCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCg > 2:1357836/1‑121 (MQ=255) ttCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCAc > 1:302838/1‑150 (MQ=255) ttCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCAc < 2:266349/150‑1 (MQ=255) gAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCg > 1:1700831/1‑118 (MQ=255) gAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCg < 2:1700831/118‑1 (MQ=255) gAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTg > 2:1784936/1‑150 (MQ=255) gAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTg > 1:1604253/1‑150 (MQ=255) ctgaacgtgatcgatcaggtggccgatgacctgcctgacctgctgcgcaagctcgacggcaaaacgcttcaggtggccggccaaccaCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGcc > 1:892104‑M1/88‑131 (MQ=255) ctgaacgtgatcgatcaggtggccgatgacctgcctgacctgctgcgcaagctcgacggcaaaacgcttcaggtggccggccaaccaCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGcc < 2:892104‑M1/44‑1 (MQ=255) acaacaGGCCGTAAACGCGGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAACCCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGGCACCTGaa > 2:269999/1‑150 (MQ=255) aGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGtt < 2:1339701/150‑1 (MQ=255) ggCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCa > 2:1474149/1‑84 (MQ=255) ggCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCa < 1:1474149/84‑1 (MQ=255) gCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGtttt < 2:1723545/150‑1 (MQ=255) cGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGa > 2:948683/1‑150 (MQ=255) cGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGAc > 2:1871420/1‑82 (MQ=255) cGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGAc < 1:1871420/82‑1 (MQ=255) aTCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGAc > 1:12920/1‑80 (MQ=255) aTCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGAc < 2:12920/80‑1 (MQ=255) aTCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCAcc > 2:96088/1‑126 (MQ=255) aTCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCAcc < 1:96088/126‑1 (MQ=255) gtcaggatcagCCTTAAAGTGGGGTGGGGGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCgcagc < 2:1113595/149‑1 (MQ=255) tcaggatcagCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCgcagca < 2:979072/150‑1 (MQ=255) tcaggatcagCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCCCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCgcagca > 2:1672479/1‑150 (MQ=255) atcagCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCATGCGCAGCAGTTca < 2:566674/150‑1 (MQ=255) tcagCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAACCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcag > 2:759603/1‑150 (MQ=255) agCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCNCCAGAAACCGTGNGCGCCANTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggc > 1:1921737/1‑150 (MQ=255) agCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggc > 1:1922161/1‑150 (MQ=255) gcgcTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggca > 1:697116/1‑150 (MQ=255) gcTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggcagg < 2:1921737/150‑1 (MQ=255) gcTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggcagg < 2:1922161/150‑1 (MQ=255) cTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTg < 2:1310970/93‑1 (MQ=255) cTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTg > 1:1310970/1‑93 (MQ=255) gCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTg < 1:895445/115‑1 (MQ=255) 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gCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTgatc < 2:1484899/143‑1 (MQ=255) aaaCCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAg < 2:697116/150‑1 (MQ=255) tgtgCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAGGCGCaa < 2:1934527/150‑1 (MQ=255) tgtgCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAGGCGCaa > 1:1501565/1‑150 (MQ=255) gtgCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCTGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAGGCGCAAg < 2:655836/150‑1 (MQ=255) gtgCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAGGCGCAAg < 1:1784936/150‑1 (MQ=255) cgcCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAGGCGCAAGGcc < 1:317030/150‑1 (MQ=255) cAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAGGCGCAAGGCCTCg > 2:114787/1‑150 (MQ=255) tCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAGGCGCAAGGCCTCGCTg < 2:1501565/150‑1 (MQ=255) CGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggcag > 2:70543‑M1/1‑102 (MQ=255) CGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggcag < 1:70543‑M1/102‑1 (MQ=255) | GCCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCAGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGATCACGTTCAGGCGCAAGGCCTCGCTG > NC_002947/250346‑250642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |