| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 725740 | 86 (1.180) | 6 (0.080) | 6/244 | NT | 6.0% | coding (162/1203 nt) | PP_0619 | branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 725787 | 105 (1.460) | coding (115/1203 nt) | PP_0619 | branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CACCCCTGGAAGAAGCGTGCACCATCCTGGCCGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCTTGAGCAGGG > NC_002947/725594‑725888 | cACCCCTGGAAGAAGCGTGCACCATCCTGGCCGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGccc > 2:10409/1‑150 (MQ=255) aCCCCTGGAAGAAGCGTGCACCATCCTGGCCGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCa > 1:398368/1‑150 (MQ=255) ccTGGAAGAAGCGTGCACCATCCTGGCCGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGt > 1:507263/1‑150 (MQ=255) tGCACCATCCTGGCCGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGc‑c > 2:1654160/1‑150 (MQ=255) gCACCATCCTGGCCGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGGCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑Cg > 1:931695/1‑150 (MQ=255) cccTGGCCGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTg < 2:1926197/149‑1 (MQ=255) gCCGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGaa > 1:1687485/1‑150 (MQ=255) cGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGtccatgtcgggcgccttcgccagctacggcaagt > 1:1041201‑M1/1‑116 (MQ=255) gATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCTGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGgc > 2:1242246/1‑150 (MQ=255) gATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGgc > 1:423498/1‑150 (MQ=255) gATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGgc < 1:162435/150‑1 (MQ=255) tGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGgcgc > 2:534341/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTACCGGCGTTGCCTTCGGTGTCTATGACTTTGTACTTGCGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGGGCCCGa > 2:867598/1‑150 (MQ=255) tCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGAc < 2:653902/150‑1 (MQ=255) cTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACAt > 1:1619209/1‑150 (MQ=255) tGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATg > 1:458612/1‑150 (MQ=255) tGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATg < 2:1567302/150‑1 (MQ=255) gCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATgg > 1:1844132/1‑150 (MQ=255) gCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATgg > 1:1371513/1‑150 (MQ=255) cACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGa < 1:1654160/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGAc > 1:153693‑M2/1‑149 (MQ=255) ccTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGAct < 1:975893‑M2/150‑3 (MQ=255) ccTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGAct < 1:607231‑M2/150‑3 (MQ=255) cTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGtccatgtcgggcgccttcgccagctacggcaagtacgacgacatgggctc < 2:1041201‑M1/150‑51 (MQ=255) cTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACtt > 2:403443/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACtt > 1:1753101/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACtt < 2:507263/150‑1 (MQ=255) cgcACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGc < 2:1727739/150‑1 (MQ=255) gcACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGcccatgtcgggcgccttcgccagctacggcaagtacgccgac < 2:170416‑M1/137‑43 (MQ=255) gcACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGcccatgtcgggcgccttcgccagctacggcaagtacgccgac > 1:170416‑M1/1‑95 (MQ=255) gcACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGcc < 2:1687485/150‑1 (MQ=255) gcACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGcc > 2:380831/1‑150 (MQ=255) cACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGtccatgtcgggcgccttcgccagctacggcaagtacgccgacat > 1:1724662‑M1/1‑94 (MQ=255) cACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGtccatgtcgggcgccttcgccagctacggcaagtacgccgacat < 2:1724662‑M1/138‑45 (MQ=255) aCCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCa < 1:639013/150‑1 (MQ=255) ccGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCAt > 1:1308460/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTAATTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCAt < 2:398368/150‑1 (MQ=255) cGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGc < 2:1078035/116‑1 (MQ=255) cGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGc > 1:1078035/1‑116 (MQ=255) cGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATa > 1:195746/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGaa < 1:1247348/150‑1 (MQ=255) ttGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAg < 2:195746/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCa > 1:1821001/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAg > 2:560323/1‑150 (MQ=255) gCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGT‑CGTGCACTTAGCGGGCTAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGc > 2:1506401/1‑150 (MQ=255) ttGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGaa < 2:1724688/110‑1 (MQ=255) ttGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGaa > 1:1724688/1‑110 (MQ=255) ccTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTgg < 2:1308460/150‑1 (MQ=255) ttCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTc > 2:778525/1‑150 (MQ=255) ggTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGc < 2:1619209/150‑1 (MQ=255) tgtCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGa > 2:1403508/1‑150 (MQ=255) gATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAg < 1:959787/97‑1 (MQ=255) gATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAg > 2:959787/1‑97 (MQ=255) gATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGc > 1:271076/1‑150 (MQ=255) aTGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTc > 1:1413318/1‑140 (MQ=255) aTGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTc < 2:1413318/140‑1 (MQ=255) gACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCg > 2:1748639/1‑150 (MQ=255) cTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGgt < 2:1460338/150‑1 (MQ=255) tttGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGgtg > 2:1501400/1‑150 (MQ=255) ttGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGgtgt < 1:872680/150‑1 (MQ=255) tACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGcc > 1:1240875/1‑150 (MQ=255) tACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGcc < 1:1403508/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGgtgt > 1:933237/1‑142 (MQ=255) gAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGgtgt < 2:933237/142‑1 (MQ=255) aGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAg > 2:602826/1‑150 (MQ=255) gggTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAgggg < 2:284479/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGgcgc > 1:1310441/1‑81 (MQ=255) ggTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGgcgc < 2:1310441/81‑1 (MQ=255) ggCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGGGCACTTGC‑CGGAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGc < 2:51879/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGc > 1:877006/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCt < 2:877006/150‑1 (MQ=255) gAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGcc > 1:1521461/1‑133 (MQ=255) gAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGcc < 2:1521461/133‑1 (MQ=255) gAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTAcc < 1:778525/150‑1 (MQ=255) gAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTAcc > 1:1659755/1‑150 (MQ=255) cAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTaa < 1:1450988/150‑1 (MQ=255) aaCTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAg < 1:1628315/150‑1 (MQ=255) aaCTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAg < 2:1753101/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCg < 1:970301/99‑1 (MQ=255) ggTGCTCGGCGATGGCGAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCa < 2:262617/150‑1 (MQ=255) tCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCAccctgctca > 2:768986/1‑144 (MQ=255) tCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCa > 1:422141/1‑150 (MQ=255) ggCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAg < 2:1659755/150‑1 (MQ=255) gCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAgg < 2:1371513/150‑1 (MQ=255) cGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGgc < 2:607231/150‑1 (MQ=255) aTGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGgcct < 1:534341/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGgcctgc < 1:560323/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGgcctgcc > 2:89442/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑GGGAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCtt < 1:1128/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCtt < 2:423498/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCtt > 2:642223/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCCCGGCGAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCtt < 1:1506401/150‑1 (MQ=255) ggCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCTTGa < 1:867598/150‑1 (MQ=255) cgAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCTTGAGCAg < 1:89442/150‑1 (MQ=255) gAGCCCATGTCGTCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGActcgcgcctggccatcgccgagcacccgcagttgctcggccacccgctcaagtacaaagtcatcgacaccgaaggcaacgccggcaaggcggtgcgcaag < 2:1041201‑M2/150‑101 (MQ=255) gAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCTTGAGCAgg > 2:801314/1‑150 (MQ=255) aGtccatgtcgggcgccttcgccagctacggcaagtacgccgacatgggctcgcgcctggccatcgccgagcacccgcagttgctcggccacccgctcaagtacaaagtcatcgacaccgaaggcaacgccggcaaggcggtgcgcaagg < 1:975893‑M1/150‑149 (MQ=255) aGtccatgtcgggcgccttcgccagctacggcaagtacgccgacatgggctcgcgcctggccatcgccgagcacccgcagttgctcggccacccgctcaagtacaaagtcatcgacaccgaaggcaacgccggcaaggcggtgcgcaagg < 1:607231‑M1/150‑149 (MQ=255) aGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCTTGAGCAggg > 2:23440/1‑150 (MQ=255) gtccatgtcgggcgccttcgccagctacggcaagtacgccgacatgggctcgcgcctggccatcgccgagcacccgcagttgctcggccacccgctcaagtacaaagtcatcgacaccgaaggcaacgccggcaaggcggtgcgcaaggt > 1:153693‑M1/1‑1 (MQ=255) | CACCCCTGGAAGAAGCGTGCACCATCCTGGCCGATGGCTTCCTGCACCTTGCGCACCGCCTTGCCGGCGTTGCCTTCGGTGTCGATGACTTTGTACTTGAGCGGGTGGCCGAGCAACTGCGGGTGCTCGGCGATGGCCAGGCGCGAGCCCATGTCGGCGTACTTGC‑CGTAGCTGGCGAAGGCGCCCGACATGGACTTGAGCCCATAGAAGGTCAGCGGTTGGTCGGCGAATGCCCGGTGTGCCCCCAAGGGGAGGCTACCTAAGGCACCCAGGGCAAGGCCTGCCTTGAGCAGGG > NC_002947/725594‑725888 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |