New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 911199 = | 83 (1.140) | 7 (0.100) | 6/244 | NT | 8.5% | coding (1704/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
? | NC_002947 | 911251 = | 70 (0.970) | coding (1756/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
GACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGC > NC_002947/911050‑911343 | tcgcgcaggtcacgctcggccagcgcccgctgcagctcatccgctggcggtgcgacgctgaccacaccacgctggccatcgagcagcagcggcgtaccactctccaacagcagtatcgatgcacccgcgccgaccactgctggtatgccc < 1:200270‑M1/1‑1 (MQ=255) tGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGggcgg < 2:561635/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGggcggc < 1:1034748/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGggcggc > 1:830980/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGggcggc < 2:61651/150‑1 (MQ=255) gcgTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACgg < 1:361178/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGcc < 2:55611/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGGTTGCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCcaca > 1:613438/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCcaca > 1:1915494/1‑150 (MQ=255) gcgcAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGt > 1:468616/1‑150 (MQ=255) gcAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGc > 1:518180/1‑150 (MQ=255) ttGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCAtc < 1:816688/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCAtc > 1:1733676/1‑150 (MQ=255) atccgctggcggtgcgacgctgaccacaccacgctggccatcgagcagcagcggcgtaccactctccaacagcagtatcgatgcacccgcgccgaccactgctggtatgccCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCAtcgt < 1:1721805‑M1/39‑1 (MQ=255) ccgctggcggtgcgacgctgaccacaccacgctggccatcgagcagcagcggcgtaccactctccaacagcagtatcgatgcacccgcgccgaccactgctggtatgccCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCAtcgtcg > 2:1170114‑M1/110‑150 (MQ=255) gtgtgCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCGTATGGGCTGGTGGTGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCACACAGTGCCATCGTCGccc > 2:1054/1‑150 (MQ=255) gtgtgCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGccc > 1:420003/1‑150 (MQ=255) tgtgCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCg > 1:625142/1‑150 (MQ=255) 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ggACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGa > 1:1446272/1‑150 (MQ=255) gACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGAt < 1:11811/150‑1 (MQ=255) cccAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGc > 1:1705898/1‑150 (MQ=255) ccAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGcc > 2:1402399/1‑150 (MQ=255) gggTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCgtg < 2:1880963/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCgtggt > 2:1517857/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCgtggt < 2:1730272/150‑1 (MQ=255) ccGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATTGCCAGCgtggtgtgg > 1:1851200/1‑150 (MQ=255) cGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTgg > 2:972470/1‑62 (MQ=255) cGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTgg < 1:972470/62‑1 (MQ=255) cGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCgtggtgtggt < 2:1318673/150‑1 (MQ=255) aTTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGc > 2:200270/1‑150 (MQ=255) aTTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTCGAGAGTGGTTCGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGc < 2:67776/150‑1 (MQ=255) | GACCTGCGCGATATTGGCCGCCGCGTGCTGGCGCAGTTGTGTGGTGTGCAGGCGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGC > NC_002947/911050‑911343 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |