New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 911199 = | 83 (1.140) | 7 (0.100) | 6/244 | NT | 8.5% | coding (1704/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
? | NC_002947 | 911251 = | 70 (0.970) | coding (1756/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
CGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGA > NC_002947/911102‑911399 | cgcAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGCCCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTgg < 1:582315/150‑1 (MQ=255) cgcAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTgg < 2:518180/150‑1 (MQ=255) gcAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTggg > 1:1076665/1‑150 (MQ=255) gcAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTggg < 1:1281323/150‑1 (MQ=255) aGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCa > 1:1065430/1‑150 (MQ=255) aaCCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACcag < 2:420003/150‑1 (MQ=255) cccGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACcagca < 2:1733676/150‑1 (MQ=255) cccGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACcagca < 2:1763811/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACcagcag < 2:1794555/150‑1 (MQ=255) gAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTg > 2:1379073/1‑150 (MQ=255) cccTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGgc > 1:1880963/1‑150 (MQ=255) gccatcgagcagcagcggcgtaccactctccaacagcagtatcgatgcacccgcgccgaccactgctggtatgccCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATAc < 2:1671315‑M1/59‑1 (MQ=255) gccatcgagcagcagcggcgtaccactctccaacagcagtatcgatgcacccgcgccgaccactgctggtatgccCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATAc > 1:1671315‑M1/76‑134 (MQ=255) ccatttgCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGgcgc > 1:67776/6‑150 (MQ=255) tGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCAt < 2:1076665/150‑1 (MQ=255) ggTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATc < 1:1875508/150‑1 (MQ=255) gaCCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATAct > 1:412471/1‑150 (MQ=255) ccGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATActgc > 1:1730272/1‑150 (MQ=255) 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ggTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGgag > 1:333899/1‑150 (MQ=255) gTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATActgct < 2:652389/142‑1 (MQ=255) gTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATActgct > 1:652389/1‑142 (MQ=255) ccATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGt > 1:1891174/1‑150 (MQ=255) cATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTg < 2:1915494/150‑1 (MQ=255) cATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCANACCAGCNGTGGTCGGCGCGNGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTg < 1:1553829/150‑1 (MQ=255) aTCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTgg < 2:468616/150‑1 (MQ=255) aTCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTgg < 2:769603/150‑1 (MQ=255) aTCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTgg > 2:925318/1‑150 (MQ=255) aTCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTgg > 2:1654785/1‑150 (MQ=255) tCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTggg < 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ccACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGTGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGc < 2:1065430/150‑1 (MQ=255) ccACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTg > 1:1265720/1‑87 (MQ=255) ccACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTg < 2:1265720/87‑1 (MQ=255) ccACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACGGCCACCggcggagt > 2:1565315/1‑144 (MQ=255) cACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCt < 2:1851200/150‑1 (MQ=255) aCGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTg < 1:1199952/150‑1 (MQ=255) cacaGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCgg < 2:1446272/150‑1 (MQ=255) acaGTGCTATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGGGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGAGGGAGAGCGGGGGGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCggg > 1:1180833/1‑150 (MQ=255) gTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGgcgc < 2:613438/150‑1 (MQ=255) gTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGgc < 1:240262/148‑1 (MQ=255) gTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGgc > 2:240262/1‑148 (MQ=255) tGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCt < 1:1379073/150‑1 (MQ=255) gCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTg < 2:830980/150‑1 (MQ=255) cATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGc > 1:999385/1‑150 (MQ=255) cATCGTCGCCAGGGCGGTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATCCTAATGAGCACCAATGGTACTCCGCCCCTGCTCGATGGCCAGCGCAGTGCCTTAACCTTGGCGCCGCCATCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGc < 1:925318/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACCGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTc < 1:938690/107‑1 (MQ=255) tcgtcgCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACCGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTc > 2:938690/1‑107 (MQ=255) cgtcgCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGa > 2:653892/1‑150 (MQ=255) gtcgCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAg > 2:1907828/1‑150 (MQ=255) tcgCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGc < 2:1891174/150‑1 (MQ=255) ccccGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCAACGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGt > 2:630380/2‑150 (MQ=255) ggCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCt > 2:301542/1‑150 (MQ=255) gTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTgcg > 2:1135296/1‑150 (MQ=255) gGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGa < 1:200270‑M2/149‑1 (MQ=255) | CGCAGGTTGAACCCGAGCAACCCTATGTGCTGGTGATGACCGAAGTCGGTCCATCCGATGTCGCCCGCCTGGACCCCAACCGGGTTGCCGGCATTGTCACCGCCCAGGGCGGCGCCACGGCCCACAGTGCCATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGA > NC_002947/911102‑911399 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |