New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1468301 | 64 (0.880) | 4 (0.060) | 3/236 | NT | 5.9% | coding (398/1479 nt) | algE | alginate production protein AlgE |
? | NC_002947 | = 1468324 | 67 (0.960) | coding (375/1479 nt) | algE | alginate production protein AlgE |
TTCGCTGAATCGCTGGGCGACGCCCAGGTCGGCCTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTGTCGGTCGCAGCGACC > NC_002947/1468156‑1468450 | ggggCTGGATCGCTGGGCGACGCCCAGGTCGGCCTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGc < 2:45533/147‑1 (MQ=255) tCGCTGAATCGCTGGGCGACGCCCAGGTCGGCCTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCg < 1:663381/150‑1 (MQ=255) gCTGAATCGCTGGGCGACGCCCAGGTCGGCCTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGt > 1:705566/1‑150 (MQ=255) tGAATCGCTGGGCGACGCCCAGGTCGGCCTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTaa < 1:464530/150‑1 (MQ=255) gAATCGCTGGGCGACGCCCAGGTCGGCCTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAg > 2:1502126/1‑150 (MQ=255) aTCGCTGGGCGACGCCCAGGTCGGCCTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGc > 2:1076188/1‑150 (MQ=255) cGACGCCCAGGTCGGCCTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGc < 1:1857695/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGc > 1:250197/1‑125 (MQ=255) cTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGc < 2:250197/125‑1 (MQ=255) aGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATg > 1:330819/1‑150 (MQ=255) tATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGc > 1:934897/1‑150 (MQ=255) tATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCAAGGTAGc > 1:1663836/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCGGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCtt > 1:940388/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGt < 1:884776/104‑1 (MQ=255) tCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGt > 2:884776/1‑104 (MQ=255) cGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAAAGCAGTTGATCGCCTGGGTATTGGGTATGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCttt < 1:1493256/150‑1 (MQ=255) gAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTcgc > 2:323433/1‑131 (MQ=255) gAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTcgc < 1:323433/131‑1 (MQ=255) gAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCtttt < 1:1647385/150‑1 (MQ=255) gAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCtttt > 1:994620/1‑150 (MQ=255) ggTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTcggctacagcggccttaccgcctacccaggcgagcaactgcgcttc > 2:225827‑M1/1‑92 (MQ=255) ggTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTcggctacagcggccttaccgcctacccaggcgagcaactgcgcttc < 1:225827‑M1/138‑47 (MQ=255) ccAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTgg > 2:1256822/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTgg < 1:1284483/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCt > 1:279022/1‑101 (MQ=255) ttCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCt < 2:279022/101‑1 (MQ=255) agtgcttcGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTcggctacagcggccttaccgcctacccaggc > 2:1435650‑M1/4‑82 (MQ=255) agtgcttcGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTcggctacagcggccttaccgcctacccaggc < 1:1435650‑M1/110‑32 (MQ=255) aGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACgg < 2:1377492/150‑1 (MQ=255) gcTTCGATGTTCGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTg < 1:775871/150‑1 (MQ=255) cTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATg < 2:53312/119‑1 (MQ=255) cTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATg > 1:53312/1‑119 (MQ=255) ttCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTgtc < 2:768311/150‑1 (MQ=255) ttCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTgtc > 2:826756/1‑150 (MQ=255) ttCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTgtc > 2:1560920/1‑150 (MQ=255) ttCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTgtc < 1:1256822/150‑1 (MQ=255) ttGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTCGACGGCTGTCGTCGCCg < 2:994620/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGAGCAGGCGGCATGC‑CGCGGAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTc < 2:1611107/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GATGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCg > 1:1611107/1‑150 (MQ=255) gcgcCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGc < 1:1565758/77‑1 (MQ=255) gcgcCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGc > 2:1565758/1‑77 (MQ=255) aTCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTcg < 1:1013784/85‑1 (MQ=255) aTCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTcg > 2:1013784/1‑85 (MQ=255) aTCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTg < 1:1512553/110‑1 (MQ=255) aTCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTg > 2:1512553/1‑110 (MQ=255) tcgCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCcgtcgtcg < 2:934897/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGtt < 2:838058/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGtt > 2:1541717/1‑150 (MQ=255) cTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCcgtcgt < 1:795455/145‑1 (MQ=255) cTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCcgtcgt > 2:795455/1‑145 (MQ=255) cTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTc > 1:693631/1‑150 (MQ=255) cTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCAAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTc < 2:1663836/150‑1 (MQ=255) cgcAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTgg < 1:826756/150‑1 (MQ=255) tGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCtttt > 1:1415932/1‑86 (MQ=255) tGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCtttt < 2:1415932/86‑1 (MQ=255) ggCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGTCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTg > 1:1519742/1‑90 (MQ=255) ggCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGTCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTg < 2:1519742/90‑1 (MQ=255) ggCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGgtgt < 1:1502126/150‑1 (MQ=255) cGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACTCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCGGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCcgtcgtc < 1:781861/127‑1 (MQ=255) cGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCcgtcgtc > 2:781861/1‑127 (MQ=255) gAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGacccaggcgagcaactgcgcttcggtcgccagcgcctgcgcagcgacgatggcatgtggcgcgataccaacatcgaagcgctgaactggacc < 1:225827‑M2/138‑93 (MQ=255) gAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGacccaggcgagcaactgcgcttcggtcgccagcgcctgcgcagcgacgatggcatgtggcgcgataccaacatcgaagcgctgaactggacc > 2:225827‑M2/1‑46 (MQ=255) gAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCg < 2:1925848/103‑1 (MQ=255) gAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCg > 1:1925848/1‑103 (MQ=255) gcgcAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGAt < 1:114041/150‑1 (MQ=255) cgcAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGACCTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATg < 2:278267/150‑1 (MQ=255) aGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGCAGCCCGTGTCGGTGCAATACTCGTTCTGGGGCAGGGTTGCGGTGTCGATGgtg > 2:702441/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTgtcggtc > 1:856985/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTgtcggtc > 1:655333/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCAGTCTGGCGCAAGGGGTCGGTCTCTAAGgtgtagatc > 2:867165/1‑145 (MQ=255) gCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGacccaggcgagcaactgcgcttcggtcgccagcgcctgcgcagcgacgatggcatgtggcgcgataccaacatcgaagcact < 1:1435650‑M2/113‑83 (MQ=255) gCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGacccaggcgagcaactgcgcttcggtcgccagcgcctgcgcagcgacgatggcatgtggcgcgataccaacatcgaagcact > 2:1435650‑M2/1‑31 (MQ=255) ccTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGGCCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTGTCGGTCGCa < 2:705566/150‑1 (MQ=255) cTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTGTCGGTCGCAg > 1:1907393/1‑150 (MQ=255) tGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTgtcg < 2:797476/142‑1 (MQ=255) tGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTgtcg > 1:797476/1‑142 (MQ=255) gggTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTgtcg > 1:1501928/1‑78 (MQ=255) gggTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTgtcg < 2:1501928/78‑1 (MQ=255) ggTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTGTCGGTCGCAGCGa < 2:940388/150‑1 (MQ=255) tAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTGTCGGTCGCAGCGAcc < 1:293815/150‑1 (MQ=255) | TTCGCTGAATCGCTGGGCGACGCCCAGGTCGGCCTTGAGCAAGGTGGTATCGAAGGTCCAGTTCAGCGCTTCGATGTTGGTATCGCGCCACATGCCATCGTCGCTGCGCAGGC‑GCTGGCGACCGAAGCGCAGTTGCTCGCCTGGGTAGGCGGTAAGGCCGCTGTAGCCGACCCAGAACTCGCGCATGGCCAGGTAGCTTTTGTCTGGTTGACGGCTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGCTGGTGCCGTCGTCGTTCTGGCGCAAGGTGTCGGTTTCGATGGTGTCGGTCGCAGCGACC > NC_002947/1468156‑1468450 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |