| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1603703 = | 59 (0.810) | 4 (0.060) | 4/240 | NT | 6.7% | coding (751/1011 nt) | PP_1406 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1603735 = | 55 (0.780) | coding (719/1011 nt) | PP_1406 | hypothetical protein | |||||
AAAATGCTGCTTCTGATTGATCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCATCGAGCAGTTCGGCACT > NC_002947/1603554‑1603844 | aagctgcccgacggcaccacccgccagcgcagcgctgaaagtgccgaactgctcgatgggtttgccgtgaacatcccgggtgaagtaccgcttttcgtcaacgaagaccgcagcgatgaaaaactgcgcgctatccgcaactcggactac > 2:1105631‑M1/150‑150 (MQ=255)aagctgcacgacggcacctcctgccagcgcagcgctgaaagtgacgaaatgctcgatgtgtttgccgtgaacatcccgggtgaagtagcgcttttcgtcaacgaagaccgcagcgatgaaaaactgcgcgctatccgcaactcggactac > 2:325478‑M1/150‑150 (MQ=255) tgctgcTTCTGATTGATCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTgc < 1:196750/150‑1 (MQ=255) tgctgcTTCTGATTGATCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTgc > 2:1031174/1‑150 (MQ=255) tgctgcTTCTGATTGATCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTgc < 2:1587725/150‑1 (MQ=255) ctgctTCTGATTGATCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTgcgc < 2:250716/150‑1 (MQ=255) tgctTCTGATTGATCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGcc < 1:775102/150‑1 (MQ=255) attgatCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGccc > 1:1377847/1‑150 (MQ=255) attgatCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGccc > 1:1167029/1‑150 (MQ=255) tCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGc > 1:1639355/1‑150 (MQ=255) tCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGc > 2:1706444/1‑150 (MQ=255) cACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGc > 1:1164671/1‑149 (MQ=255) cACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGc < 2:1164671/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCAcc > 1:394183/1‑150 (MQ=255) ccGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCAcc > 2:1351628/1‑150 (MQ=255) ccGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCAcc > 1:1899927/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAg > 1:287085/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAg > 2:641078/1‑150 (MQ=255) tCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAgg < 2:1055820/150‑1 (MQ=255) tCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAgg < 2:1101821/150‑1 (MQ=255) aGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTcc > 2:659695/1‑150 (MQ=255) ggCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAg > 2:151026/1‑150 (MQ=255) gAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGc < 1:641078/150‑1 (MQ=255) aaTGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCg < 2:1167029/150‑1 (MQ=255) gCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCAcc < 2:1157899/124‑1 (MQ=255) gCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCAcc > 1:1157899/1‑124 (MQ=255) aaTGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCa > 2:648196/1‑107 (MQ=255) aaTGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCa < 1:648196/107‑1 (MQ=255) tGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAgcgc > 1:1851483/1‑150 (MQ=255) aTAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGCTCAGATGATGTCCGAACAGGCATAGCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCa < 2:217763/150‑1 (MQ=255) tAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAg > 2:1047209/1‑150 (MQ=255) cTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGttt < 2:287085/150‑1 (MQ=255) tGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGtttt < 2:130456/150‑1 (MQ=255) gTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTTCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCACAGGTAGTCCGAGTTGCGGAGAGCGCCCAGttttt > 2:36087/1‑150 (MQ=255) ttGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTc < 2:394183/150‑1 (MQ=255) gCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCAt < 2:1386424/150‑1 (MQ=255) cGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATc < 1:1816955/150‑1 (MQ=255) ggACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCg < 2:658461/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTc < 2:1851483/150‑1 (MQ=255) gcgcACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTc < 1:1031174/150‑1 (MQ=255) gcgcACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTc < 1:926970/150‑1 (MQ=255) gcACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGa < 1:1663952/117‑1 (MQ=255) gcACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGa > 2:1663952/1‑117 (MQ=255) cacaGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGtt < 1:1799325/150‑1 (MQ=255) aGCGTCGAGCAGGCGCCGGTCACTGCAATCCAGATGCTATCCGAACAGCCATAGCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGACCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTCCATCGCTGCGGTCTTCGTTGAc > 2:608777/1‑150 (MQ=255) taccgcttttcgtcaacgaagaccgcagcgatgaaaaactgcgcgctatccgcaactcggactaCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAgg < 2:40396‑M1/32‑1 (MQ=255) taccgcttttcgtcaacgaagaccgcagcgatgaaaaactgcgcgctatccgcaactcggactaCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAgg > 1:40396‑M1/65‑96 (MQ=255) gCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCg < 1:1179054/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTAc < 1:1812119/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGATGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTAc > 1:343917/1‑150 (MQ=255) tcaacgaagaccgcagcgatgaaaaactgcgcgctatccgcaactcggactaCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCa > 1:1694391‑M1/53‑82 (MQ=255) tcaacgaagaccgcagcgatgaaaaactgcgcgctatccgcaactcggactaCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCa < 2:1694391‑M1/30‑1 (MQ=255) cACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCg < 1:151026/150‑1 (MQ=255) ccAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCa < 1:659695/150‑1 (MQ=255) cAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCAc > 1:261243/1‑150 (MQ=255) cAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCAc > 2:658478/1‑150 (MQ=255) aGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCgg > 2:1211722/1‑140 (MQ=255) aGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCgg < 1:1211722/140‑1 (MQ=255) gCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCaa > 2:1855067/1‑150 (MQ=255) gAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCAt < 2:1921414/149‑1 (MQ=255) gAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCAt > 1:1921414/1‑149 (MQ=255) aGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCATCGAGc < 1:541569/150‑1 (MQ=255) atatCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCATCGAGCAGtt > 1:75354/1‑150 (MQ=255) tatCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑GACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCATCGAGCAGTTc > 1:1071462/1‑150 (MQ=255) cGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCATCGAGCAGTTCGGCa < 2:486715/149‑1 (MQ=255) cGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCATCGAGCAGTTCGGCa > 1:486715/1‑149 (MQ=255) cGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCATCGAGCAGTTCGGCAc > 2:1301832/1‑150 (MQ=255) gTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAAAGCCTCTTCCAGCCAGGA‑GTGCACGGCAAACCCATCGAGCAGTTCGGCACt > 1:1885398/1‑150 (MQ=255) | AAAATGCTGCTTCTGATTGATCACCGAAGCCTCGCCCAGCGGCCGAATGGCAATGGATAGCTGTTGCGGACGGGCTTGGCGCACAGCGTCGAGCAGGTGCCGGTCACTGCTGTCCAGATGCTGTCCGAACAGGCATATCCCGTGGTTTTCCTGCGCCAGCTGCCCCAGGCACCAGCTCAGGTAGTCCGAGTTGCGGATAGCGCGCAGTTTTTCATCGCTGCGGTCTTCGTTGACGAAAAGCGGTACTT‑CACCCGGGATGTTCACGGCAAACCCATCGAGCAGTTCGGCACT > NC_002947/1603554‑1603844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |