New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1946569 = | 80 (1.100) | 6 (0.090) | 6/234 | NT | 7.6% | intergenic (‑55/+29) | PP_1747/PP_1748 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1946592 = | 71 (1.030) | intergenic (‑78/+6) | PP_1747/PP_1748 | hypothetical protein/hypothetical protein |
GTCGTCGCCGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGAA > NC_002947/1946422‑1946715 | agcccgcccgtatttgccagcgattcgcagccggccaatacgtcacttgagcgcttcagccaccagctggagcacgatgcgcagatggaaagcgacacgcgggtaccggccgtggacagcctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTg > 1:1150564‑M1/148‑150 (MQ=255) cgtcgCCGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTggg < 1:343226/150‑1 (MQ=255) cccgcccgtatttgccagcgattcgcagccggccaatacgtcacttgagcgcttcagccaccagctggagcacgatgcgcagatggaaagcgacacgcgggtaccggccgtggacagcctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTggg < 2:1837372‑M1/5‑1 (MQ=255) gtcgCCGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTgg < 2:943259/148‑1 (MQ=255) gtcgCCGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTgg > 1:943259/1‑148 (MQ=255) ccgcccgtatttgccagcgattcgcagccggccaatacgtcacttgagcgcttcagccaccagctggagcacgatgcgcagatggaaagcgacacgcgggtaccggccgtggacagcctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTgggg < 2:1229538‑M1/6‑1 (MQ=255) ccgcccgtatttgccagcgattcgcagccggccaatacgtcacttgagcgcttcagccaccagctggagcacgacccgctgatggacagcgccgcccgtgtaccgtctgtggtcagcctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTgggg > 1:1207004‑M1/145‑150 (MQ=255) tcgCCGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTGGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGc > 2:1439262/1‑150 (MQ=255) cgcccgtatttgccagcgattcgcagccggccaatacgtcacttgagcgcttcagccaccagctggagcacgatgcgcagatggaaagcgacacgcgggtaccggccgtggacagcctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTGGGGc < 1:1916503‑M1/7‑1 (MQ=255) ccgtatttgccagcgattcgcagccggccaatacgtcacttgagcgcttcagccaccagctggagcacgatgcgcagatggaaagcgacacgcgggtaccggccgtggacagcctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTgggg > 2:17732‑M1/141‑146 (MQ=255) ccgtatttgccagcgattcgcagccggccaatacgtcacttgagcgcttcagccaccagctggagcacgatgcgcagatggaaagcgacacgcgggtaccggccgtggacagcctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTgggg < 1:17732‑M1/6‑1 (MQ=255) cGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCt > 2:1514497/1‑150 (MQ=255) gTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAAAATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGcc > 2:664175/1‑150 (MQ=255) ccagcgattcgcagccggccaatacgtcacttgagcgcttcagccaccagctggagcacgatgcgcagatggaaagcgacacgcgggtaccggccgtggacagcctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTGGGGCCGCTTTGCAGcc < 1:61859‑M1/19‑1 (MQ=255) ccGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCa > 1:943893/1‑150 (MQ=255) gattcgcagccggccaatacgtcacttgagcgcttcagccaccagctggagcacgatgcgcagatggaaagcgacacgcgggtaccggccgtggacagcctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAg > 2:61859‑M1/127‑150 (MQ=255) gTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGCTCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGCATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAg < 1:1530035/150‑1 (MQ=255) gcgGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGc > 2:1102267/1‑150 (MQ=255) gTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGttt > 2:315019/1‑150 (MQ=255) tGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTa < 1:1514497/150‑1 (MQ=255) cGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGcc > 1:241387/1‑150 (MQ=255) aGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCCAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCttt < 2:1405770/150‑1 (MQ=255) cTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTggg > 1:1284508/1‑113 (MQ=255) cTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTggg < 2:1284508/113‑1 (MQ=255) cTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGttt < 1:1102267/150‑1 (MQ=255) tCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTc < 2:885756/150‑1 (MQ=255) tCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTc > 2:1048816/1‑150 (MQ=255) cAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTcc < 2:569468/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGa > 2:332842/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAAAATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGAc < 1:664175/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCa > 2:1828799/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCa > 2:720813/1‑150 (MQ=255) gagcgcgtcagtcaacagctggagcaagatgcgcagatggaaagcgacacgggggtaccggccgtggacagcctggtcgaaaacaaaggctaaacgcccTTGTGGCTGCAAAGCGGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAgg > 2:14792‑M1/100‑150 (MQ=255) gCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAgg < 2:323140/150‑1 (MQ=255) gTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGt < 1:315019/150‑1 (MQ=255) tCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTc > 1:1342552/1‑150 (MQ=255) tttCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGc > 1:1873560/1‑150 (MQ=255) tttCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGc > 2:1252219/1‑150 (MQ=255) ttCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGcc < 2:1873560/150‑1 (MQ=255) tCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCg < 2:1342552/150‑1 (MQ=255) cTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTAc > 1:1457849/1‑150 (MQ=255) ttGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTAcc > 2:1131932/1‑150 (MQ=255) gaaTTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGTGGCGTGTTCGGTAGAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTGGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCcgc < 2:611071/149‑1 (MQ=255) cAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCcgc > 1:198660/1‑150 (MQ=255) aaTTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTAGGGGCATGCTACGCGAAACAGTAGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGGAGCCCCAAGGGCGTGTAGCCTTTGTTTCCAACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCcgcg > 2:1560266/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCa > 1:1359232/1‑87 (MQ=255) tCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCa < 2:1359232/87‑1 (MQ=255) cttAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCt < 1:65333/148‑1 (MQ=255) cGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGTTTCGTTAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGAGTCCTGCGTTGGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCt < 1:1321336/150‑1 (MQ=255) cGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCt < 2:1457849/150‑1 (MQ=255) ggggATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTcc < 1:877882/110‑1 (MQ=255) ggggATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTcc > 2:877882/1‑110 (MQ=255) ggggATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTc < 2:839154/109‑1 (MQ=255) ggggATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTAAGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTc > 1:839154/1‑109 (MQ=255) gggATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCa > 2:1266546/1‑150 (MQ=255) ggATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCttt < 2:1102471/77‑1 (MQ=255) ggATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCttt > 1:1102471/1‑77 (MQ=255) 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gggCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCt > 1:1837372/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTc < 1:1252219/150‑1 (MQ=255) gCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAgg < 2:1528309/99‑1 (MQ=255) gCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAgg > 1:1528309/1‑99 (MQ=255) tCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACgg > 2:1828845/1‑103 (MQ=255) tCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACgg < 1:1828845/103‑1 (MQ=255) tCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTcc < 2:1536539/144‑1 (MQ=255) tCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTcc > 1:1536539/1‑144 (MQ=255) cTGAAATAGGTATGTGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTTTTTCCGACCAGTCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCtggt < 2:657627/150‑1 (MQ=255) tGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCtggtg > 2:943748/1‑150 (MQ=255) gAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCtggtgg < 1:1439262/150‑1 (MQ=255) aaaTAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGc > 2:1597371/1‑150 (MQ=255) gtgtGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAgc > 2:1496011/4‑150 (MQ=255) gTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACgg < 1:205966/93‑1 (MQ=255) gTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACgg > 2:205966/1‑93 (MQ=255) gTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTgc > 2:684735/1‑122 (MQ=255) gTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTgc < 1:684735/122‑1 (MQ=255) cctggtcggaaacaaaggctaaacgcccTTGGGGCTGCAAAGCGGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTc < 2:339952‑M1/122‑1 (MQ=255) gCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAg < 1:1865472/130‑1 (MQ=255) gCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAg > 2:1865472/1‑130 (MQ=255) gCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTTaa < 1:1828799/150‑1 (MQ=255) gCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCaa < 2:943893/150‑1 (MQ=255) gCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCaa < 1:1597371/150‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGAc < 2:168836/150‑1 (MQ=255) cgcgAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTa > 1:386693/1‑150 (MQ=255) gAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAgcgc < 1:1176656/135‑1 (MQ=255) gAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAgcgc > 2:1176656/1‑135 (MQ=255) gAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTAttt > 2:1169052/1‑149 (MQ=255) gAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTg > 2:1916503/1‑150 (MQ=255) aaaCATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTgg > 1:1857398/1‑150 (MQ=255) aaCATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGc < 2:241387/150‑1 (MQ=255) aTTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCgg < 2:386693/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCATTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGcc > 1:1764481/1‑147 (MQ=255) ttCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCATTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGcc < 2:1764481/147‑1 (MQ=255) gtgtTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGaa > 2:989861/1‑150 (MQ=255) | GTCGTCGCCGTTGTCAGTGCCGTCGCGGGTGACGAAGTCCTCAATCAGGCGGGTCAGGGTTTCGGCTTGCAATTGGTCGTAGGGGATCAGCATGGTCGGGCGGTGTCTGAAATAGGTATGGGCATGCTACGCGAAACATTCGAGGTGTTGGGGCCGCTTTGCAGCCCCAAGGGCGTTTAGCCTTTGTTTCCGACCAGGCTGTCCACGGCCGGTACCCGCGTGTCGCTTTCCATCTGCGCATCGTGCTCCAGCTGGTGGCTGAAGCGCTCAAGTGACGTATTGGCCGGCTGCGAA > NC_002947/1946422‑1946715 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |