New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2366860 = | 62 (0.850) | 5 (0.070) | 5/236 | NT | 8.1% | coding (196/459 nt) | PP_2079 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2366889 = | 54 (0.780) | coding (167/459 nt) | PP_2079 | hypothetical protein |
CTTCAGCGCGTCCCGGTCGCCTGCCGCCACTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGAAGGGAATTCTGACAGTCTTGCGTACAGGC > NC_002947/2366711‑2367006 | ttcggtcaaggggcggtaactttacgtttatgcctgtacgcaagactgtcagaattcccttccgtttcctttgacccgagcctgctcatgcaaatcaacaccgccctgctgttcgccaccccttgcgatgacgaggaagacaacatggcg < 1:414265‑M1/1‑1 (MQ=255) cTTCAGCGCGTCCCGGTCGCCTGCCGCCACTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTg > 1:112491/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGCGTCCCGGTCGCCTGCCGCCACTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGa < 1:1733207/150‑1 (MQ=255) gtcaaggggcggtaactttacgtttatgcctgtacgcaagactgtcagaattcccttccgtttcctttgacccgagcctgctcatgcaaatcaacaccgccctgctgttcgccaccccttgcgatgacgaggaagacaacatggcGAccc < 2:967575‑M1/5‑1 (MQ=255) gtcaaggggcggtaactttacgtttatgcctgtacgcaagactgtcagaattcccttccgtttcctttgacccgagcctgctcatgcaaatcaacaccgccctgctgttcgccaccccttgcgatgacgaggaagacaacatggcGAccc < 1:1616574‑M1/5‑1 (MQ=255) cggcccGGTCGCCTGCCGCCACTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGt < 2:896865/147‑1 (MQ=255) gTCCCGGTCGCCTGCCGCCACTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTc > 1:1729761/1‑150 (MQ=255) tCCCGGTCGCCTGCCGCCACTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCg > 1:782719/1‑150 (MQ=255) gtaactttacgtttatgcctgtacgcaagactgtcagaatcaccatcccttccccctgacccgagtctgctcatggaaagcaacaccgccctgctgttcgccaccccttgcgatgacgaggaagacaacatggcGACCCTTGTCGCtgtg > 2:1187695‑M1/135‑150 (MQ=255) tCGCCTGCCGCCACTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTgg < 1:689727/150‑1 (MQ=255) gCCTGCCGCCACTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACACTTGTCGCTGTGgca > 2:414265/1‑150 (MQ=255) aCTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTc < 1:981660/150‑1 (MQ=255) cagcagGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCAtgtt < 1:1653347/150‑1 (MQ=255) cagcagGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCAtgtt < 1:454528/150‑1 (MQ=255) agcagGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCAtgttg > 2:56162/1‑150 (MQ=255) cagGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTc < 2:464250/150‑1 (MQ=255) cgcTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTcc < 2:677881/150‑1 (MQ=255) aGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCaa < 1:1579226/150‑1 (MQ=255) gggTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAg < 2:782719/150‑1 (MQ=255) ggTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAgg < 1:1562459/150‑1 (MQ=255) cACCTTAAGGCCATCAAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAggggg > 1:73579/1‑149 (MQ=255) ccTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACTGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTgg < 1:1189320/150‑1 (MQ=255) gtttcctttgacccgagcctgctcatgcaaatcaacaccgccctgctgttcgccaccccttgcgatgacgaggaagacaacatggcGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCa > 2:76244‑M1/87‑119 (MQ=255) gtttcctttgacccgagcctgctcatgcaaatcaacaccgccctgctgttcgccaccccttgcgatgacgaggaagacaacatggcGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCa < 1:76244‑M1/33‑1 (MQ=255) tAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCtg < 2:994848/91‑2 (MQ=255) tAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCtg > 1:994848/1‑90 (MQ=255) aaGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGaa < 2:368616/150‑1 (MQ=255) ggCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAAca > 1:1772699/1‑150 (MQ=255) ggCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAAca < 2:1836720/150‑1 (MQ=255) cATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTAGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTgg < 2:1245136/141‑1 (MQ=255) cATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTAGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTgg > 1:1245136/1‑141 (MQ=255) cATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGCGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGACGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGGGAAcagaa > 1:1286628/1‑148 (MQ=255) aTCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAAcagcag > 1:955846/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGc > 2:783092/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGc > 2:783086/1‑150 (MQ=255) cGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGgt < 1:56162/150‑1 (MQ=255) gTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGgtg > 2:1916265/1‑150 (MQ=255) tCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGgtgt < 2:1729761/150‑1 (MQ=255) gACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTg > 2:827102/1‑150 (MQ=255) cGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCCGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGAt < 2:386150/150‑1 (MQ=255) gCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTTATCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGAttt < 2:1286628/150‑1 (MQ=255) gCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGAttt < 1:1916265/150‑1 (MQ=255) gCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGAt > 2:715583/1‑148 (MQ=255) gCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGAt < 1:715583/148‑1 (MQ=255) gTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCAt > 2:1066776/1‑150 (MQ=255) tCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGAttt < 1:1457411/145‑1 (MQ=255) tCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGAttt > 2:1457411/1‑145 (MQ=255) cATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGa < 2:587453/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGc < 1:3064/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGGTCGACAGTGTACTCGTCAGGGTACAGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAg < 2:1772699/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCgg < 1:1209215/150‑1 (MQ=255) ggTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGt < 1:783092/150‑1 (MQ=255) ggTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGt < 1:783086/150‑1 (MQ=255) ggTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGt > 1:757264/1‑150 (MQ=255) aCGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCCGGTCAAAg < 2:73579/150‑1 (MQ=255) cTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGa > 1:1155036/1‑150 (MQ=255) tCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGGACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGGAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGaa > 1:252684/1‑150 (MQ=255) tCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCtgt > 1:770935/1‑46 (MQ=255) tCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCtgt < 2:770935/46‑1 (MQ=255) tCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGaa < 1:387670/150‑1 (MQ=255) gTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAAc > 1:917340/1‑97 (MQ=255) gTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAAc < 2:917340/97‑1 (MQ=255) acgggtacGCAGGAACATCTGAACCGTGTCGCTTGGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGAAGGGAATTCTGa < 2:112491/150‑1 (MQ=255) gaagacaacatggcGACCCT‑GT‑GCTGCCACAGCGACAAGGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGAAGGGAATTCTGa < 1:462100‑M1/130‑1 (MQ=255) gaagacaacatggcGACCCT‑GT‑GCTGCCACAGCGACAAGGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGAAGGGAATTCTGa > 2:462100‑M1/15‑144 (MQ=255) gCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGAAGGGAATTCTGACAGTCTTg > 2:95873/1‑150 (MQ=255) cAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGAAGGGAATTCTGACAGTCTTGc < 1:1066776/150‑1 (MQ=255) aGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGc > 1:381432/1‑99 (MQ=255) aGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGc < 2:381432/99‑1 (MQ=255) aGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAg > 1:1804955/1‑107 (MQ=255) aGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAg < 2:1804955/107‑1 (MQ=255) gAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGAAGGGAATTCTGACAGTCTTGCGTa > 2:1616574/1‑150 (MQ=255) tCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGAAGGGAATTCTGACAGTCTTGCGTACAGGc < 2:955846/150‑1 (MQ=255) | CTTCAGCGCGTCCCGGTCGCCTGCCGCCACTTCGATCAGCAGGCGCTTGGCGCTCAGGGTCACCTTAAGGCCATCCAGCGTCGACGGCTCGTCATCCAGCGTCAGGTCGACGGTGTCCTCGTCCGGGTAACGGGTAAGCAGGAACATCTGACCCTTGTCGCTGTGGCAGC‑ACA‑GGGTCGCCATGTTGTCTTCCTCGTCATCGCAAGGGGTGGCGAACAGCAGGGCGGTGTTGATTTGCATGAGCAGGCTCGGGTCAAAGGAAACGGAAGGGAATTCTGACAGTCTTGCGTACAGGC > NC_002947/2366711‑2367006 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |