New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GTCAACTACCTGGACCGTAGTGCGCTGTCGATCGCCAACACCTCCATCCAGAAAGACATGATGATCAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGG > NC_002947/3238973‑3239270 | ccagaccacaccggtcggggtgccgcgctcgttggcgtcgaaccactctgacaatggtttggccgccgatgggaacatcggcgcctcgccaatccccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaaactgttgaccatgccaaacgc < 2:1260011‑M1/1‑1 (MQ=255) tCAACTACCTGGACCGTAGTGCGCTGTCGATCGCCAACACCTCCATCCAGAAAGACATGATGATCAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGAcc > 2:1202116/1‑150 (MQ=255) cagaccacaccggtcggggtgccgcgctcgttggcgtcgaaccactctgacaatgctttggccgccgatgggaacatcggcgcctcgccaatccccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaaactgttgaccatgccaaacgcc < 2:878414‑M1/2‑1 (MQ=255) cagaccacaccggtcggggtgccgcgctcgttggcgtcgaaccactctgacaatgctttggccgccgatgggaacatcggcgcctcgccaatccccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaaactgttgaccatgccaaacgcc < 1:1209314‑M1/2‑1 (MQ=255) cagaccacaccggtcggggtgccgcgctcgttggcgtcgaaccactctgacaatgctttggccgccgatgggaacatcggcgcctcgccaatccccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaaactgttgaccatgccaaacgcc < 2:444664‑M1/2‑1 (MQ=255) tACCTGGACCGTAGTGCGCTGTCGATCGCCAACACCTCCATCCAGAAAGACATGATGCACAGCCCGTCGGATATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTg > 1:1692358/1‑150 (MQ=255) cacaccggtcggggtgccgcgctcgttggcgtcgaaccactctgacaatgctttggccgccgatgggaacatcggcgcctcgccaatccccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaacctgttgaccctgccaaacgccgccag < 2:1865497‑M1/7‑3 (MQ=255) cacaccggtcggggtgccgcgctcgttggcgtcgaaccactctgacaatgctttggccgccgatgggaacatcggcgcctcgccaatccccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaaactgttgacaatgccaaacgCCGCCTg < 1:170722‑M1/7‑1 (MQ=255) cacaccggtcgggtgccgcgctcgttggcgtcgaaccactctgacaatgctttggccgccgatgggaacatcggcgcctcgccaatccccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaaactgttgaccatgccaaacgCCGCCTgg < 1:1594959‑M1/8‑1 (MQ=255) aCCTGGACCGTAGTGCGCTGTCGATCGCCAACACCTCCATCCAGAAAGACATGATGATCAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTgg < 1:358265/150‑1 (MQ=255) cTGGACCGTAGTGCGCTGTCGATCGCCAACACCTCCATCCAGAAAGACATGATGATCAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGgc > 1:1377986/1‑150 (MQ=255) tCGATCGCCAACACCTCCATCCAGAAAGACATGATGACCAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGgc < 1:1072387/150‑1 (MQ=255) ccAACACCTCCATCCAGAAAGACATGATGATCAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCgg > 1:1154068/1‑142 (MQ=255) 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2:653044‑M1/130‑1 (MQ=255) cAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCAGGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGgcgc > 1:408001/1‑150 (MQ=255) cAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTGGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGgcgc > 2:1622397/1‑150 (MQ=255) aaTGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGcc < 1:1679373/106‑1 (MQ=255) aaTGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGcc > 2:1679373/1‑106 (MQ=255) aaTGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGcc > 1:1913932/1‑150 (MQ=255) gggCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGTCGAt < 1:1261805/150‑1 (MQ=255) gggCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGAt < 1:413881/150‑1 (MQ=255) ggCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATg < 2:1692358/150‑1 (MQ=255) gCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGt > 1:934127/1‑88 (MQ=255) gCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGt < 2:934127/88‑1 (MQ=255) gCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGgtg > 1:264544/1‑122 (MQ=255) gCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGgtg < 2:264544/122‑1 (MQ=255) gCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTgg < 1:390296/129‑1 (MQ=255) gCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTgg > 2:390296/1‑129 (MQ=255) aTGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTc > 1:791595/1‑150 (MQ=255) aTGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTc < 2:829684/150‑1 (MQ=255) aTGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTc < 1:705446/150‑1 (MQ=255) atcatcGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCa < 1:1784142/150‑1 (MQ=255) catcGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCg < 1:908104/131‑1 (MQ=255) catcGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCg > 2:908104/1‑131 (MQ=255) catcCACCGCCTGGGCAGCAAGATAGCCATTGGCGAGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATc < 2:408001/150‑1 (MQ=38) tcGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATcgg > 1:460955/1‑150 (MQ=255) cGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATcggc < 2:1913932/150‑1 (MQ=255) gACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATcggcg > 2:1594959/1‑150 (MQ=255) | GTCAACTACCTGGACCGTAGTGCGCTGTCGATCGCCAACACCTCCATCCAGAAAGACATGATGATCAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGG > NC_002947/3238973‑3239270 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |