New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCACCCCGACCGGTGTGGTCTGG > NC_002947/3239038‑3239332 | cAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGtt > 2:1183822/1‑150 (MQ=255) aGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGttt < 2:672167/150‑1 (MQ=255) aGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGttt < 1:1202116/150‑1 (MQ=255) gCCGGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTACCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGTCGGCGTTTg > 2:1261805/1‑150 (MQ=255) gCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGACGTTTg < 1:1460987/150‑1 (MQ=255) cccGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTgg < 1:888808/150‑1 (MQ=255) cGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCa < 2:1681064/150‑1 (MQ=255) cGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATgg < 1:1454323/150‑1 (MQ=255) tGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACa > 2:413881/1‑150 (MQ=255) cgcctcgccaatccccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaaactgttgaccatgccaaacgccgcctgggcaaccgaccagcccagcaacgacgcgccgagggcgatcttgctgcccaggcggCGTTTGGCATGGTCAACAGt < 2:653044‑M2/20‑1 (MQ=255) tgttgtCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCACAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCg > 1:1654123/1‑150 (MQ=255) gttgtCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCgg < 1:1183822/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGttt > 1:1913154/1‑121 (MQ=255) ggCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGttt < 2:1913154/121‑1 (MQ=255) ggCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCAt > 1:700421/1‑150 (MQ=255) ccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaaactgttgaccatgccaaacgCCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTTCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCAt < 1:400140‑M1/72‑1 (MQ=255) ccagcaacacccgcagccccatgaaaccggcaaaactgttgaccatgccaaacgCCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCAt > 2:400140‑M1/55‑126 (MQ=255) gCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGTGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATg < 1:1219942/150‑1 (MQ=255) gTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATggg < 2:126296/150‑1 (MQ=255) ttttCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCg < 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aTGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGc < 1:657280/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTgg < 1:341545/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGttt < 2:1771886/100‑1 (MQ=255) cTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGttt > 1:1771886/1‑100 (MQ=255) tttGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTgggg > 2:1569083/1‑150 (MQ=255) tttGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTg < 1:1147469/147‑1 (MQ=255) tttGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTg > 2:1147469/1‑147 (MQ=255) ttGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGa > 1:1707925/1‑150 (MQ=255) cccAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCaa > 2:1613570/1‑106 (MQ=255) cccAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCaa < 1:1613570/106‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGAGCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTgg < 1:1773789/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGc > 2:840584/1‑150 (MQ=255) 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aaGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCa < 1:763136/150‑1 (MQ=255) gATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGa < 1:1243993/119‑1 (MQ=255) gATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGa > 2:1243993/1‑119 (MQ=255) tCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCagaga > 2:858764/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGt > 1:1131918/1‑150 (MQ=255) cGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTg < 2:1634143/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTc > 1:589825/1‑150 (MQ=255) cgcgTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGc < 1:532773/150‑1 (MQ=255) gtcgtTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCaa > 2:447341/1‑150 (MQ=255) tcgtTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAAc > 1:480237/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCAT‑GGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAgc > 2:1873436/1‑150 (MQ=255) gctggTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCa < 2:949341/150‑1 (MQ=255) ggTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCAccc < 1:1842609/150‑1 (MQ=255) gTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCAcccc > 1:455038/1‑150 (MQ=255) gTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTgg < 2:766074/120‑1 (MQ=255) gTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTgg > 1:766074/1‑120 (MQ=255) ccaggcggCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCA‑CCCGACCGGtgtg < 1:1594959‑M2/142‑1 (MQ=255) ccaggcggCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCAT‑GGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCACCCCGACCGGtgtg < 1:1873436‑M2/142‑1 (MQ=255) ctggcggCGTTTGGCAGGGTCAACAGGTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCACCCCGACCGGtgtg < 2:1865497‑M2/143‑1 (MQ=255) ggCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCACCCCGACCGGTGTGGTCTg < 2:444664‑M2/148‑1 (MQ=255) ggCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCACCCCGACCGGTGTGGTCTg < 1:1209314‑M2/148‑1 (MQ=255) ggCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCACCCCGACCGGTGTGGTCTg < 2:878414‑M2/148‑1 (MQ=255) gCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAACCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCACCCCGACCGGTGTGGTCTgg < 2:1260011‑M2/149‑1 (MQ=255) | CAGCCCGTCGCAGATGGGCATCCTGTTGTCGGCGTTTTCCATTGCCTATGCCTTTGCCCAGTTGCCAATGGGCATGATCATCGACCGCCTGGGCAGCAAGATCGCCCTCGGCGCGTCGTTGCTGGGCTGGTCGGTTGCCCAGGCGGCGTTTGGCATGGTCAACAGTTTTGCCGGTTTCATGGGGCTGCGGGTGTTGCTGGGGATTGGCGAGGCGCCGATGTTCCCATCGGCGGCCAAAGCATTGTCAGAGTGGTTCGACGCCAACGAGCGCGGCACCCCGACCGGTGTGGTCTGG > NC_002947/3239038‑3239332 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |