New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 3830168 | 72 (0.990) | 5 (0.070) | 5/230 | NT | 7.4% | coding (1255/1785 nt) | PP_3383 | gluconate 2‑dehydrogenase flavoprotein subunit |
? | NC_002947 | = 3830208 | 59 (0.870) | coding (1215/1785 nt) | PP_3383 | gluconate 2‑dehydrogenase flavoprotein subunit |
AGCAGCGGCTGACCGTAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGT‑CGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCG > NC_002947/3830020‑3830316 | agcagcGGCTGACCGTAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGa < 1:445519/150‑1 (MQ=255) agcagcGGCTGACCGTAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGa < 2:1568356/150‑1 (MQ=255) cagcGGCTGACCGTAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGt > 1:1288365/1‑150 (MQ=255) gatGACCGTAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCcg > 1:986362/3‑150 (MQ=255) tGACCGTAGCCATCGCGTTAGGGGGGGTCCAGGGCCAGGGAAGTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCcggc > 2:1575295/1‑150 (MQ=255) gACCGTAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGACAGGTTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGcagccggccga > 1:1610850‑M1/1‑139 (MQ=255) aCCGTAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCcggcgg < 1:134565/150‑1 (MQ=255) ccGTAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCggg > 2:195296/1‑150 (MQ=255) cGTAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGt > 1:755903/1‑150 (MQ=255) tAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTg > 1:48176/1‑150 (MQ=255) tAGGCATCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTg > 1:1355427/1‑150 (MQ=255) aTCGCGGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGcagccggccgattgccggtac > 1:1899283‑M1/1‑129 (MQ=255) cgcgGTAGGTGGGGTCCAGGTCCAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTAc < 2:48176/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |