New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4003395 | 54 (0.740) | 6 (0.090) | 6/234 | NT | 9.4% | intergenic (+9/+74) | PP_3531/PP_3532 | hypothetical protein/AsnC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 4003419 | 65 (0.940) | intergenic (+33/+50) | PP_3531/PP_3532 | hypothetical protein/AsnC family transcriptional regulator |
CGGGTGACCGAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGCGTTCAG > NC_002947/4003249‑4003543 | cgggtgaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑Ag‑g < 1:1702981/150‑1 (MQ=255) ttgaccgAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTTGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGAACGAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTg < 1:550632/149‑1 (MQ=255) ggTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑a < 2:940337/137‑1 (MQ=255) ggTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑a > 1:940337/1‑137 (MQ=255) ccTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTgca < 2:1609032/150‑1 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCGAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTgcag < 2:1124886/150‑1 (MQ=255) cTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTgcag > 2:825942/1‑150 (MQ=255) tACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCCAGCGTTGACTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTgcagc < 1:339670/150‑1 (MQ=255) aCCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTgcagca < 1:1549587/150‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgc > 1:1471505‑M1/1‑124 (MQ=255) gTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgc < 1:849241‑M2/150‑3 (MQ=255) cAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggc < 2:1800736‑M2/150‑7 (MQ=255) aGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggca < 1:1785994‑M2/150‑8 (MQ=255) ggCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATATGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAg > 2:577175/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcac > 1:1095532‑M1/1‑118 (MQ=255) gccgccCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑CCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGc > 1:1803388/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCCCT‑GCTGCAGTCGGTCTGCAGCCTGccggcacttcaagg > 2:1471505‑M2/1‑136 (MQ=255) cTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTtgt > 2:1066023/1‑150 (MQ=255) ccGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCttttt < 1:1702762/145‑1 (MQ=255) ccGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCttttt > 2:1702762/1‑145 (MQ=255) ggggATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑CCTGCTGCAGTCGGTCTGCAGCCTGccggcacttcaaggttggcg > 2:1095532‑M2/1‑130 (MQ=255) ttccAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTg > 1:1142923/3‑150 (MQ=255) aGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGGaa > 1:132296/1‑150 (MQ=255) ggTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCaaaa < 1:825942/150‑1 (MQ=255) gTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGg < 1:1765684‑M2/116‑2 (MQ=255) gTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGg > 2:1765684‑M2/1‑115 (MQ=255) gctggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccgg > 2:1864836‑M2/1‑112 (MQ=255) gctggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccgg < 1:1864836‑M2/117‑6 (MQ=255) ctggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTg > 2:1280540/1‑139 (MQ=255) ctggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTg < 1:1280540/139‑1 (MQ=255) ctggcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCt < 1:1435282/150‑1 (MQ=255) gcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctg > 1:1482323‑M1/1‑84 (MQ=255) gcCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctg < 2:1482323‑M1/109‑26 (MQ=255) cAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCttttt < 1:1832516/120‑1 (MQ=255) cAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCttttt > 2:1832516/1‑120 (MQ=255) cAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTc > 2:930325/1‑150 (MQ=255) cAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTc > 2:1111152/1‑150 (MQ=255) aCCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGTGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTtgt > 1:1461580/1‑120 (MQ=255) aCCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGTGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTtgt < 2:1461580/120‑1 (MQ=255) ccGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCcgc > 1:1140444/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCgg > 2:1442337/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCgg < 1:1442337/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGt < 1:1668897/150‑1 (MQ=255) ccgatctgtggATACGCCGGTGGTGCCGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCCTGAAGTGCCGGC‑AG‑GATGCAGACCGACTGCAGCAGGGGCGTCAGCTTTTTTTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGt < 1:1792043/143‑1 (MQ=255) tggtggATATGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACAt < 1:577175/150‑1 (MQ=255) gtggATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCt > 2:1136812/1‑150 (MQ=255) gtggATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCt > 1:1462525/1‑150 (MQ=255) tggATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCCTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCAGATcgg > 2:1792043/1‑148 (MQ=255) ggATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTg > 2:1527089/1‑150 (MQ=255) aTACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTa < 1:29888/150‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGt > 2:358172/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTc > 2:538089/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGa > 1:1482046/1‑150 (MQ=255) gTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGaaa > 2:361132/1‑142 (MQ=255) gTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGaaa < 1:361132/142‑1 (MQ=255) gCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTg < 1:358172/150‑1 (MQ=255) gCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAACAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTTGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTg > 1:568988/1‑150 (MQ=255) tGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGgt < 1:87592/150‑1 (MQ=255) ggCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGC‑AAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGatat < 1:1800736/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGc > 1:1078304/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCg < 2:1140444/150‑1 (MQ=255) cgcCAACCTTGAAGTGCCGGaggctgcagaccgactgcagcagggccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatcccc > 2:1095532‑M1/1‑21 (MQ=255) ccAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATc < 2:849241/150‑1 (MQ=255) cAACCTTGAAGTGCCGGC‑CG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCCGCAGCTCTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCCCCGCGGTCCCATCTTGTAGGCCGAAAGCAGGATGCTGGTCTGGGTGTTCTCGATCTGGGGGGTCg > 2:1873625/1‑150 (MQ=255) aaCCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCgg < 1:1283555/144‑1 (MQ=255) aaCCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCgg > 2:1283555/1‑144 (MQ=255) ccTTGAAGTGCCGGaggctgcagaccgactgcagcagggccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcagg > 2:1471505‑M1/1‑15 (MQ=255) ttGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAgg < 2:1763384/111‑1 (MQ=255) ttGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAgg > 1:1763384/1‑111 (MQ=255) ttGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCgg < 1:1066023/150‑1 (MQ=255) aaGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAACAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCGCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATg < 2:568988/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcc > 1:1095532‑M2/1‑32 (MQ=255) gTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCGATACACCTGGCCAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTGGGTGTTCTAACCATTCGGGATCGAGCGGATggg > 1:99718/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcct < 1:1785994‑M1/150‑144 (MQ=255) gCCGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcctg < 2:1800736‑M1/150‑145 (MQ=255) ccGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagc > 2:1864836‑M1/1‑5 (MQ=255) ccGGCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagc < 1:1864836‑M1/117‑113 (MQ=255) cGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGCGTTc > 2:1204073/1‑150 (MQ=255) ggC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGCGTTCa > 2:808132/1‑150 (MQ=255) gCcctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcctgcaac < 1:849241‑M1/150‑149 (MQ=255) gC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccaccctggcacatccccggcaggggcggcctgcaac > 1:1471505‑M2/1‑26 (MQ=255) ccctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccac < 1:1765684‑M1/116‑116 (MQ=255) ccctgctgcagtcggtctgcagcctgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggccagccac > 2:1765684‑M1/1‑1 (MQ=255) c‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggc > 1:1482323‑M2/1‑25 (MQ=255) c‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGgccggcacttcaaggttggcgctcagccaccgctcgcaacgtacgcaacgtcaccaccggcgtatccaccacaaaccggttggc < 2:1482323‑M2/109‑85 (MQ=255) | CGGGTGACCGAGGTGACCTACCAGTTGCAGGCCGCCCCTGCCGGGGATGTGCCAGGGTGGCTGGCCAACCGGTTTGTGGTGGATACGCCGGTGGTGACGTTGCGTACGTTGCGAGCGGTGGCTGAGCGCCAACCTTGAAGTGCCGGC‑AG‑GCTGCAGACCGACTGCAGCAGGGCCGGCAGCTTTTTGTGCAATACACCTGGCAAAAGGCCTGGCTCCGCGGTCACATCTTGTAGGTCGAAAGCAGGATGCTGGTCTCGGTGTTCTCGATATGCGGGATCGAGCGGATGGCGTTCAG > NC_002947/4003249‑4003543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |