| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 4098626 | 74 (1.010) | 4 (0.060) | 4/238 | NT | 5.1% | coding (108/975 nt) | qor‑II | quinone oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | = 4098645 | 78 (1.110) | coding (89/975 nt) | qor‑II | quinone oxidoreductase | |||||
TAAGCGACCCGGTCGCCCACCTGCACGTTGTGCACCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGATTGTGCTGCTACGTGTTCAAGCTGCATCACATCGGCAGCGCCGGTGCTATTGAGAATGATGCGGGTAGCCATGATCGAATCCTGCTGAATGAGTGCTCGAGTCAGGCTAAACA > NC_002947/4098477‑4098774 | tAAGCGACCCGGTCGCCCACCTGCACGTTGTGCACCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCC < 1:104784‑M1/150‑1 (MQ=255) aGCGACCCGGTCGCCCACCTGCACGTTGTGCACCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTTCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGt < 1:1228677/150‑1 (MQ=255) gACCCGGTCGCCCACCTGCACGTTGTGCACCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTg > 2:1187723/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCCACCTGCACGTTGTGCACCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTcca < 1:1824023/150‑1 (MQ=255) ccTGCACGTTGTGCACCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCgtctggctggagcagacgg < 1:950321‑M1/150‑20 (MQ=255) ccTGCACGTTGTGCACCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCt > 2:294051/1‑150 (MQ=255) tgCACCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCt > 1:653731/1‑150 (MQ=255) gCACCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCaggtctggctggagcagacggccatgggcgt < 2:1595487‑M1/150‑32 (MQ=255) aCCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGga > 1:114395/1‑150 (MQ=255) aCCCCATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGga > 1:1083211/1‑150 (MQ=255) cccATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCGGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGgaga < 2:373476/150‑1 (MQ=255) cccATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTccagc < 2:1286258/127‑1 (MQ=255) cccATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTccagc > 1:1286258/1‑127 (MQ=255) cccATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGgaga > 2:585131/1‑150 (MQ=255) cATCGCCAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGAtt < 2:1596929/150‑1 (MQ=255) cAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGTAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGATTGtgctg > 2:1767271/1‑150 (MQ=255) cAATGGCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGATTGtgctg > 2:14805/1‑150 (MQ=255) ggCCGAGACCCTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGATTGTGCTGCTAc < 2:779668/150‑1 (MQ=255) cccTGCCAGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGATTGTGCTGCTACGTGTTCaa < 1:585131/150‑1 (MQ=255) 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aGCGCCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGATTGTGCTGCTACGTGTTCAAGCTGCAt < 2:653731/150‑1 (MQ=255) gcgcCTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGTCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGATTGTGCTGCTACGTGTTCAAGCTGCATc < 2:1395220/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGgaga > 1:1151058/1‑118 (MQ=255) cTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGgaga < 2:1151058/118‑1 (MQ=255) cTTCCAGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGATTGTGCTGCTACGTGTTCAAGCTGCATCACAt < 1:1187723/150‑1 (MQ=255) aGTCCCAGGCCTGAAGGCAATGCCAGCGCTGCTCCCCCCTTGCGCTGCAACACATCCAGCGGGTTCACGCCCATGGCCGTCTGCTCCAGCCAGACCTGGCCAGGCCCTGGAGATTGTGCTGCTACGTGTTCAAGCTGCATCACATCGGCa < 1:1529524/150‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |