| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 4401734 = | 87 (1.190) | 6 (0.090) | 6/238 | NT | 7.0% | coding (1464/1809 nt) | PP_3881 | terminase large subunit |
| ? | NC_002947 | 4401761 = | 77 (1.100) | coding (1437/1809 nt) | PP_3881 | terminase large subunit | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CCATCGTGCCGCAGAGACTCCACCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGC > NC_002947/4401585‑4401875 | tggaaacgacgccagggcgcgccatcagcaagctgcatgtgttgcgtcggctgcagactatctgtgacttcttccaggtggacaagatcgcctttgaccgttggcgcattgaagacatgcggcagttgatgagcgagtacgacatcacac < 2:312819‑M1/1‑1 (MQ=255)ccATCGTGCCGCAGAGACTCCACCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGccc > 2:1160034/1‑150 (MQ=255) cATCGTGCCGCAGAGACTCCACCGCCTCAGCCGGCAGAGACTCATAAAACAACTCCGCCGCGCCACCCTCTGCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCt > 1:1008371/1‑150 (MQ=255) gaaacgacgccagggcgcgccatcagcaagctgcatgtgttgcgtcggctgcagactatctgtgacttcttccaggtggacaagatcgcctttgaccgttggcgcattgaagacatgcggcagttgatgagcgagtacgacatcacaCTg < 1:1447353‑M1/3‑1 (MQ=255) aaacgacgccagggcgcgccatcagcaagctgcatgtgttgcgtcggctgcagactatctgtgacttcttccaggtggacaagatcgcctttgaccgttggcgcattgaagacatgcggcagttgatgagcgagtacgacatcacaCTGc > 2:1447353‑M1/147‑150 (MQ=255) ccGCAGAGACTCCACCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGaa < 1:1230037/150‑1 (MQ=255) agggcgcgccatcagcaagctgcatgtgttgcgtcggctgcagactatctgtgacttcttccaggtggacaagatcgcctttgaccgttggcgcattgaagacatgcggcagttgatgagcgagtacgacatcacaCTGCCCGAACTCaa < 2:892011‑M1/14‑1 (MQ=255) aCTCCACCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGa > 2:1702133/1‑150 (MQ=255) aCTCCACCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGa > 1:517247/1‑150 (MQ=255) cTCCACCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCATTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAg < 1:1756565/150‑1 (MQ=255) tCCACCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCaa > 2:186906/1‑145 (MQ=255) tCCACCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCaa < 1:186906/145‑1 (MQ=255) cccGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCa < 2:1008371/149‑1 (MQ=255) aCCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCa > 2:1707215/1‑150 (MQ=255) ccGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAg > 1:22322/1‑150 (MQ=255) cTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGcgc > 1:1850688/1‑142 (MQ=255) cTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTc < 2:1850688/144‑1 (MQ=255) tCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGGCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAgt < 2:73967/150‑1 (MQ=255) 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catcatCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACt < 1:960458/150‑1 (MQ=255) tcGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCtc > 2:626384/1‑150 (MQ=255) tcGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCtc < 2:517247/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGTGCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACCCGTCTACCGCCGGTCCCATATCCTTGAAGCACTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTTATGTCGTACTCGCtcagc < 2:335277/150‑3 (MQ=255) aaaaaCTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCtcatc > 2:1490709/1‑150 (MQ=255) 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< 1:662200/150‑1 (MQ=255) ccACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCt < 1:311667/150‑1 (MQ=255) cACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTc > 1:231934/1‑121 (MQ=255) cACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTc < 2:231934/121‑1 (MQ=255) cACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCtt < 2:285379/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCaa < 2:1917575/150‑1 (MQ=255) 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gCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTg < 2:831047/121‑1 (MQ=255) gCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTg > 1:831047/1‑121 (MQ=255) cccATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCGCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGc > 1:1527473/1‑150 (MQ=255) ccATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGc < 1:1904755/103‑1 (MQ=255) ccATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGc > 2:1904755/1‑103 (MQ=255) ccATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAGCGGAAGACAGATAGTCTGCAGCCGACGCa > 1:1457650/1‑150 (MQ=255) cATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCaa < 1:1781747/150‑1 (MQ=255) atatCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATc < 1:1565878/105‑1 (MQ=255) atatCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATc > 2:1565878/1‑105 (MQ=255) cTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATg < 2:1345730/150‑1 (MQ=255) ttGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACg > 1:1085868/1‑86 (MQ=255) ttGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACg < 2:1085868/86‑1 (MQ=255) ttGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGc > 2:747770/1‑150 (MQ=255) atcacaCTGCCTGAGCTCGTTGAGTTCGGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCAcc > 1:1469813‑M1/7‑106 (MQ=255) atcacaCTGCCTGAGCTCGTTGAGTTCGGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCAcc < 2:1469813‑M1/100‑1 (MQ=255) cccTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCa > 2:702879/1‑127 (MQ=255) cccTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCa < 1:702879/127‑1 (MQ=255) CTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACAt < 2:472797‑M1/140‑1 (MQ=255) CTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACAt > 1:472797‑M1/1‑140 (MQ=255) | CCATCGTGCCGCAGAGACTCCACCGCCTCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGC > NC_002947/4401585‑4401875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |