New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4551237 | 72 (0.990) | 7 (0.100) | 7/234 | NT | 8.9% | coding (562/1275 nt) | pydA | NADP‑dependent dihydropyrimidine dehydrogenase subunit PreA |
? | NC_002947 | = 4551255 | 76 (1.100) | coding (580/1275 nt) | pydA | NADP‑dependent dihydropyrimidine dehydrogenase subunit PreA |
CGCACGGTATGCCGGAGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGC > NC_002947/4551088‑4551384 | cGCACGGTATGCCGGAGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGAGCTACATACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCC > 1:336269‑M1/1‑150 (MQ=255) tATGCCGGAGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCccgcgccgc < 1:1316865/150‑1 (MQ=255) gctcgGCATGGGGGAGGCCGTCGGCCAGGTGCCAGCACGTGTGGACATGCTCACCGCCTGATACAAGAAACCCTGCGCGCTGCGGGTGATCTTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAgg < 2:1858948/147‑1 (MQ=255) ggCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGgg > 1:1502608‑M2/1‑148 (MQ=255) aTGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCcgcctcgatgcgcggcgcgggcc < 2:204578‑M1/150‑24 (MQ=255) ggcggcCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGc < 1:712387/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCgtgt < 1:1113165/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCgtgt < 1:220781/150‑1 (MQ=255) cGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTc > 2:435506/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTc > 1:1450458/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGGGTc > 1:1639926/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGt < 1:1527977/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGa > 1:864367/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATc < 1:545618/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCaa < 2:222289/150‑1 (MQ=255) ttGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTCCTGCTCTCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAac < 1:1666397/149‑1 (MQ=255) gTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCCac > 2:821948/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAac < 1:1031619/150‑1 (MQ=255) 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ccGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACAcc > 2:1179294/1‑150 (MQ=255) ccGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACAcc < 2:1031864/150‑1 (MQ=255) cGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCa < 1:1746850/150‑1 (MQ=255) ggAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCcgcctcgatgcgcggcgcgggccgactgg > 2:481095‑M1/1‑101 (MQ=255) ggAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCcgcctcgatgcgcggcgcgggccgactgg < 1:481095‑M1/130‑30 (MQ=255) aaTATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCcgcctcgatgcgcggcgcgg < 1:680821‑M1/119‑21 (MQ=255) aaTATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCcgcctcgatgcgcggcgcgg > 2:680821‑M1/1‑99 (MQ=255) aaaTGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGcc < 2:1288424/119‑1 (MQ=255) aaaTGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGcc > 1:1288424/1‑119 (MQ=255) gTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGc < 1:1218842/150‑1 (MQ=255) tCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCC‑CGCCTCGATG‑CGCGGCGcgggccgactggcggatatcggt < 1:166713‑M2/124‑24 (MQ=255) tCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCC‑CGCCTCG‑ATGCGCGGCGcgggccgactggcggatatcggt > 2:166713‑M2/1‑101 (MQ=255) ccGCTGTTGCAAGACTTACTGCGCGCTTCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGa < 2:864367/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGa < 2:1450458/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGAcc > 2:1071182/1‑150 (MQ=255) ggCAAGACGTACTGCCCCCTGCCAGAGATCATGCATCTTACTCTTTTCTTTACCTATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGAc < 2:1476068/149‑1 (MQ=255) aCGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCAtg < 1:1675130/150‑1 (MQ=255) aCTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGAt < 2:584921/89‑1 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ccGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTc < 2:1493991/150‑1 (MQ=255) cGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCg > 2:915495/1‑150 (MQ=255) ccAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatattcc > 2:481095‑M2/1‑29 (MQ=255) ccAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatattcc < 1:481095‑M2/130‑102 (MQ=255) cAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCa < 1:377318/150‑1 (MQ=255) cAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCa < 2:1879820/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGt < 1:1690682/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGt > 1:430281/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatattccggcacctggccgacggccgcccccat < 2:204578‑M2/150‑128 (MQ=255) gCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTcc > 2:569117/1‑60 (MQ=255) gCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTcc < 1:569117/60‑1 (MQ=255) gCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAg > 1:107122/1‑150 (MQ=255) ccgcgccgcgCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatatt < 1:680821‑M2/119‑100 (MQ=255) ccgcgccgcgCAT‑CGAGGCGgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatatt > 2:680821‑M2/1‑20 (MQ=255) cccgcctcgatgcgcggcgcgggccgactggcggatatcggtgatgttcggcgtaagcttcacgatcaccggcagcgcgcagtacgtcttgcaccagcgggtgaccatttccacatattccggcacctggccgacggccgcccccatgcc > 1:1502608‑M1/1‑2 (MQ=255) | CGCACGGTATGCCGGAGCGCGGCATGGGGGCGGCCGTCGGCCAGGTGCCGGAATATGTGGAAATGGTCACCCGCTGGTGCAAGACGTACTGCGCGCTGCCGGTGATCGTGAAGCTTACGCCGAACATCACCGATATCCGCCAGTCGGCCCGCGCCGCGCAT‑CGAGGCGGGGCCGATGCCGTGTCGTTGATCAACACCATCAACTCCATCACCAGCGTCGACCTGGACCGCATGGTGGCCCACCCGATCGTCGGAGACCAGAGCACCCATGGCGGTTACTGCGGTTCGGCAGTGAAGC > NC_002947/4551088‑4551384 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |