| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4832376 = | 63 (0.860) | 5 (0.070) | 5/236 | NT | 8.3% | coding (860/1014 nt) | pvdY | hydroxyproline acetylase |
| ? | NC_002947 | 4832395 = | 51 (0.730) | coding (841/1014 nt) | pvdY | hydroxyproline acetylase | |||||
CAGCTTGCAACGATCGAAAAACCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTAGTCATCGGCCGGGTAGAAGGGGGCA > NC_002947/4832228‑4832522 | tgggccaaggaggaccgcattgcccccttctacccggccgatgactacgaccgtggtatccatatgctggtgggagaggagagccaccgagggccgcacaaggtggccagctggctatcggcgttggtgcactaccttttcatggatgat > 2:966329‑M1/149‑149 (MQ=255) aGCTTGCAACGATCGAAAAACCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCaccacc > 2:247863/1‑150 (MQ=255) cAACGATCGAAAAACCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTgg < 2:1212191/150‑1 (MQ=255) gATCGAAAAACCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTgg < 2:1727982/146‑1 (MQ=255) gATCGAAAAACCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTgg > 1:1727982/1‑146 (MQ=255) tCGAAAAACCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTgc‑gc > 1:799164/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCgg < 2:1692291/150‑1 (MQ=255) aaaaaCCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCggg > 2:1756995/1‑150 (MQ=255) aaaCCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTc < 1:1756995/150‑1 (MQ=255) aCCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAGCATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCAt > 2:689061/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATcc < 1:259254/150‑1 (MQ=255) cGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTg > 2:105763/1‑132 (MQ=255) cGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTg < 1:105763/132‑1 (MQ=255) ccccAGACTCCTCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTCCTGTAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAg < 1:119509/150‑1 (MQ=255) ccccAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAg < 1:1413975/150‑1 (MQ=255) atcatcAACGCCGCCCGCGTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGc < 1:247863/150‑1 (MQ=255) caACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCaa > 1:320598/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAAc < 2:353927/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGt < 1:733616/141‑1 (MQ=255) aCGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGt > 2:733616/1‑141 (MQ=255) ccgcTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAg > 2:538745/1‑150 (MQ=255) ccgcTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAg > 1:1559737/1‑150 (MQ=255) ttGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAg < 1:1073037/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAg < 2:682987/150‑1 (MQ=255) tgtgGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTg < 1:1766572/150‑1 (MQ=255) tgGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTg < 1:1303645/96‑1 (MQ=255) tgGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTg > 2:1303645/1‑96 (MQ=255) gcaaaGTCGAACTACTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTATCCAATCAGCTTGCCATTGATGGGGCGCGGCTCGCCCACCACCCGCTAGGTGC‑GTGGGTCATCGAGGAAAACGTAGTGCACGAACGCCGATAGCAAGCTGGcc > 2:434501/3‑150 (MQ=255) cgAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGcc < 1:169605/149‑1 (MQ=255) gAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCATGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCa > 2:1494386/1‑150 (MQ=255) gAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCa > 2:1091114/1‑150 (MQ=255) tCGAACTCCTTGTCGCAAGGGAAACATTGATCATGAATGCCGGGAATGTGCTGGCCATTGTCGGCGCGCAGCTCGGCGACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTtg < 1:434501/150‑1 (MQ=255) cGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATATTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTTATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACATtgt < 2:205556/150‑1 (MQ=255) ctaCTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTtgtg < 1:1866515/148‑1 (MQ=255) aaCTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGc < 2:799164/150‑1 (MQ=255) cTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCGCCGTTGTGcag > 2:1866515/1‑148 (MQ=255) tCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGc < 2:1799420/150‑1 (MQ=255) cTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATcc < 1:1326441/97‑1 (MQ=255) cTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATcc > 2:1326441/1‑97 (MQ=255) gCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTTTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTccatc < 1:67375/150‑5 (MQ=255) cAATGGAAACACTGGTCGTGCATGTAGCCTATCATCTTGCCTTTGTCGGCGCGCGGCGCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGCGTCATCCAGCAAAATGTCGTGCGTCAACGCCTATAACCAGCTGGCCCCCTTGGGCTTCCCTCGGttt < 2:320598/150‑3 (MQ=255) aTGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGTACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGcc < 2:1584240/140‑1 (MQ=255) aTGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGTACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGcc > 1:1584240/1‑140 (MQ=255) tGGAAGCATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGctc < 1:689061/150‑1 (MQ=255) gAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGctctc > 1:406096/1‑150 (MQ=255) aTTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGa < 2:486460/106‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGa > 1:486460/1‑106 (MQ=255) ttGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGctctcctct > 2:1526191/1‑148 (MQ=255) ttGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGctctcctct < 1:1526191/148‑1 (MQ=255) ggTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCcca < 2:1426827/150‑1 (MQ=255) gTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCa > 1:363818/1‑92 (MQ=255) gTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCa < 2:363818/92‑1 (MQ=255) gTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTg > 1:1306925/1‑112 (MQ=255) gTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTg < 2:1306925/112‑1 (MQ=255) gTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCccac > 2:1883956/1‑150 (MQ=255) aTGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCata > 1:1551126/1‑150 (MQ=255) ccAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCATGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCAGCGTGTGCGGCCCGCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATa < 1:1494386/150‑1 (MQ=255) ggctatcggcgttggtgcactaccttttcctggatgACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGaaa > 2:678851‑M1/37‑66 (MQ=255) ggctatcggcgttggtgcactaccttttcctggatgACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGaaa < 1:678851‑M1/30‑1 (MQ=255) tcTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGTCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGt > 2:1672823/1‑150 (MQ=255) gCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTa < 2:1559737/150‑1 (MQ=255) gCCATTGTCCGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCAGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTa < 1:784826/150‑1 (MQ=255) gtgcactaccttttcctggatgACCCGCGCACCCA‑GCGGGTCATCCAGGCAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCCCCCACCAGCATCTGGATATCACGGTCGTAGTCATc < 2:1421334‑M1/128‑1 (MQ=255) gTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTAGTCATc < 2:1551126/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGctctcc > 1:504228/1‑111 (MQ=255) tCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGctctcc < 2:504228/111‑1 (MQ=255) cGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTAGTCATCgg < 1:1091114/150‑1 (MQ=255) cactaccttttcctggatgACCCGC‑GCACCCAGCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGc > 2:1012420‑M1/20‑91 (MQ=255) cactaccttttcctggatgACCCGC‑GCACCCAGCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGc < 1:1012420‑M1/72‑1 (MQ=255) gcgcgcGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTAGTCATCGGcc > 1:674616/1‑150 (MQ=255) caccacCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTa < 1:832258/126‑1 (MQ=255) caccacCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTa > 2:832258/1‑126 (MQ=255) accaccCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTAGTCATCGGCCGGGTAGAAGGGGGCa > 2:1571539/1‑150 (MQ=255) | CAGCTTGCAACGATCGAAAAACCGCTCCCGCCCCAGAATCATCAACGCCGCCCGCTTGTGTGGAAAGTCGAACTCCTTGTCGCAATGGAAACATTGGTCGTGCATGTAGCCAATCATCTTGCCATTGTCGGCGCGCGGCTCGGCCACCACCCGCTGGGTGC‑GCGGGTCATCCAGGAAAAGGTAGTGCACCAACGCCGATAGCCAGCTGGCCACCTTGTGCGGCCCTCGGTGGCTCTCCTCTCCCACCAGCATATGGATACCACGGTCGTAGTCATCGGCCGGGTAGAAGGGGGCA > NC_002947/4832228‑4832522 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |