New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4957617 | 80 (1.100) | 9 (0.140) | 8/218 | NT | 10.0% | intergenic (‑55/+108) | fliH/fliG | flagellar assembly protein FliH/flagellar motor switch protein |
? | NC_002947 | = 4957677 | 92 (1.440) | intergenic (‑115/+48) | fliH/fliG | flagellar assembly protein FliH/flagellar motor switch protein |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGCACGATC > NC_002947/4957471‑4957764 | gAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAt < 2:531941/150‑1 (MQ=255) gAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAt > 2:303666/1‑150 (MQ=255) gAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAt > 2:1909848/1‑150 (MQ=255) aGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGc > 1:1873406/1‑150 (MQ=255) ttGGCAGCGTCCACACATCCACGCCATCGAGGTGGCTGGCACGGATCGGGTTGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGCATGCGTc > 1:42565/1‑150 (MQ=255) aGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCAc > 2:1130627/1‑132 (MQ=255) gtacacacatccACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTtacccgcgaaggcgtcggtcctgg < 2:1739283‑M1/147‑25 (MQ=255) acacaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAAc > 2:1315814/1‑150 (MQ=255) acacaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAAc > 1:213186/1‑150 (MQ=255) aTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCg < 1:1315814/150‑1 (MQ=255) aCGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTg > 1:637659/1‑150 (MQ=255) aCGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCCCAGAGCATGTTCGGCCGACACCATCACCCGAGAGCGCAAGCGCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTg > 1:1399540/1‑150 (MQ=255) cTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAgg > 1:1112392/1‑150 (MQ=255) cTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAgg > 1:507436/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGa > 1:1176944/1‑150 (MQ=255) aGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCg > 2:473146/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGAc < 1:303666/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACg > 2:1254122/1‑150 (MQ=255) cgGGCACGGAGCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTGAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCTATTGCGAGGACCGGCGCCt < 2:169434/150‑1 (MQ=255) cACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTcgc > 2:1816985/1‑150 (MQ=255) cACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTcgc < 2:333179/150‑1 (MQ=255) cGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCgg < 2:1103150/150‑1 (MQ=255) ggATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCggg > 2:770374/1‑150 (MQ=255) aTCAGGTCGCTGGAGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCAc > 2:792261/1‑93 (MQ=255) aTCAGGTCGCTGGAGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCAc < 1:792261/93‑1 (MQ=255) gTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacc < 1:816262‑M2/149‑5 (MQ=255) gTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacc > 2:816262‑M2/1‑145 (MQ=255) cgatctggtggtgttcttTGTTTGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCNGCGACANCCTCGATTGCCANGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacccgc > 1:1555203‑M2/7‑143 (MQ=255) cGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacccgc > 1:780492‑M2/1‑143 (MQ=255) tGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacccgctcc < 2:656118‑M2/150‑11 (MQ=255) gtggtgTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacccgctagatcg < 2:1555203‑M2/150‑15 (MQ=255) tggtgTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGt < 2:110192/90‑1 (MQ=255) tggtgTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGt > 1:110192/1‑90 (MQ=255) gtgtTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaaaa > 1:885789/1‑150 (MQ=255) ttCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAggc < 1:1116914/150‑1 (MQ=255) ttCTTTGGTGGGCAGGCTGTCATGTTCTCCAACCATGTTCGGCCGACACGGGCCCTTGTACGAGCGTGGTtacccgcgaaggcgtcgttcctggcaaccgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgggtgaacccgctcctacaagggac < 2:801382‑M1/150‑81 (MQ=255) tCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCTCCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAggcg < 1:525842/150‑1 (MQ=255) tttGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgc < 1:1698581‑M1/122‑56 (MQ=255) tttGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCAGGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGAtt < 2:168349/102‑1 (MQ=255) tttGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCAGGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGAtt > 1:168349/1‑102 (MQ=255) gggCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgg > 2:1405834‑M1/1‑61 (MQ=255) gggCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgg < 1:1405834‑M1/118‑58 (MQ=255) cATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTAt < 2:1177093/150‑1 (MQ=255) cATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTAt > 2:1544219/1‑150 (MQ=255) cATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTAt < 2:1176944/150‑1 (MQ=255) cATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTAt < 2:1782470/150‑1 (MQ=255) aTGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATg < 1:1171026/150‑1 (MQ=255) tGCTTTCATGTTCTCAACCCATGTTCGGCCGGCACGGTCCCTTGTAGGCGCGGGTTCTCCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATgg < 1:1629580/150‑1 (MQ=255) gCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATggg < 1:1713896/150‑1 (MQ=255) tGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGAt > 1:660775/1‑150 (MQ=255) cATGTTCTCAAACTATGTTCGGCCGACACGGTCACTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCACCGACTACCTCTATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGTCGGCGTCGGCTATGGGATcgc < 2:238818/150‑1 (MQ=38) cATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATcgc < 2:507436/150‑1 (MQ=255) aTGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATcgcg > 2:1811084/1‑150 (MQ=255) tGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGa > 1:356010/1‑150 (MQ=255) gTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGaa < 2:1350519/150‑1 (MQ=255) tcAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgg > 2:429646‑M1/1‑43 (MQ=255) tcAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgg < 1:429646‑M1/100‑58 (MQ=255) tcAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATAcc > 1:756472/1‑150 (MQ=255) cAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCt < 1:1909848/150‑1 (MQ=255) aaaCCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGGATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCtt > 1:277325/1‑150 (MQ=255) aTGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATc < 1:1544219/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCAt < 2:1112392/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCGACGCGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCAtt > 1:1664589/1‑150 (MQ=255) ggCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTcc < 2:1251128/150‑1 (MQ=255) gCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCt < 1:656118/150‑1 (MQ=255) ccGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAATGCGGCGGCAGCGACAACCTCGGTTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAAAAGACGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTc > 2:235106/1‑150 (MQ=255) cGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTTCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTcc > 2:662783/1‑149 (MQ=255) cGACACGGCCCCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCg < 2:463153/150‑1 (MQ=255) gACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCCACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCgg > 2:271126/1‑150 (MQ=255) ggTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAggcggc > 1:1116095/1‑104 (MQ=255) ggTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATg > 1:472896/1‑114 (MQ=255) ggTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCCCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAggcggc < 2:1116095/104‑1 (MQ=255) gTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGGTTGCCAGGAACGACGCCTTCGCGGGTAaccacgctcgtacaagggcccgtgtcggccgaacatggttggagaacatgacagcctgcccaccaaagaa < 2:801382‑M2/150‑71 (MQ=255) gTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCtt > 1:1233091/1‑129 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGgc > 2:1062654/1‑142 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGgc < 1:1062654/142‑1 (MQ=255) ccTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTgc < 1:300029/150‑1 (MQ=255) cTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacccgc > 2:224753‑M2/1‑76 (MQ=255) cTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacccgc < 1:224753‑M2/83‑8 (MQ=255) ttGTAGGAGCGGGTTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgggtgaacccgctcctacaa < 2:631628‑M1/90‑76 (MQ=255) ttGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacccgctcctacaagggaccgtgtcggccgaacatggtttgagaacatgacagcatgcccaccaaagaacacca < 1:877728‑M2/150‑76 (MQ=255) ttGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacccgctcctacaa > 1:631628‑M2/1‑75 (MQ=255) ttGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAaacccgctcctacaa < 2:631628‑M2/90‑16 (MQ=255) ttGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTgctg > 2:367195/1‑148 (MQ=255) cgatctagcgggtTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgggtgaacccgctcctacaagggaccgtgtcggccgaacatggtttgagaacatgacagcatgcccaccaaagaacaccac < 2:1555203‑M1/144‑137 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGccgccg > 1:644860/1‑150 (MQ=255) aGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGa < 1:1200669/150‑1 (MQ=255) aGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGAGTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGa < 1:1254122/150‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgggtgaacccgctcctacaagggaccgtgtcggccgaacatggtttgagaacatgacagcatgcccaccaaagaacaccacccca < 2:656118‑M1/150‑141 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGc > 2:1294826/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGc > 1:1069303/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgggtgaacccgctcctacaagggaccgtgtcggccgaacatggtttgagaacatgacagcatgcccaccaaagaacaccaccccagcg > 1:780492‑M1/1‑7 (MQ=255) gCGGGTTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgggtgaacccgctcctacaag > 2:224753‑M1/1‑7 (MQ=255) gCGGGTTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgggtgaacccgctcctacaag < 1:224753‑M1/83‑77 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGCAc < 2:756472/150‑1 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGCAc > 1:328205/1‑148 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGCAc < 2:328205/148‑1 (MQ=255) ggTTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgggtgaacccgctcctacaagggaccgtgtcggccgaacatggtttgagaacatgacagcatgcccaccaaagaacaccaccccagcgac < 1:816262‑M1/149‑146 (MQ=255) ggTTtacccgcgaaggcgtcggtcctggcaatcgaggttgtcgctgccgacgcattcgcgggtgaacccgctcctacaagggaccgtgtcggccgaacatggtttgagaacatgacagcatgcccaccaaagaacaccaccccagcgac > 2:816262‑M1/1‑4 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGCACGAtc > 1:1168040/1‑150 (MQ=255) | TCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAGCACGATC > NC_002947/4957471‑4957764 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |