New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5426045 = | 60 (0.820) | 4 (0.060) | 4/236 | NT | 6.4% | coding (533/1239 nt) | PP_4765 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5426081 = | 59 (0.850) | coding (569/1239 nt) | PP_4765 | hypothetical protein |
CGACAACGGGGTAGTTATCCACACCCGCCATCGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCTGAAGAACATCGCCCTCA > NC_002947/5425896‑5426194 | cgACAACGGGGTAGTTATCCACACCCGCCATCGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTcgg < 1:1939345/150‑1 (MQ=255) ctcgcccttgcgcggtgcgctgcccgggacgctgagggcgatgttcttcagcggtgcgcccgcgaacttgtccttgagtagcgcgctccagcccgctacttcaaaaccgcagttgctcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGTTc < 2:1841136‑M1/4‑1 (MQ=255) ggggTAGTTATCCACACCCGCCATCGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATGGCTTATCCACAGGGGGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGAc > 1:600103/1‑150 (MQ=255) acacCCGCCATCGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCCGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAAc > 1:421177/1‑150 (MQ=255) acacCCGCCATCGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAAc > 2:835306/1‑150 (MQ=255) ccGCCATCGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCgct > 1:1171418/1‑150 (MQ=255) cGCCATCGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCCCAGCGCGCGC‑CCAGGTGGAAAGGGGCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGTGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCgctg < 1:1893098/150‑1 (MQ=255) gCCATCGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCgctgc < 1:587426/150‑1 (MQ=255) gacgctgagggcgatgttcttcagcggtgcgcccgcgaacttgtccttgagtagcgcgctccagcccgctacttcaaaaccgcagttgctcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGTTCTg < 1:1037634‑M1/6‑1 (MQ=255) gacgctgagggcgatgttcttcagcggtgcgcccgcgaacttgtccttgagtagcgcgctccagcccgctacttcaaaaccgcagttgctcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGTTCTg > 2:1037634‑M1/120‑125 (MQ=255) cGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCa < 2:1327292/150‑1 (MQ=255) gCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCtg > 1:1422482/1‑150 (MQ=255) gCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCtg > 1:1812754/1‑150 (MQ=255) cTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCtgt < 2:1171418/150‑1 (MQ=255) cTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCtgt > 2:1015555/1‑150 (MQ=255) tGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCtgtg > 2:308856/1‑150 (MQ=255) gggAACACCGATGTCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTGAGGT‑GAAAACCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGACTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCtgtg < 2:600103/149‑1 (MQ=255) cGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTgg < 2:44149/128‑1 (MQ=255) cGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTgg > 1:44149/1‑128 (MQ=255) cGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATAtctc > 2:1787733/1‑150 (MQ=255) cGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATAtctc > 1:827542/1‑150 (MQ=255) aTGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GCTCGAGGGTATGGACCAGGAATTGCCGGTTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCACCCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGc < 1:1197732/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGcc > 2:1263489/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCttt < 2:949893/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCttt < 1:1263489/150‑1 (MQ=255) ttGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTggg < 1:1656781/89‑1 (MQ=255) ttGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTggg > 2:1656781/1‑89 (MQ=255) cgcgaacttgtccttgagtagcgcgctccagcccgctacttcaaaaccgcagttgctcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGtt > 2:835206‑M1/87‑89 (MQ=255) cgcgaacttgtccttgagtagcgcgctccagcccgctacttcaaaaccgcagttgctcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGtt < 1:835206‑M1/3‑1 (MQ=255) cgcgaacttgtccttgagtagcgcgctccagcccgctacttcaaaaccgcagttgctcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGTTc > 1:303869‑M1/87‑90 (MQ=255) cgcgaacttgtccttgagtagcgcgctccagcccgctacttcaaaaccgcagttgctcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGTTc < 2:303869‑M1/4‑1 (MQ=255) cTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACt < 1:1436163/150‑1 (MQ=255) tATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGc < 1:1047561/150‑1 (MQ=255) cttgagtagcgcgctccagcccgctacttcaaaaccgcagttgctcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAAc < 1:34159‑M1/36‑1 (MQ=255) cttgagtagcgcgctccagcccgctacttcaaaaccgcagttgctcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAAc > 2:34159‑M1/75‑110 (MQ=255) acaGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGttt > 2:1581978/1‑150 (MQ=255) acaGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGttt > 1:899194/1‑150 (MQ=255) acaGCGCGAGCGTCAGGT‑CAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGttt < 1:893994/150‑1 (MQ=255) cAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGc > 2:644042/1‑150 (MQ=255) ggT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTg < 1:1252132/150‑1 (MQ=255) gT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCtgt > 1:767564/1‑98 (MQ=255) gT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCtgt < 2:767564/98‑1 (MQ=255) gT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTgg > 2:877124/1‑150 (MQ=255) t‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGtttt > 2:1746011/1‑134 (MQ=255) t‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGtttt < 1:1746011/134‑1 (MQ=255) t‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGa < 1:1671919/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAgcgcgc > 1:90581/1‑150 (MQ=255) cTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGa > 2:1440882/1‑113 (MQ=255) cTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGa < 1:1440882/113‑1 (MQ=255) cTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCt > 2:763875/1‑150 (MQ=255) tCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTa > 1:1805579/1‑150 (MQ=255) cGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCaa < 1:948014/150‑1 (MQ=255) gtggtgCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAg < 2:487239/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGAc < 2:1422482/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGCGCTGGGGGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGGAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGGAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGAc < 2:1291868/150‑1 (MQ=255) tgCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACa > 2:1147031/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCttt > 2:1497771/1‑90 (MQ=255) ggCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCttt < 1:1497771/90‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTc > 1:1178755/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGCGCTCCAGCCCGCTACttcaa > 1:255149/1‑137 (MQ=255) gcgcTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGCGCTCCAGCCCGCTACttcaa < 2:255149/141‑5 (MQ=255) tcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCa > 2:1706036‑M1/31‑62 (MQ=255) tcggctgcaaaggcgagatatccacagcccGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCa < 1:1706036‑M1/32‑1 (MQ=255) tGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCgg < 2:1178755/150‑1 (MQ=255) gtgCGAGATGGGCGCGCCCGAGTTCTAACGGCAGCTGGTAACCGTTGCTGGCAGAACGGGGTGTGGATATCTCGCCGTTGCAGCCGAGCAACTGCAGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCCCCCTACCCAAGGACAAGTTCGCGGGCCCAc < 2:421177/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGc < 1:1581978/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCt < 1:271519/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGaa < 2:1608331/98‑1 (MQ=255) gCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGaa > 1:1608331/1‑98 (MQ=255) cTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCTgaa < 2:1577208/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCTgaa < 1:731547/150‑1 (MQ=255) cgcgcCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCTGAAGAACa > 2:623945/1‑150 (MQ=255) cgcCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCTGAAGAACATc < 1:1015555/150‑1 (MQ=255) gcCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCTGAAGAACATCg > 1:1877096/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCTGAAGAACATCGcc < 1:623945/150‑1 (MQ=255) tGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGa < 2:710839/115‑1 (MQ=255) tGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGa > 1:710839/1‑115 (MQ=255) GTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCTGAAGAACATCGCCCTCa > 2:1805579‑M1/1‑150 (MQ=255) | CGACAACGGGGTAGTTATCCACACCCGCCATCGCTGGTTGGGCTGGAACACCGATGGCAGCTTGCGCATTGCTTATCCACAGGGCGAGCGTCAGGT‑GAAAGCCTCGGTCGTGGTGCTGGCGCTGGGTGGTGCCAGCTGGGCGCGCCTGGGTTCTGACGGCAGCTGGCAACCGCTGCTGGCAGAACGGGCTGTGGATATCTCGCCTTTGCAGCCGAGCAACTGCGGTTTTGAAGTAGCGGGCTGGAGCGCGCTACTCAAGGACAAGTTCGCGGGCGCACCGCTGAAGAACATCGCCCTCA > NC_002947/5425896‑5426194 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |