| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GGCCAGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCC > NC_002947/5652615‑5652912 | ggccAGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCTGTTGGGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTacac < 1:375511/150‑1 (MQ=255)aaagcgcttttggccgtgacggccctggcgacactggcaggatgctcactgctgcagccggcgcaaccggccccggcagacaactggacccgttgggtctgcgacacccaggctgaggtgctttggcgcttcgccgatgcgcaacgtgAc < 2:1614060‑M1/2‑1 (MQ=255) gccAGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACAcc > 1:294228/1‑150 (MQ=255) aagcgcttttggccgtgacggccctggcgacactggcaggatgctcactgctgcagccggcgcaaccggccccggcagacaactggacccgttgggtctgcgacacccaggctgaggtgctttggcgcttcgccgatgcgcaacgtgAcc < 2:1292271‑M1/3‑1 (MQ=255) cAGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCGACGTGGTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTg < 1:1507253/150‑1 (MQ=255) cAGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTg < 1:1077364/150‑1 (MQ=255) aGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCCCCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTgg < 1:200062/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTcgcc < 1:888270/150‑1 (MQ=255) ggTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTacac > 1:1898797/1‑140 (MQ=255) ggTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTacac < 2:1898797/140‑1 (MQ=255) gTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTcgccgc > 1:1092717/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTcgc > 2:1708949/1‑142 (MQ=255) gCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACCCCGTGTCGCCGCCGCCAAg < 1:1425392/150‑1 (MQ=255) 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> 2:1718040/1‑150 (MQ=255) gccccggcagacaactggacccgttgggtctgcgacacccaggctgaggtgctttggcgcttcgccgatgcgcaacgtgACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTgg < 1:608554‑M1/36‑1 (MQ=255) tcGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCa < 2:294228/150‑1 (MQ=255) cGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTATAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTAAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAg > 1:1568012/1‑150 (MQ=255) gCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGcc < 1:1168803/137‑1 (MQ=255) gCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGcc > 2:1168803/1‑137 (MQ=255) 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aGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGtt < 2:34719/150‑1 (MQ=255) ggCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTg > 2:1169603/1‑150 (MQ=255) aCCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAAc > 1:1393214/1‑57 (MQ=255) aCCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTgcgc > 2:652916/1‑150 (MQ=255) cccGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCACCGGGTCAAGTGGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGcc < 1:1718040/150‑1 (MQ=255) cccGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGcc < 2:1581621/150‑1 (MQ=255) ccGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCAc > 2:315836/1‑91 (MQ=255) ccGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCAc < 1:315836/91‑1 (MQ=255) gCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCCCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCt > 1:702159/1‑85 (MQ=255) gCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCCCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCt < 2:702159/85‑1 (MQ=255) cTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAAc > 1:49980/1‑107 (MQ=255) cTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGcagcag > 1:874431/1‑150 (MQ=255) ttGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGATGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGt > 1:1547833/1‑150 (MQ=255) gAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGa > 2:1189213/1‑150 (MQ=255) gAGCCGGTACACCTGGTCACCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGa < 2:1187782/150‑1 (MQ=255) ggTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATc > 1:270742/1‑150 (MQ=255) gTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCg < 2:1656595/88‑1 (MQ=255) gTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCg > 1:1656595/1‑88 (MQ=255) gTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATcc > 1:1482180/1‑150 (MQ=255) tACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCt > 1:1614060/1‑150 (MQ=255) ACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGa > 1:1214379‑M1/1‑88 (MQ=255) ACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGcc > 2:1881779‑M1/1‑150 (MQ=255) | GGCCAGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGTACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCC > NC_002947/5652615‑5652912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |