New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 5718270 | 89 (1.280) | coding (913/1917 nt) | PP_5020 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
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cTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCctgctg < 2:1002860/150‑1 (MQ=255) cTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACGGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCctgctg < 1:1306929/150‑1 (MQ=255) cAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGgcc < 1:256708/150‑1 (MQ=255) cAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGgcc < 1:450214/150‑1 (MQ=255) aaCGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTg < 1:1722309/138‑1 (MQ=255) 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aCTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAAcgccgc > 2:1864825/1‑130 (MQ=255) aCTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAAcgccgc < 1:1864825/130‑1 (MQ=255) aCTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGACGAACTGGGCCAATTGCa < 2:816397/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTgggccagtgccagcacggtggcaaccgtgagcagtgttttggcctgcgcggcagcggcatcgcgcacctcggtttgcgaagcggtcatcatctggctggcctgcagcagtaccgtgccttgttca < 1:123987‑M2/150‑126 (MQ=255) cTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTgggccagtgccagcacggtggcaaccgtgagcagtgttttggcctgcgcggcagc < 2:1450780‑M2/80‑56 (MQ=255) cTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTgggccagtgccagcacggtggcaaccgtgagcagtgttttggcctgcgcggcagc > 1:1450780‑M2/1‑25 (MQ=255) cTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCCGGGCCACTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGACGAACTGGGCCAATTGCAg < 1:1095270/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGACGAACTGGGCCAATTGCatg > 1:1627709/1‑148 (MQ=255) tGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGACGAACTGGGCCAATTGCAgg < 1:230045/150‑1 (MQ=255) ggCCCGTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCCGCGTATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGACGAACTGGGCCAATTGCAGGc < 1:100340/150‑1 (MQ=255) gCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGACGAACTGGGCCAATTGCAGGcc > 1:856712/1‑150 (MQ=255) cccTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGACGCACTGGGCCAATTGCAGGccc > 1:329312/1‑149 (MQ=255) cccTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGACGAACTGGGCCAATTGCAGGCCa < 1:1280214/150‑1 (MQ=255) ccaggcggccagcaggccaagggccagtgccagcacggtggcaaccgtgagcagtgttttggcctgcgcggcagcggcatcgcgcacctcggtttgcgaagcggtcatcatctggctggcctgcagcagtaccgtgccttgttcaaccat < 2:230045‑M1/150‑149 (MQ=255) cTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTa < 2:1911870/114‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTa > 1:1911870/1‑114 (MQ=255) | AGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCC‑AAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAGAGCCTGCAGGTACAACGCCGCGACGAACTGGGCCAATTGCAGGCCA > NC_002947/5718106‑5718399 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |