| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 5745199 | 80 (1.100) | 4 (0.060) | 4/234 | NT | 5.2% | coding (722/2451 nt) | glgP | glycogen phosphorylase |
| ? | NC_002947 | = 5745229 | 71 (1.030) | coding (692/2451 nt) | glgP | glycogen phosphorylase | |||||
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gAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGcc > 1:333418/1‑150 (MQ=255) gcgcAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGtcaacaccctgcgcct > 2:194723‑M1/1‑134 (MQ=255) gcgcAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAg > 1:1092673/1‑150 (MQ=255) gcAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGgc < 2:1736303/150‑1 (MQ=255) aGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCACGCGCCACAGgcgc > 2:440545/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCCCCACAGGCGCAg > 2:730394/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAgggg > 2:439736/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGgtg > 1:1072468/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGCCTCGGTAATGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGgtg > 1:321598/1‑150 (MQ=255) ggccggccTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGgtgt < 2:1092673/150‑1 (MQ=255) 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cAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTg < 2:1455987/126‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTg > 1:1455987/1‑126 (MQ=255) ggTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCa > 1:1540794/1‑150 (MQ=255) tGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCAcc < 1:1478381/150‑1 (MQ=255) gCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCg > 1:276047/1‑150 (MQ=255) cAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAAccgccc > 1:190510/1‑92 (MQ=255) cAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAAccgccc < 2:190510/92‑1 (MQ=255) ctctTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGAcgctggaagagctgcacctggagcgcttcaacgccggtgaccatttgggggctgtggctgaagtggcgcgtgccgagagcatttcgcgtgtgctttaccccgccgacag < 1:194723‑M2/150‑110 (MQ=255) ctctTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCCACTTGCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTc < 2:551909/150‑1 (MQ=255) tctTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTCg < 2:1228648/150‑1 (MQ=255) ctTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTCGa > 1:1597535/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGAcgctggaagagctgcacctggagcgcttcaacgccggtgaccatttgggggctgtggctgaagtggcgcgtgccgagagcatttcgcgtgtgctttaccc > 1:1133039‑M2/1‑38 (MQ=255) ttCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGAcgctggaagagctgcacctggagcgcttcaacgccggtgaccatttgggggctgtggctgaagtggcgcgtgccgagagcatttcgcgtgtgctttaccc < 2:1133039‑M2/138‑101 (MQ=255) ttCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCgtg > 1:228150/1‑70 (MQ=255) ttCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCgtg < 2:228150/70‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTCGaca < 1:1128587/150‑1 (MQ=255) cAGCGtcaacaccctgcgcctgtggcgcgcgcgggcgctggaagagctgcacctggagcgcttcaacgccggtgaccatttgggggctgtggctgaagtggcgcgtgccgagagcatttcgcgtgtgctttaccccgccgacagtaccga < 1:110167‑M1/150‑146 (MQ=255) cAGCGtcaacaccctgcgcctgtggcgcgcgcgggcgctggaagagctgcacctggagcgcttcaacgccggtgaccatttgggggctgtggctgaagtggcgcgtgccgagagcatttcgcgtgtgctttaccccgccgacagtaccga < 2:795831‑M1/150‑146 (MQ=255) | TCCTGGCGAAGGCGCAGTTCCTGGCCGGCCTCGGTACTGTCGGCGGGGTAAAGCACACGCGAAATGCTCTCGGCACGCG‑CCACTTCAGCCACAGCCCCCAAATGGTCACCGGCGTTGAAGCGCTCCAGGTGCAGCTCTTCCAGCGCCCGCGCGCGCCACAGGCGCAGGGTGTTGACGCTGGATCCACGCCAGCCGACTACCGGCGTGTCGTAGGCAACCGCCCGCACCGTCTCGCCCGGCCACCATACCTGGCGCTGGGTACCGCTTGCATCGTGCACCGTTTCGACACT > NC_002947/5745055‑5745344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |