New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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GGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGATGTCGCTGTCGTGCAGGCGCTC > NC_002947/5929791‑5930080 | ggCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCCGTGATGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTg > 1:43740/1‑150 (MQ=255) ggCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTg > 2:917286/1‑150 (MQ=255) ggCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTg < 1:1474451/150‑1 (MQ=255) 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gccgcACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGAt < 1:460790/136‑1 (MQ=255) gccgcACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGATGTCGCTGTCGTGCa > 2:562887/1‑150 (MQ=255) gccgcACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTAAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGAt > 2:460790/1‑136 (MQ=255) ccgcACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGATGTCGCTGTCGTGCAg < 2:311643/150‑1 (MQ=255) cgcACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGATGTCGCTGTCGTGCAgg < 1:493259/150‑1 (MQ=255) cgcACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGATGTCGCTGTCGTGCAgg < 2:1407336/150‑1 (MQ=255) cACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTg < 1:1318571/102‑1 (MQ=255) cACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTg > 2:1318571/1‑102 (MQ=255) ccgccgAATTAGCACCGTCGTCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGATGTCGCTGTCGTGCAGGCGCt < 2:206269/150‑1 (MQ=255) cgccgAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCGTGCAGGCGCTc > 2:1279258/1‑150 (MQ=255) | GGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCGGCCATCCGCCAGGGTCAGCAGCCACTCATCGCCCGAGCGACGCAATTGCTCCAGCCTCGCATTGGCCAGCAGGCCGATGTCGCTGTCGTGCAGGCGCTC > NC_002947/5929791‑5930080 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |