| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5943657 = | 101 (1.380) | 5 (0.080) | 5/204 | NT | 6.3% | intergenic (+9/+76) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
| ? | NC_002947 | 5943722 = | 67 (1.120) | intergenic (+74/+11) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CACCAGCTGTTTGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACT > NC_002947/5943508‑5943801 | ctggccagtgccaaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcc < 2:258361‑M1/1‑1 (MQ=255) tggccagtgccaaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCg < 2:1613206‑M1/2‑1 (MQ=255) ccaGCTGTTTGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCgg > 1:1762312/1‑150 (MQ=255) gCTGTTTGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCct > 2:1492323/1‑150 (MQ=255) cagtgccaaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCct < 1:988872‑M1/6‑1 (MQ=255) agtgccaaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCctc < 1:560504‑M1/7‑1 (MQ=255) tGTTTGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGCGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGGAGCGGCctct > 2:923783/1‑150 (MQ=255) tttGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTc < 1:915161/150‑1 (MQ=255) ccaaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTcg < 2:227795‑M1/11‑1 (MQ=255) caaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTcgc < 1:1636427‑M1/12‑1 (MQ=255) caaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTcgc < 1:855707‑M1/12‑1 (MQ=255) caaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTcgc > 2:516694‑M1/139‑150 (MQ=255) aggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCGC‑gg > 2:641102‑M1/137‑150 (MQ=255) cTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGc > 2:766699/1‑139 (MQ=255) cTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGc < 1:766699/139‑1 (MQ=255) cTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑ggg < 1:11375/150‑1 (MQ=255) tGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGt > 1:1830124/1‑150 (MQ=255) gcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCGC‑GGGTaa < 2:1638001‑M1/18‑1 (MQ=255) 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gagaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTcgcg > 1:1638001/1‑150 (MQ=255) agaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAg < 2:593761/93‑1 (MQ=255) agaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAg > 1:593761/1‑93 (MQ=255) gCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCACGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGAt > 1:1100933/1‑150 (MQ=255) cTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCcgc < 2:1401018/111‑1 (MQ=255) gggCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgtg < 2:1139059/150‑1 (MQ=255) 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ttGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAg > 1:1447490/1‑150 (MQ=255) tggtggTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTACACCGGCTGCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAgg > 1:1320277/1‑150 (MQ=255) ggtggtGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGt > 2:1658510/1‑150 (MQ=255) gtggtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTGCC‑GATTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACACGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGtt < 1:593992/150‑1 (MQ=255) gtggtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGACGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGtt > 2:1669700/1‑150 (MQ=255) gtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAgg > 2:1626663/1‑95 (MQ=255) gtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGGTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCg > 1:586416/1‑150 (MQ=255) gtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCg > 2:877582/1‑150 (MQ=255) tgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGa > 2:337590/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCgg < 2:300502/150‑1 (MQ=255) ggCCACGTAAGGCAGTAGCCGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCATAGCGGTGTCCGTCCACGGTTCACCGGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCgg < 1:923783/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATcg > 1:1188474/1‑129 (MQ=255) gCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATcg < 2:1188474/129‑1 (MQ=255) gCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGtt > 2:362944/1‑141 (MQ=255) gCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCCCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATGCCGCTTCCAGGTtcgggtcggg > 1:579761/1‑150 (MQ=38) gCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCAGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCggg > 2:560504/1‑150 (MQ=255) aGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCAt > 1:175835/1‑150 (MQ=255) ggTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATc > 1:258361/1‑150 (MQ=255) gTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACACGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTGGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCt > 1:1613206/1‑150 (MQ=255) tAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTg < 1:1018905/150‑1 (MQ=255) gCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGa < 1:710185/150‑1 (MQ=255) gCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGGAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGa > 1:1919241/1‑150 (MQ=255) aGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACt < 2:1762312/150‑1 (MQ=255) gCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgtg < 1:1313938/98‑1 (MQ=255) gCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgtg > 2:1313938/1‑98 (MQ=255) | CACCAGCTGTTTGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACT > NC_002947/5943508‑5943801 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |